MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 8411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017051	TAAT	2	8	225172	225179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017051	ATG	2	6	225184	225189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017051	T	6	6	225206	225211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017051	T	6	6	225227	225232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017051	ATA	2	6	225235	225240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017051	ATT	2	6	225269	225274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017051	T	6	6	225298	225303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017051	TAA	2	6	225339	225344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017051	ATTA	2	8	225383	225390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017051	TTTC	2	8	225395	225402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_017051	TTA	2	6	225422	225427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017051	A	6	6	225432	225437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017051	ATA	2	6	225450	225455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017051	AG	3	6	226914	226919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017051	AGTA	2	8	226943	226950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017051	ATT	2	6	227640	227645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017051	T	7	7	227668	227674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017051	GATT	2	8	227677	227684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017051	ATT	2	6	227686	227691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017051	GCT	2	6	227730	227735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017051	ACA	2	6	227741	227746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017051	TAA	2	6	227780	227785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017051	CAA	2	6	227829	227834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017051	ATT	2	6	227849	227854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017051	ATA	2	6	227877	227882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017051	TAA	3	9	227912	227920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017051	TGC	2	6	227952	227957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017051	TCA	2	6	227971	227976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017051	ATA	2	6	227977	227982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017051	ATTA	2	8	228117	228124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017051	ATAAA	2	10	228132	228141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017051	ATTT	2	8	228179	228186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017051	CTT	2	6	228235	228240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017051	ATTA	2	8	229043	229050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017051	TA	3	6	229078	229083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017051	ATT	2	6	229096	229101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017051	T	6	6	229100	229105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017051	TATCA	2	10	229509	229518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_017051	GCTA	2	8	229588	229595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_017051	TAT	2	6	229651	229656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017051	AT	3	6	229681	229686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017051	ATTA	2	8	230381	230388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017051	ATT	2	6	230391	230396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017051	A	6	6	230400	230405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017051	ATA	2	6	230420	230425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017051	ATT	2	6	230435	230440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017051	CTG	2	6	231299	231304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017051	ATA	2	6	231337	231342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017051	TA	4	8	231341	231348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017051	A	6	6	231396	231401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017051	CTTT	2	8	231407	231414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_017051	TTG	2	6	231429	231434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017051	TTA	2	6	231442	231447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017051	AAAG	2	8	231460	231467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017051	TAG	2	6	231475	231480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017051	TTTCTT	2	12	231533	231544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_017051	T	6	6	231576	231581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017051	CTTT	2	8	231633	231640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017051	ATTA	2	8	231645	231652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017051	ATT	2	6	231655	231660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017051	AT	3	6	231717	231722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017051	CTT	2	6	231753	231758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017051	T	6	6	231784	231789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017051	TGT	2	6	231809	231814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017051	TAG	2	6	231832	231837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017051	ATAG	2	8	231838	231845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017051	TGTA	2	8	231852	231859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017051	TAG	2	6	231913	231918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017051	AAT	2	6	231928	231933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017051	ATATG	2	10	231986	231995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017051	AAT	2	6	232122	232127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017051	T	6	6	232204	232209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017051	T	6	6	232246	232251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017051	TAC	2	6	232265	232270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017051	AT	3	6	232315	232320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017051	TA	3	6	232323	232328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017051	GAA	2	6	232399	232404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017051	T	6	6	232453	232458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017051	T	7	7	232461	232467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017051	ACT	2	6	232468	232473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017051	AAT	2	6	232494	232499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017051	AAAT	2	8	232503	232510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017051	TA	4	8	232538	232545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017051	AT	3	6	232604	232609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017051	TAAAA	2	10	232646	232655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017051	AAT	2	6	232689	232694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017051	T	6	6	232727	232732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017051	T	6	6	232761	232766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017051	AAT	2	6	232782	232787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017051	TGCT	2	8	232806	232813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_017051	AAT	2	6	232818	232823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017051	CTG	2	6	232836	232841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017051	TTA	2	6	232852	232857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017051	TGC	2	6	232860	232865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017051	GCAATT	2	12	232867	232878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1596	NC_017051	AT	3	6	232881	232886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017051	TAG	2	6	234890	234895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017051	CCT	2	6	234898	234903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_017051	GA	3	6	235119	235124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017051	AT	4	8	235165	235172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017051	ATTG	2	8	235182	235189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017051	TAA	2	6	235190	235195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017051	TTG	2	6	235241	235246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017051	TAA	2	6	235278	235283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017051	AAT	2	6	235295	235300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017051	AAT	2	6	235310	235315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017051	ATT	2	6	235332	235337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017051	ATA	2	6	235338	235343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017051	CAC	2	6	235344	235349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_017051	ATA	2	6	235353	235358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017051	TTA	2	6	235377	235382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017051	TAG	2	6	235468	235473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017051	ATA	2	6	235479	235484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017051	TAAA	2	8	235491	235498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017051	TCA	2	6	235501	235506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017051	AAAC	2	8	235546	235553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_017051	TTA	2	6	235579	235584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017051	AATTA	2	10	235662	235671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017051	ATATA	2	10	235728	235737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017051	ATTAT	2	10	235750	235759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017051	A	7	7	235763	235769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017051	TAGC	2	8	235777	235784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_017051	ACTAA	2	10	235809	235818	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1624	NC_017051	TAAAAA	2	12	235831	235842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017051	TTG	2	6	235848	235853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017051	TAA	2	6	235873	235878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017051	GAA	2	6	235915	235920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017051	TTG	2	6	235950	235955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017051	TTA	2	6	235962	235967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017051	AGC	2	6	235997	236002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017051	ATA	2	6	236005	236010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017051	GAT	2	6	236070	236075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017051	GAAA	2	8	236087	236094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017051	GAA	2	6	236101	236106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017051	AAG	2	6	236116	236121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017051	ATAA	2	8	236146	236153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_017051	AAT	2	6	236240	236245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_017051	AAT	2	6	263196	263201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_017051	AT	3	6	263207	263212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_017051	T	6	6	263307	263312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_017051	TAA	2	6	263390	263395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_017051	TAT	2	6	263500	263505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1949	NC_017051	AAAATA	2	12	269714	269725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1957	NC_017051	TAA	2	6	272085	272090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_017051	TAAA	2	8	272094	272101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1974	NC_017051	ATT	2	6	272562	272567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_017051	T	6	6	272621	272626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_017051	ATT	2	6	272701	272706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_017051	TA	3	6	272707	272712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_017051	AT	3	6	273382	273387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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