MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017051	CATTAA	2	12	553074	553085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4002	NC_017051	TTA	2	6	553088	553093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017051	AT	3	6	553101	553106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017051	T	7	7	553112	553118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017051	TTAA	2	8	553122	553129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017051	TAT	2	6	553132	553137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017051	A	7	7	560195	560201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017051	TAA	2	6	560230	560235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017051	TAG	2	6	560245	560250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017051	TAA	2	6	560266	560271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017051	CTA	2	6	560286	560291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017051	TA	3	6	560372	560377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017051	T	6	6	560400	560405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017051	ATT	2	6	560436	560441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017051	A	6	6	560480	560485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017051	TAAT	2	8	560513	560520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017051	ATTA	2	8	560536	560543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017051	TA	3	6	560542	560547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017051	TAT	2	6	560555	560560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017051	ATTT	2	8	560608	560615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017051	TTA	2	6	560640	560645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017051	ATT	2	6	560655	560660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017051	TAA	2	6	560676	560681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017051	T	6	6	560699	560704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017051	TA	3	6	560750	560755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017051	ATT	2	6	561796	561801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017051	AT	3	6	561849	561854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017051	TAC	2	6	561863	561868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017051	TTA	2	6	561876	561881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017051	AT	3	6	561896	561901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017051	ATT	3	9	561926	561934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017051	ATACAG	2	12	561939	561950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4033	NC_017051	TAAAT	2	10	561985	561994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017051	A	8	8	562076	562083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017051	TGAC	2	8	562092	562099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_017051	ATT	2	6	562157	562162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017051	AT	3	6	562190	562195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017051	ATT	2	6	562200	562205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017051	ATA	2	6	562221	562226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017051	TTA	2	6	562250	562255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017051	TTG	2	6	562262	562267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017051	TAA	2	6	562299	562304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017051	GTA	2	6	562329	562334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017051	ATT	2	6	562385	562390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017051	ATT	2	6	562407	562412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017051	AAG	2	6	562459	562464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017051	TAG	2	6	562471	562476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017051	T	7	7	562480	562486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017051	TAA	2	6	562497	562502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017051	A	6	6	562535	562540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017051	AGTA	2	8	562549	562556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017051	TAAT	2	8	562574	562581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017051	ATA	2	6	562683	562688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017051	TAT	2	6	562730	562735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017051	TTTTA	2	10	562739	562748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017051	T	6	6	562763	562768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017051	TA	3	6	562786	562791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017051	TAA	3	9	562801	562809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017051	T	6	6	562864	562869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017051	AGA	3	9	562923	562931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017051	TA	3	6	562937	562942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017051	TAA	2	6	562991	562996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017051	GAA	2	6	563053	563058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017051	TAA	3	9	563074	563082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017051	A	6	6	563081	563086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017051	ACT	2	6	563147	563152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017051	TACAT	2	10	563177	563186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_017051	GATT	2	8	563198	563205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017051	ATA	2	6	563225	563230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017051	ATG	2	6	563245	563250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017051	GA	3	6	563254	563259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017051	TC	3	6	563330	563335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_017051	A	7	7	563337	563343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017051	TTA	2	6	563369	563374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017051	TAT	2	6	563457	563462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017051	ATT	2	6	563471	563476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017051	ATT	3	9	563484	563492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017051	TAA	2	6	563532	563537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017051	ATTCT	2	10	565064	565073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4080	NC_017051	TTA	2	6	565217	565222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017051	TAA	3	9	565236	565244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017051	TAA	2	6	565294	565299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017051	TAA	2	6	565324	565329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017051	ATTA	2	8	565349	565356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017051	AATT	2	8	565358	565365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017051	T	6	6	565510	565515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017051	TA	3	6	566764	566769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017051	TA	3	6	566774	566779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017051	AT	3	6	566826	566831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017051	GAA	2	6	566870	566875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017051	T	6	6	566901	566906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017051	TAT	2	6	566908	566913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017051	AC	3	6	566965	566970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4095	NC_017051	ATC	2	6	566999	567004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_017051	A	8	8	567109	567116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017051	TAGAT	2	10	567129	567138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017051	ACA	2	6	567157	567162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017051	A	6	6	567179	567184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017051	AT	3	6	567194	567199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017051	TAA	2	6	567241	567246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017051	TAT	2	6	567334	567339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017051	TAT	2	6	567369	567374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017051	TAA	2	6	567404	567409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017051	AAT	2	6	567415	567420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017051	TAA	2	6	567423	567428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017051	ATT	2	6	567432	567437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017051	ACAAA	2	10	567441	567450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_017051	AT	3	6	567504	567509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017051	GAA	2	6	567514	567519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017051	GTT	2	6	567526	567531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017051	AT	3	6	567535	567540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017051	AACA	2	8	567694	567701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_017051	TAA	3	9	567751	567759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017051	GTAG	2	8	567803	567810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017051	TAA	2	6	567816	567821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017051	TTA	2	6	567823	567828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017051	AT	4	8	567856	567863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017051	TAA	2	6	567886	567891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017051	TAA	2	6	567915	567920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017051	TGA	2	6	567924	567929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017051	ATAA	2	8	567968	567975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017051	AATAAA	2	12	568000	568011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017051	TCA	2	6	568061	568066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017051	A	7	7	568121	568127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017051	AT	3	6	568131	568136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017051	TAAAA	2	10	568143	568152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017051	TTAA	2	8	568156	568163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017051	GA	3	6	568171	568176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017051	TA	3	6	568179	568184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017051	TAA	2	6	568214	568219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017051	TTAT	2	8	568245	568252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017051	ATA	2	6	568272	568277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017051	GTA	2	6	568984	568989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017051	TGT	2	6	568999	569004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017051	A	6	6	569021	569026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_017051	CAT	2	6	569072	569077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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