MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017051	TAT	2	6	428085	428090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017051	TAC	2	6	428130	428135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017051	ATTT	2	8	428229	428236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017051	AAT	2	6	428277	428282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017051	TAA	2	6	428289	428294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017051	A	6	6	428306	428311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017051	TGC	2	6	428319	428324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017051	TAA	2	6	428496	428501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017051	TCA	2	6	428536	428541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017051	ACTT	2	8	428550	428557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_017051	ATTT	2	8	428564	428571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017051	T	6	6	428569	428574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017051	TTA	2	6	428581	428586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017051	AATTTA	2	12	428599	428610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017051	AT	3	6	428669	428674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017051	AAT	2	6	428706	428711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017051	TAT	2	6	428718	428723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017051	AAGT	2	8	428772	428779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017051	GATA	2	8	428826	428833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017051	ATCATG	2	12	428843	428854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3021	NC_017051	ACT	2	6	429016	429021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017051	GA	3	6	429036	429041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017051	AAAT	2	8	429057	429064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017051	AAT	2	6	429085	429090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017051	AAT	2	6	429133	429138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017051	TTTA	2	8	429161	429168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017051	ATA	2	6	429176	429181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017051	TAA	2	6	429195	429200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017051	GGT	2	6	429220	429225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017051	TTA	2	6	429250	429255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017051	GTG	2	6	429345	429350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017051	AGTA	2	8	429355	429362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017051	TA	3	6	429408	429413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017051	CAA	2	6	429442	429447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017051	TAA	2	6	429457	429462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017051	A	6	6	429486	429491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017051	TAA	2	6	429493	429498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017051	AAC	2	6	429547	429552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017051	GCG	2	6	429579	429584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017051	TAG	2	6	429643	429648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017051	CTT	2	6	429657	429662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017051	AT	3	6	429674	429679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017051	TTC	2	6	429694	429699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017051	TTAAA	2	10	429735	429744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017051	TACA	2	8	429750	429757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_017051	TCT	2	6	429758	429763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017051	AGTT	2	8	429769	429776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017051	TAG	2	6	429835	429840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017051	AAC	2	6	429868	429873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017051	CTA	2	6	429885	429890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017051	A	6	6	429903	429908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017051	TAC	2	6	430213	430218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017051	AAT	2	6	430232	430237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017051	CGT	2	6	430253	430258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017051	AAT	2	6	430316	430321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017051	ATC	2	6	430341	430346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017051	ATG	2	6	430347	430352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017051	TTA	2	6	430367	430372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017051	TCTAT	2	10	430418	430427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3060	NC_017051	TAGA	2	8	430428	430435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017051	ATT	2	6	430485	430490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017051	TAT	2	6	430491	430496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017051	ATGAT	2	10	430532	430541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017051	GAT	2	6	430546	430551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017051	ATA	2	6	430552	430557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017051	TA	3	6	430573	430578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017051	A	7	7	430587	430593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017051	TCA	2	6	430598	430603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_017051	AGT	2	6	430697	430702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_017051	A	7	7	431418	431424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017051	T	6	6	431432	431437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017051	TAT	2	6	431499	431504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_017051	ATA	2	6	431590	431595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017051	TTAA	2	8	431618	431625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_017051	AAT	2	6	433811	433816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017051	TAA	2	6	433829	433834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017051	CATA	2	8	433865	433872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_017051	AAT	2	6	433873	433878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_017051	TAC	2	6	435375	435380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017051	ATATCT	2	12	435459	435470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3091	NC_017051	TA	3	6	437193	437198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_017051	TAT	2	6	437232	437237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_017051	ATTA	2	8	437270	437277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_017051	A	8	8	437380	437387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017051	CAA	2	6	437420	437425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_017051	T	6	6	437453	437458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017051	TA	3	6	437473	437478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017051	AGTT	2	8	437487	437494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017051	ATC	2	6	437530	437535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017051	ATT	2	6	437544	437549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017051	A	6	6	437558	437563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_017051	TAA	2	6	437755	437760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017051	TAA	2	6	438751	438756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017051	AAT	2	6	439023	439028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017051	A	7	7	439040	439046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017051	A	7	7	439053	439059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017051	TTG	2	6	439063	439068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017051	TAA	3	9	439806	439814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017051	TTAAT	2	10	439837	439846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017051	TTA	2	6	439870	439875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017051	TAT	2	6	439880	439885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017051	AATA	2	8	439886	439893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017051	TGA	2	6	441132	441137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017051	ATTT	2	8	441150	441157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017051	TTAA	2	8	441189	441196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017051	ATATT	2	10	441212	441221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017051	TTA	2	6	441222	441227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017051	CATA	2	8	441228	441235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_017051	ATG	2	6	442094	442099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_017051	AAT	2	6	443644	443649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017051	TTAA	2	8	443688	443695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017051	AAT	2	6	443704	443709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017051	TAT	2	6	443717	443722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_017051	TAA	2	6	443736	443741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017051	TAT	2	6	443791	443796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017051	A	6	6	443842	443847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_017051	TAA	2	6	443864	443869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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