MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 8095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017050	AT	4	8	575847	575854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017050	AGC	2	6	575895	575900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017050	AGA	2	6	575926	575931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017050	TAA	2	6	575943	575948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017050	TAG	2	6	575952	575957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017050	TGA	2	6	575981	575986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017050	A	6	6	576030	576035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017050	T	6	6	576047	576052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017050	CTTA	2	8	576181	576188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_017050	AGA	2	6	576196	576201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017050	AGTA	2	8	576222	576229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017050	ATG	2	6	576230	576235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017050	ATT	2	6	576275	576280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017050	TTAAG	2	10	576306	576315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017050	TAA	2	6	576328	576333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017050	ATA	2	6	576371	576376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017050	TA	3	6	576382	576387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017050	ATATT	2	10	576399	576408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017050	TAG	2	6	576437	576442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017050	GATCT	2	10	576466	576475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4021	NC_017050	CATT	2	8	576530	576537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_017050	CTT	2	6	576561	576566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017050	TTGT	2	8	576583	576590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017050	T	7	7	576594	576600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017050	TTA	3	9	576605	576613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017050	ACA	2	6	579418	579423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017050	TAT	2	6	579433	579438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017050	TTA	2	6	579465	579470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017050	TAT	2	6	579499	579504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017050	ATG	2	6	579549	579554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017050	AAG	2	6	579580	579585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017050	AGTT	2	8	579591	579598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017050	AAAT	2	8	579671	579678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017050	TA	3	6	579687	579692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017050	GAT	2	6	579699	579704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017050	ATT	2	6	579705	579710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017050	ATA	2	6	579742	579747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017050	AT	3	6	579818	579823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017050	AGC	2	6	579832	579837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017050	AT	3	6	579838	579843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017050	TTATT	2	10	579901	579910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017050	AACA	2	8	579914	579921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_017050	AAT	2	6	579937	579942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017050	ATG	2	6	579962	579967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017050	TA	3	6	580015	580020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017050	T	6	6	580044	580049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017050	A	6	6	580072	580077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017050	ATAC	2	8	580094	580101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_017050	T	6	6	580110	580115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017050	TA	4	8	580119	580126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017050	A	6	6	580161	580166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017050	TCT	2	6	580204	580209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017050	TAT	3	9	580210	580218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017050	AAAGCA	2	12	580220	580231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4055	NC_017050	TAA	2	6	580297	580302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017050	A	6	6	580301	580306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017050	GCA	2	6	580311	580316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017050	A	6	6	580399	580404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017050	TTTA	2	8	580407	580414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017050	AT	3	6	580430	580435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017050	ATTA	2	8	580469	580476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017050	TAG	2	6	580516	580521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017050	ATT	2	6	581490	581495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017050	TG	4	8	581527	581534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017050	TA	3	6	581553	581558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017050	TTA	2	6	581564	581569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017050	ATA	2	6	581580	581585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017050	TAA	2	6	581701	581706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017050	A	6	6	581705	581710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017050	GTG	2	6	581717	581722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017050	TAAA	2	8	581734	581741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017050	AAT	2	6	581889	581894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017050	TTTTA	2	10	582933	582942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017050	TTA	2	6	582975	582980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017050	ATT	2	6	582986	582991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017050	TAA	2	6	582993	582998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017050	ATA	2	6	583732	583737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_017050	TAT	2	6	583758	583763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017050	ATT	2	6	583777	583782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017050	ATT	2	6	584241	584246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_017050	TGT	2	6	584369	584374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017050	GTA	2	6	584454	584459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_017050	TAA	2	6	584542	584547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_017050	AAT	2	6	584592	584597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017050	TG	3	6	585376	585381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017050	ATC	2	6	585399	585404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4098	NC_017050	TGTTT	2	10	588179	588188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017050	TA	3	6	589587	589592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017050	TTA	2	6	589614	589619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017050	AAT	2	6	589622	589627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017050	AT	3	6	589626	589631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017050	TTGC	2	8	589770	589777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_017050	TAA	2	6	589786	589791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017050	ATT	2	6	589868	589873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017050	TAA	2	6	589877	589882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017050	GTT	2	6	589888	589893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017050	ATTT	2	8	589968	589975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_017050	T	8	8	590091	590098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017050	A	6	6	594993	594998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017050	TAT	2	6	596107	596112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017050	GGA	2	6	596142	596147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017050	AATA	2	8	596235	596242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017050	TA	3	6	598040	598045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017050	CAA	2	6	598046	598051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_017050	TAT	2	6	598103	598108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017050	ATA	2	6	599457	599462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017050	ACT	2	6	599481	599486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017050	ATTA	2	8	599487	599494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017050	ATT	2	6	599547	599552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017050	TTATA	2	10	600324	600333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017050	TCT	2	6	600390	600395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017050	CTT	2	6	600408	600413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017050	CAT	2	6	600415	600420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017050	AGT	2	6	600499	600504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017050	TTC	2	6	600544	600549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4133	NC_017050	TTAGAT	2	12	600675	600686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017050	TAAA	2	8	600718	600725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017050	TAT	2	6	600747	600752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017050	CCA	3	9	600887	600895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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