MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 7971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017049	TTG	2	6	231425	231430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017049	TTA	2	6	231438	231443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017049	AAAG	2	8	231456	231463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017049	TAG	2	6	231471	231476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017049	TTTCTT	2	12	231529	231540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1506	NC_017049	T	6	6	231572	231577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017049	CTTT	2	8	231629	231636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_017049	ATTA	2	8	231641	231648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017049	ATT	2	6	231651	231656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017049	AT	3	6	231713	231718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017049	CTT	2	6	231749	231754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017049	T	6	6	231780	231785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017049	TGT	2	6	231805	231810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017049	TAG	2	6	231828	231833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017049	ATAG	2	8	231834	231841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017049	TGTA	2	8	231848	231855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017049	TAG	2	6	231909	231914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017049	AAT	2	6	231924	231929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017049	ATATG	2	10	231982	231991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017049	AAT	2	6	232118	232123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017049	T	6	6	232200	232205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017049	T	6	6	232242	232247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017049	TAC	2	6	232261	232266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017049	AT	3	6	232311	232316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017049	TA	3	6	232319	232324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017049	GAA	2	6	232395	232400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017049	T	6	6	232449	232454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017049	T	7	7	232457	232463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017049	ACT	2	6	232464	232469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017049	AAT	2	6	232490	232495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017049	AAAT	2	8	232499	232506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017049	TA	4	8	232534	232541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017049	AT	3	6	232600	232605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017049	TAAAA	2	10	232642	232651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017049	AAT	2	6	232685	232690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017049	T	6	6	232723	232728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017049	T	6	6	232757	232762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017049	AAT	2	6	232778	232783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017049	TGCT	2	8	232802	232809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_017049	AAT	2	6	232814	232819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017049	CTG	2	6	232832	232837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017049	TTA	2	6	232848	232853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017049	TGC	2	6	232856	232861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017049	GCAATT	2	12	232863	232874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1545	NC_017049	AT	3	6	232877	232882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017049	TAG	2	6	234886	234891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017049	CCT	2	6	234894	234899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_017049	GA	3	6	235115	235120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017049	AT	4	8	235161	235168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017049	ATTG	2	8	235178	235185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017049	TAA	2	6	235186	235191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017049	TTG	2	6	235237	235242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017049	TAA	2	6	235274	235279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017049	AAT	2	6	235291	235296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017049	AAT	2	6	235306	235311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017049	ATT	2	6	235328	235333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017049	ATA	2	6	235334	235339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017049	CAC	2	6	235340	235345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_017049	ATA	2	6	235349	235354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017049	TTA	2	6	235373	235378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017049	TAG	2	6	235464	235469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017049	ATA	2	6	235475	235480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017049	TAAA	2	8	235487	235494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017049	TCA	2	6	235497	235502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1566	NC_017049	TTA	2	6	235575	235580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017049	AATTA	2	10	235658	235667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017049	ATATA	2	10	235724	235733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017049	ATTAT	2	10	235746	235755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017049	A	7	7	235759	235765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017049	TAGC	2	8	235773	235780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_017049	ACTAA	2	10	235805	235814	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1573	NC_017049	TAAAAA	2	12	235827	235838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_017049	TTA	2	6	235958	235963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_017049	GAT	2	6	236066	236071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_017049	GAA	2	6	236097	236102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017049	AAG	2	6	236112	236117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017049	ATAA	2	8	236142	236149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017049	AGT	2	6	236217	236222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017049	AAT	2	6	236236	236241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017049	ATTGC	2	10	236246	236255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_017049	TGT	2	6	236268	236273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_017049	ACC	2	6	236371	236376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1598	NC_017049	TAGA	2	8	236527	236534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017049	GATA	2	8	236568	236575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017049	TAT	2	6	236611	236616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017049	CTAT	2	8	236619	236626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_017049	TTA	2	6	236628	236633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017049	ATT	2	6	236639	236644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017049	CTT	2	6	236646	236651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017049	A	7	7	236688	236694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017049	ATA	2	6	236704	236709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017049	AATGT	2	10	236792	236801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017049	GGT	2	6	236851	236856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017049	GTA	2	6	236945	236950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017049	ATGT	2	8	236998	237005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017049	ATA	2	6	237018	237023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017049	GTAAAG	2	12	237026	237037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017049	ATT	2	6	237048	237053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017049	TAT	2	6	237165	237170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017049	TTAC	2	8	237183	237190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017049	ATC	2	6	237206	237211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_017049	TGA	2	6	237236	237241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017049	TAGTA	2	10	237244	237253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017049	T	6	6	237294	237299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017049	A	7	7	237329	237335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017049	TCA	2	6	237417	237422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017049	AAT	2	6	237454	237459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017049	TATT	2	8	242612	242619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017049	TTA	2	6	242627	242632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017049	AACAA	2	10	242673	242682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_017049	AT	3	6	242691	242696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017049	ACT	2	6	242742	242747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017049	AAGA	2	8	242760	242767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017049	TAT	3	9	242768	242776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017049	TAT	2	6	243393	243398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017049	CAT	2	6	243404	243409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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