MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 1031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017049	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017049	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017049	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017049	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017049	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017049	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017049	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017049	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017049	TAAG	2	8	14774	14781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017049	ATTA	2	8	14795	14802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017049	AAAG	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017049	TTAT	2	8	15035	15042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017049	TATT	2	8	19400	19407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017049	GTAA	2	8	19574	19581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017049	TTAT	2	8	19652	19659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017049	TCAA	2	8	19684	19691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017049	GTAA	2	8	19853	19860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017049	ATAG	2	8	20088	20095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017049	ATTA	2	8	20192	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017049	ATCA	2	8	20754	20761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017049	AACA	2	8	21115	21122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017049	GTAT	2	8	21154	21161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017049	TAAT	2	8	22427	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017049	TCTT	2	8	25042	25049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017049	TAAA	2	8	26862	26869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017049	ATTT	3	12	28776	28787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017049	TACA	2	8	28918	28925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017049	ATAA	2	8	29093	29100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017049	AATA	2	8	29723	29730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017049	TTTG	2	8	31044	31051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017049	ATTA	2	8	31254	31261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017049	ATAG	2	8	31393	31400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017049	TTTG	2	8	31483	31490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017049	ATTT	2	8	31809	31816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017049	TTCT	2	8	31851	31858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017049	AAAT	2	8	32612	32619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017049	TATT	2	8	32713	32720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017049	TCGT	2	8	36094	36101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017049	AATC	2	8	36405	36412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017049	TGAT	2	8	36477	36484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017049	TCAA	2	8	37987	37994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017049	ATGT	2	8	38047	38054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017049	TTAA	2	8	38313	38320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017049	TTAT	2	8	38379	38386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017049	AATA	2	8	41067	41074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017049	AAAT	2	8	41133	41140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017049	TAAG	2	8	44392	44399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017049	GTTT	2	8	44784	44791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017049	TAAT	2	8	49491	49498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017049	TAAT	2	8	52806	52813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017049	TAAT	2	8	54287	54294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017049	GTTG	2	8	57762	57769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017049	TTCT	2	8	58051	58058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017049	ATTA	2	8	58463	58470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017049	TAGT	2	8	59134	59141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017049	TTCT	2	8	59224	59231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017049	TTTG	2	8	59244	59251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017049	AAAT	2	8	59288	59295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017049	TAAT	2	8	70111	70118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017049	AAAT	2	8	70643	70650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017049	TCTA	2	8	70920	70927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017049	TCAA	2	8	75601	75608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017049	TAAA	2	8	78006	78013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017049	AAAT	2	8	78014	78021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017049	TTAA	2	8	79614	79621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017049	ATTA	2	8	79796	79803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017049	ATTT	2	8	84824	84831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017049	GAAC	2	8	88038	88045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017049	TTTC	2	8	88065	88072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017049	ATAA	2	8	89046	89053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017049	TGTT	2	8	89254	89261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017049	TGAT	2	8	89407	89414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017049	TTGT	2	8	89866	89873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017049	ATCT	2	8	90130	90137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017049	CTTG	2	8	90636	90643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017049	TATT	2	8	90693	90700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017049	ATAA	2	8	90982	90989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017049	TCAT	2	8	91002	91009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017049	TTTA	2	8	91499	91506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017049	TTTA	2	8	91646	91653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017049	GTTT	2	8	91721	91728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017049	TTAA	2	8	91880	91887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017049	CTTG	2	8	92543	92550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017049	TACT	2	8	92713	92720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017049	CAAA	2	8	92910	92917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017049	CTTT	2	8	94388	94395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017049	GTAA	2	8	94560	94567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017049	ATGT	2	8	94583	94590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017049	TAAA	2	8	95771	95778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017049	CTAA	2	8	97235	97242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017049	TTAT	2	8	97467	97474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017049	ATTA	2	8	97527	97534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017049	AAGT	2	8	104141	104148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017049	ATAA	2	8	104240	104247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017049	ATCA	2	8	104382	104389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017049	ATCA	2	8	104414	104421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017049	TAAC	2	8	107876	107883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017049	AGTA	2	8	107972	107979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017049	ATTT	2	8	109461	109468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017049	CATA	2	8	110458	110465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017049	TAAA	2	8	111434	111441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017049	TATT	2	8	114645	114652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017049	GTAA	2	8	114743	114750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017049	GTCA	2	8	123100	123107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017049	GTAA	2	8	123138	123145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017049	CTTA	2	8	129522	129529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017049	TACT	2	8	129559	129566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017049	TTAC	2	8	129820	129827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017049	TAAC	2	8	129866	129873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017049	ACAA	2	8	132164	132171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017049	ATAA	2	8	132212	132219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017049	TAGA	2	8	133790	133797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017049	TTTA	2	8	139765	139772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017049	AATA	2	8	140416	140423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017049	ATTA	2	8	140518	140525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017049	ACTT	2	8	140606	140613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017049	ACTT	2	8	146631	146638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017049	TTTA	2	8	150452	150459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017049	TAAG	2	8	151344	151351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017049	ATTT	2	8	151761	151768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017049	TAAT	2	8	154412	154419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017049	AATA	2	8	154435	154442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017049	TAAA	2	8	155565	155572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017049	TAAT	2	8	157560	157567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017049	CTTT	2	8	158142	158149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017049	TATT	2	8	158549	158556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017049	TATC	2	8	158587	158594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017049	TTAT	2	8	158779	158786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017049	AATG	2	8	163043	163050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017049	ATTA	2	8	167346	167353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017049	TAAA	2	8	167592	167599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017049	ATAA	2	8	167650	167657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017049	AGAA	2	8	167737	167744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017049	ATAA	2	8	168199	168206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017049	GAAA	2	8	171214	171221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017049	ACAA	2	8	173120	173127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017049	AATA	2	8	173246	173253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017049	TTTG	2	8	173354	173361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017049	TTTA	2	8	173440	173447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017049	TCTT	2	8	173852	173859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017049	AACC	2	8	174048	174055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017049	CTTT	2	8	174229	174236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017049	TTGA	2	8	174400	174407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017049	TACA	2	8	174659	174666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017049	TATT	2	8	178694	178701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017049	ATTA	2	8	180302	180309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017049	GATT	2	8	182351	182358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017049	AGTA	2	8	182459	182466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017049	TATT	2	8	182481	182488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017049	ATTT	2	8	182543	182550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017049	GCAT	2	8	182566	182573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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