MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017056	TA	3	6	576355	576360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017056	ATATT	2	10	576372	576381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017056	TAG	2	6	576410	576415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017056	GATCT	2	10	576439	576448	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_017056	CATT	2	8	576503	576510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_017056	CTT	2	6	576534	576539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017056	TTGT	2	8	576556	576563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017056	T	7	7	576567	576573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017056	TTA	3	9	576578	576586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017056	ACA	2	6	579391	579396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017056	TAT	2	6	579406	579411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017056	TTA	2	6	579438	579443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017056	TAT	2	6	579472	579477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017056	ATG	2	6	579522	579527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017056	AAG	2	6	579553	579558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017056	AGTT	2	8	579564	579571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017056	AAAT	2	8	579644	579651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017056	TA	3	6	579660	579665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017056	GAT	2	6	579672	579677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017056	ATT	2	6	579678	579683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017056	ATA	2	6	579715	579720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017056	AT	3	6	579791	579796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017056	AGC	2	6	579805	579810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017056	AT	3	6	579811	579816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017056	TTATT	2	10	579874	579883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017056	AACA	2	8	579887	579894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_017056	AAT	2	6	579910	579915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017056	ATG	2	6	579935	579940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017056	TA	3	6	579988	579993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017056	T	6	6	580017	580022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017056	A	6	6	580045	580050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017056	ATAC	2	8	580067	580074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_017056	T	6	6	580083	580088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017056	TA	4	8	580092	580099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017056	A	6	6	580134	580139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4037	NC_017056	TAT	3	9	580183	580191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4040	NC_017056	A	6	6	580274	580279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_017056	A	6	6	580372	580377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017056	TTTA	2	8	580380	580387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017056	AT	3	6	580403	580408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017056	ATTA	2	8	580442	580449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017056	TAG	2	6	580489	580494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017056	ATT	2	6	581463	581468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017056	TG	4	8	581500	581507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017056	TA	3	6	581526	581531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017056	TTA	2	6	581537	581542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017056	ATA	2	6	581553	581558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017056	TAA	2	6	581674	581679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017056	A	6	6	581678	581683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017056	GTG	2	6	581690	581695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017056	TAAA	2	8	581707	581714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017056	AAT	2	6	581862	581867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017056	TTTTA	2	10	582906	582915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017056	TTA	2	6	582948	582953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017056	ATT	2	6	582959	582964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017056	TAA	2	6	582966	582971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017056	ATA	2	6	583705	583710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017056	TA	3	6	583717	583722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017056	TAT	2	6	583731	583736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017056	ATT	2	6	583750	583755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017056	ATT	2	6	584214	584219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4068	NC_017056	GTA	2	6	584427	584432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4070	NC_017056	TAA	2	6	584515	584520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_017056	AAT	2	6	584565	584570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017056	TG	3	6	585349	585354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_017056	ATA	3	9	587934	587942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017056	TAT	2	6	587950	587955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017056	TGTTT	2	10	588152	588161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017056	TA	3	6	589560	589565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017056	TTA	2	6	589587	589592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_017056	TAA	2	6	589850	589855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_017056	A	6	6	594966	594971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_017056	TA	3	6	598013	598018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017056	CAA	2	6	598019	598024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017056	TAT	2	6	598076	598081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017056	ATA	2	6	599430	599435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017056	ACT	2	6	599454	599459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4104	NC_017056	ATT	2	6	599520	599525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017056	TTATA	2	10	600297	600306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017056	T	7	7	601600	601606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017056	ACA	2	6	602802	602807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017056	ATT	2	6	603109	603114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017056	TAAAT	2	10	603132	603141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017056	A	6	6	603157	603162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017056	AT	3	6	604067	604072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017056	CTT	2	6	604075	604080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4115	NC_017056	TA	3	6	604220	604225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017056	TA	3	6	604243	604248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017056	AT	3	6	604259	604264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017056	T	6	6	604274	604279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017056	ATT	2	6	604280	604285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017056	ATA	2	6	604289	604294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017056	ATT	2	6	604312	604317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017056	TTA	2	6	604430	604435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017056	AAT	2	6	604451	604456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017056	T	7	7	604487	604493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017056	A	6	6	604531	604536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017056	AGTA	2	8	605281	605288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017056	ATC	2	6	605294	605299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017056	TAT	2	6	605321	605326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017056	ATT	2	6	605368	605373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017056	T	6	6	605391	605396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017056	TTAT	2	8	605491	605498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017056	TAAA	2	8	605572	605579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017056	TGG	2	6	605616	605621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017056	TTG	2	6	605639	605644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017056	CGG	2	6	605696	605701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017056	TAA	2	6	605730	605735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_017056	AAT	2	6	605851	605856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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