MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 8095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017050	TAT	2	6	142280	142285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017050	ATTA	2	8	142317	142324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017050	TAC	2	6	142345	142350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017050	TCT	2	6	142361	142366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017050	ACTT	2	8	142405	142412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017050	A	6	6	142416	142421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017050	T	6	6	142422	142427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017050	TA	3	6	142435	142440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017050	TCT	2	6	142446	142451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017050	AGT	2	6	142486	142491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017050	AT	3	6	142502	142507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017050	TA	3	6	142524	142529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017050	CTT	2	6	142537	142542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017050	T	7	7	142616	142622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017050	AATATT	2	12	142636	142647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017050	T	6	6	142673	142678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017050	TA	3	6	144749	144754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017050	TAT	2	6	144756	144761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017050	AT	4	8	144760	144767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017050	ATA	2	6	144785	144790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017050	A	6	6	144792	144797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017050	AT	3	6	145843	145848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017050	TAC	2	6	145859	145864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017050	CAT	2	6	145873	145878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017050	TCT	2	6	145927	145932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017050	T	6	6	145941	145946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017050	ATA	2	6	145963	145968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017050	GTC	2	6	146851	146856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017050	ACTT	2	8	148430	148437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017050	TAAGC	2	10	148479	148488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_017050	TAAAT	2	10	148500	148509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017050	ATC	2	6	149265	149270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017050	ATA	2	6	149305	149310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017050	T	6	6	149329	149334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017050	TAT	2	6	149375	149380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017050	T	6	6	149816	149821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017050	TGAAA	2	10	149853	149862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017050	TAA	2	6	149874	149879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017050	AAT	2	6	149884	149889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017050	CAG	2	6	150322	150327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017050	ATT	2	6	150357	150362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017050	TAA	2	6	150378	150383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017050	TTAAG	2	10	150389	150398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1045	NC_017050	TA	3	6	152238	152243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017050	TAT	2	6	152245	152250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017050	TTTA	2	8	152251	152258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017050	AAC	2	6	152272	152277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017050	T	6	6	152296	152301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_017050	GAA	2	6	152329	152334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017050	A	6	6	152333	152338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017050	TA	3	6	152339	152344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017050	ATAATT	2	12	153033	153044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_017050	ATTT	2	8	153560	153567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017050	TAGAGA	2	12	153571	153582	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_017050	AGA	2	6	156205	156210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017050	TAAT	2	8	156211	156218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017050	AATA	2	8	156234	156241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017050	TAA	3	9	156283	156291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017050	TAT	2	6	156312	156317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017050	AG	3	6	156422	156427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017050	TA	4	8	156444	156451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017050	TA	3	6	156466	156471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017050	ATT	2	6	156492	156497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017050	TAA	2	6	157353	157358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017050	TAAA	2	8	157364	157371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_017050	TTA	2	6	157441	157446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_017050	ATT	2	6	159312	159317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017050	T	7	7	159319	159325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_017050	GTA	2	6	159343	159348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017050	A	9	9	159398	159406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_017050	CTT	2	6	160000	160005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_017050	T	6	6	160255	160260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017050	AAC	2	6	160276	160281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017050	A	6	6	160327	160332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017050	TATT	2	8	160348	160355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017050	TATC	2	8	160386	160393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_017050	CAA	2	6	160395	160400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017050	ATA	2	6	160420	160425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017050	TA	3	6	160436	160441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017050	ATATT	2	10	160469	160478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017050	A	7	7	160534	160540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017050	TTAT	2	8	160578	160585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017050	TA	3	6	164778	164783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_017050	TTG	2	6	164802	164807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1116	NC_017050	GAA	2	6	169071	169076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_017050	TAA	2	6	169161	169166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017050	TAC	2	6	169207	169212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017050	T	7	7	169252	169258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017050	ATA	2	6	169318	169323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017050	TAAA	2	8	169391	169398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017050	ATA	2	6	169431	169436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017050	ATAA	2	8	169449	169456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017050	TAA	2	6	169465	169470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017050	AGAA	2	8	169536	169543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017050	A	7	7	169567	169573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017050	TAG	2	6	169653	169658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_017050	AAT	2	6	169721	169726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017050	TTA	2	6	169770	169775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017050	AT	3	6	169791	169796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017050	TAG	2	6	169829	169834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017050	AT	3	6	169900	169905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017050	ATT	2	6	169931	169936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017050	ATAA	2	8	169998	170005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017050	TAA	2	6	171573	171578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017050	TTCAT	2	10	172434	172443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1140	NC_017050	TAA	2	6	172986	172991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_017050	GTT	2	6	210278	210283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_017050	TAA	2	6	210383	210388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017050	TTAA	2	8	211687	211694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_017050	CAA	2	6	211702	211707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_017050	AT	3	6	212176	212181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_017050	TTG	2	6	216810	216815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_017050	T	6	6	217108	217113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017050	AAT	2	6	217137	217142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_017050	TATT	2	8	217654	217661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_017050	ATT	2	6	217755	217760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_017050	TAAA	2	8	218032	218039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_017050	ATT	2	6	218048	218053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_017050	T	6	6	218052	218057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_017050	CTA	2	6	218424	218429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_017050	TTC	2	6	221047	221052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1461	NC_017050	ATT	2	6	221289	221294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1474	NC_017050	TAT	2	6	224813	224818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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