MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 8095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017050	ATT	2	6	715165	715170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017050	TAT	2	6	715183	715188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017050	ATT	2	6	715203	715208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017050	ATTACA	2	12	715238	715249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5005	NC_017050	TAC	2	6	715276	715281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017050	TAA	2	6	715309	715314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017050	ATTAA	2	10	715318	715327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017050	TAA	2	6	715368	715373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017050	T	6	6	715488	715493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017050	GATAA	2	10	715501	715510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017050	AAT	2	6	715575	715580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017050	AGA	2	6	715619	715624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017050	ATA	2	6	715630	715635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017050	AAT	2	6	715691	715696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017050	ATTT	2	8	715728	715735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017050	ATT	2	6	715760	715765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017050	ATTAAT	2	12	715767	715778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017050	AT	3	6	715801	715806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017050	CA	3	6	715847	715852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_017050	A	6	6	715870	715875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017050	CTA	2	6	715876	715881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017050	A	6	6	715881	715886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017050	ACT	2	6	715910	715915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017050	ATT	2	6	715923	715928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017050	ATA	2	6	715933	715938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017050	AT	3	6	715949	715954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017050	ATTT	2	8	717394	717401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017050	TTG	2	6	717442	717447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017050	TAA	2	6	717472	717477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017050	ATT	2	6	717500	717505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017050	ATT	2	6	717537	717542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017050	T	7	7	717547	717553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017050	ATGT	2	8	717572	717579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017050	TATC	2	8	719513	719520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_017050	TGG	2	6	719564	719569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_017050	TTC	2	6	720219	720224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017050	TA	3	6	720276	720281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017050	CTTA	2	8	720287	720294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017050	AGT	2	6	720299	720304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017050	ATT	3	9	720348	720356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017050	AAT	2	6	720415	720420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017050	CTA	2	6	720447	720452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017050	ATTC	2	8	720454	720461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_017050	A	6	6	720492	720497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017050	TCA	2	6	720504	720509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5048	NC_017050	TAA	2	6	720563	720568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017050	CAT	2	6	720594	720599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5051	NC_017050	TTTTC	2	10	720675	720684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5052	NC_017050	ATATA	2	10	720703	720712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017050	AAG	2	6	720745	720750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017050	ATT	2	6	720753	720758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_017050	ATT	2	6	720837	720842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017050	TTAA	2	8	720855	720862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017050	T	6	6	720877	720882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017050	ATTA	2	8	720924	720931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017050	CTTT	2	8	720965	720972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_017050	AAG	2	6	720997	721002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017050	CA	3	6	721003	721008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_017050	CT	3	6	721048	721053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_017050	ATATT	2	10	721060	721069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017050	TAA	2	6	721083	721088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017050	ATT	2	6	721114	721119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017050	ATA	2	6	721155	721160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017050	AGA	2	6	721168	721173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017050	AAT	2	6	721187	721192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017050	TAC	2	6	721217	721222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017050	TGT	2	6	721225	721230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017050	TA	3	6	721276	721281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017050	TAT	2	6	721339	721344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_017050	TCATT	2	10	721445	721454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5081	NC_017050	ATT	3	9	721530	721538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017050	CGA	2	6	721539	721544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5084	NC_017050	AAT	2	6	721596	721601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_017050	ATT	2	6	721670	721675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017050	TAA	2	6	721681	721686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_017050	TGATTT	2	12	721766	721777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017050	A	7	7	722036	722042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_017050	AAG	2	6	722069	722074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017050	TGG	2	6	722124	722129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017050	AGA	2	6	722207	722212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017050	TAA	2	6	722471	722476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017050	ATT	3	9	722530	722538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017050	TTA	2	6	722545	722550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_017050	GTT	2	6	722640	722645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5112	NC_017050	TA	3	6	722665	722670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017050	AT	3	6	722785	722790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017050	TAT	2	6	722818	722823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017050	TTA	2	6	722830	722835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017050	TA	3	6	722857	722862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017050	T	6	6	722936	722941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017050	CA	4	8	723013	723020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_017050	TAA	2	6	723060	723065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017050	TA	4	8	723070	723077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017050	TAC	2	6	723124	723129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017050	TAAA	2	8	723132	723139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017050	TAT	2	6	723174	723179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017050	ATA	3	9	723230	723238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017050	CTA	2	6	723265	723270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017050	TGAT	2	8	723326	723333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017050	ATG	2	6	726065	726070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017050	ATT	2	6	726085	726090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017050	AAT	2	6	726119	726124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017050	TAATTT	2	12	726134	726145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017050	T	6	6	726143	726148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017050	T	6	6	726160	726165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017050	TTTA	2	8	726168	726175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017050	ATT	2	6	726182	726187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_017050	AT	3	6	726225	726230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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