MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 8080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017056	A	7	7	1100301	1100307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017056	GAT	2	6	1100326	1100331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017056	ATT	2	6	1100344	1100349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017056	AAAT	2	8	1100422	1100429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017056	TTTC	2	8	1101699	1101706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_017056	TAC	2	6	1101865	1101870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017056	TTA	2	6	1101880	1101885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017056	ATT	2	6	1101913	1101918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017056	A	6	6	1101946	1101951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017056	AAC	2	6	1101990	1101995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_017056	T	6	6	1102011	1102016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017056	TGA	2	6	1102093	1102098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017056	GCTAA	2	10	1102142	1102151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8014	NC_017056	TAT	2	6	1102152	1102157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017056	ATG	2	6	1102270	1102275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017056	ATT	2	6	1102832	1102837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017056	AAGG	2	8	1102844	1102851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017056	TTAA	2	8	1102913	1102920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017056	TTA	2	6	1102928	1102933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017056	A	6	6	1102937	1102942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017056	ATT	2	6	1104891	1104896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017056	TAAA	2	8	1104927	1104934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017056	TGACT	2	10	1104952	1104961	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8024	NC_017056	T	6	6	1104973	1104978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017056	T	6	6	1104981	1104986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017056	TAA	2	6	1105008	1105013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017056	TTA	2	6	1105066	1105071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017056	AGT	2	6	1105092	1105097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017056	ATTC	2	8	1105123	1105130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_017056	TAGA	2	8	1105161	1105168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017056	AT	3	6	1105176	1105181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017056	CAT	2	6	1105244	1105249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_017056	ATT	2	6	1105302	1105307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017056	T	7	7	1105328	1105334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017056	AACGTT	2	12	1105469	1105480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8036	NC_017056	GATG	2	8	1105481	1105488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017056	TAA	2	6	1105496	1105501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017056	TAA	2	6	1105514	1105519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017056	ATT	3	9	1105521	1105529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017056	A	6	6	1105530	1105535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017056	AGA	2	6	1105554	1105559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017056	TA	3	6	1105588	1105593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017056	A	6	6	1105593	1105598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017056	GTA	2	6	1105599	1105604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017056	AT	3	6	1105645	1105650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017056	ACT	2	6	1105656	1105661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_017056	TAA	2	6	1105757	1105762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017056	TTCTTA	2	12	1105767	1105778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8049	NC_017056	ATG	2	6	1105805	1105810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017056	TAA	3	9	1105822	1105830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017056	TAAT	2	8	1105835	1105842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017056	TAC	2	6	1107957	1107962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_017056	TAG	2	6	1108004	1108009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017056	ATTCC	2	10	1108036	1108045	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8055	NC_017056	ATT	3	9	1108052	1108060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017056	T	8	8	1108151	1108158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017056	T	7	7	1108171	1108177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017056	T	6	6	1108183	1108188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017056	ATT	2	6	1108241	1108246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017056	AT	3	6	1108249	1108254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017056	T	6	6	1108271	1108276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017056	T	8	8	1108292	1108299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017056	TA	3	6	1108335	1108340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017056	TAT	2	6	1108367	1108372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017056	TATAAA	2	12	1108396	1108407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017056	A	6	6	1108409	1108414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017056	ATT	2	6	1108478	1108483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017056	TTAT	2	8	1108524	1108531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017056	TAATA	2	10	1108553	1108562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017056	ATT	2	6	1109014	1109019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017056	CTA	2	6	1111065	1111070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_017056	AT	4	8	1111081	1111088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017056	TA	3	6	1111093	1111098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017056	TAAAT	2	10	1111119	1111128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017056	CAA	2	6	1111146	1111151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_017056	A	7	7	1111173	1111179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017056	ATT	3	9	1111191	1111199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017056	TAAT	2	8	1111212	1111219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017056	TTTAG	2	10	1111254	1111263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017056	GA	3	6	1111369	1111374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.