MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017056	TCT	2	6	142371	142376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017056	ACTT	2	8	142415	142422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_017056	A	6	6	142426	142431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017056	T	6	6	142432	142437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017056	TA	3	6	142445	142450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017056	TCT	2	6	142456	142461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017056	AGT	2	6	142496	142501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017056	AT	3	6	142512	142517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017056	TA	3	6	142534	142539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017056	CTT	2	6	142547	142552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017056	T	7	7	142626	142632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017056	AATATT	2	12	142646	142657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017056	T	6	6	142683	142688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017056	TA	3	6	144759	144764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017056	TAT	2	6	144766	144771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017056	AT	4	8	144770	144777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017056	ATA	2	6	144795	144800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017056	A	6	6	144802	144807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017056	AT	3	6	145853	145858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017056	TAC	2	6	145869	145874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017056	CAT	2	6	145883	145888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017056	TCT	2	6	145937	145942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017056	T	6	6	145951	145956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017056	ATA	2	6	145973	145978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017056	GTC	2	6	146861	146866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017056	ACTT	2	8	148440	148447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_017056	TAAGC	2	10	148489	148498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_017056	TAAAT	2	10	148510	148519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017056	ATC	2	6	149275	149280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017056	ATA	2	6	149315	149320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017056	T	6	6	149339	149344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017056	TAT	2	6	149385	149390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017056	T	6	6	149826	149831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017056	TGAAA	2	10	149863	149872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017056	TAA	2	6	149884	149889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017056	AAT	2	6	149894	149899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017056	CAG	2	6	150332	150337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017056	ATT	2	6	150367	150372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017056	TAA	2	6	150388	150393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017056	TTAAG	2	10	150399	150408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_017056	TA	3	6	152248	152253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017056	TAT	2	6	152255	152260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017056	TTTA	2	8	152261	152268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017056	AAC	2	6	152282	152287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017056	T	6	6	152306	152311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017056	GCT	2	6	152313	152318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1051	NC_017056	ATAATT	2	12	153043	153054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_017056	T	6	6	153161	153166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017056	T	6	6	153173	153178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_017056	TAGAGA	2	12	153581	153592	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017056	A	6	6	153594	153599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017056	AGA	2	6	156215	156220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017056	TAAT	2	8	156221	156228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017056	AATA	2	8	156244	156251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017056	TAA	3	9	156293	156301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017056	TAT	2	6	156322	156327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017056	AG	3	6	156432	156437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017056	TA	4	8	156454	156461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017056	TA	3	6	156476	156481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017056	ATT	2	6	156502	156507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017056	TAA	2	6	157363	157368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017056	TAAA	2	8	157374	157381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_017056	TTA	2	6	157451	157456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_017056	TAA	2	6	159270	159275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_017056	A	6	6	159336	159341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017056	GTA	2	6	159353	159358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_017056	AGT	2	6	159893	159898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_017056	ATT	2	6	160096	160101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_017056	TATC	2	8	160396	160403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_017056	CAA	2	6	160405	160410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_017056	TA	3	6	160446	160451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017056	ATATT	2	10	160479	160488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017056	A	7	7	160544	160550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017056	TTAT	2	8	160588	160595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017056	TA	3	6	164788	164793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017056	TGT	2	6	164794	164799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017056	TTG	2	6	164812	164817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017056	AATG	2	8	164852	164859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_017056	TAA	2	6	169171	169176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017056	TAC	2	6	169217	169222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1118	NC_017056	ATA	2	6	169328	169333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017056	TAAA	2	8	169401	169408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017056	ATA	2	6	169441	169446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017056	ATAA	2	8	169459	169466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017056	TAA	2	6	169475	169480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017056	AGAA	2	8	169546	169553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017056	A	7	7	169577	169583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017056	TAG	2	6	169663	169668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_017056	AAT	2	6	169731	169736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017056	TTA	2	6	169780	169785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017056	AT	3	6	169801	169806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017056	TAG	2	6	169839	169844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017056	AT	3	6	169910	169915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017056	ATT	2	6	169941	169946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017056	ATAA	2	8	170008	170015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017056	TAA	2	6	171583	171588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017056	TTCAT	2	10	172444	172453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_017056	TA	4	8	172483	172490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017056	TAA	2	6	172996	173001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017056	TATGTA	2	12	173005	173016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_017056	CAA	2	6	211713	211718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_017056	TTTA	2	8	212174	212181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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