MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 7971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017049	ATT	2	6	724210	724215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017049	AAT	2	6	724244	724249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017049	TAATTT	2	12	724259	724270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017049	T	6	6	724268	724273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017049	T	6	6	724285	724290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017049	TTTA	2	8	724293	724300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017049	ATT	2	6	724307	724312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017049	TAA	3	9	724315	724323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017049	AT	3	6	724350	724355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017049	ATG	2	6	724390	724395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017049	AGC	3	9	725280	725288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017049	ATTAC	2	10	725295	725304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_017049	CAA	2	6	725313	725318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017049	A	7	7	725335	725341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017049	ATGA	2	8	725369	725376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017049	AAT	2	6	725394	725399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017049	ATT	2	6	726275	726280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017049	ACA	2	6	726314	726319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017049	CAA	2	6	726328	726333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017049	ATT	2	6	727614	727619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017049	GATT	2	8	727628	727635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017049	TTTA	2	8	727685	727692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017049	TTG	2	6	730165	730170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017049	TTA	2	6	730202	730207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017049	ATA	2	6	730242	730247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017049	TAT	2	6	731119	731124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017049	TTG	2	6	731180	731185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017049	CACTA	2	10	731194	731203	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5029	NC_017049	GTT	2	6	731275	731280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017049	TAGAG	2	10	731282	731291	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017049	GCA	2	6	731328	731333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017049	TCT	2	6	731372	731377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017049	CGA	2	6	731391	731396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5035	NC_017049	GAA	2	6	731467	731472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017049	TTAT	2	8	731529	731536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017049	CTAA	2	8	731591	731598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_017049	ATA	2	6	731605	731610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017049	AAT	2	6	731611	731616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017049	AAC	2	6	731622	731627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017049	TTA	2	6	733020	733025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017049	AACC	2	8	733029	733036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_017049	AAT	2	6	733043	733048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017049	TACA	2	8	733064	733071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_017049	A	6	6	733076	733081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017049	ATA	2	6	733100	733105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017049	ATT	2	6	733109	733114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017049	TACA	2	8	733146	733153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017049	CAT	2	6	733159	733164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017049	ATT	3	9	733203	733211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017049	AAT	2	6	733212	733217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017049	CAA	2	6	733290	733295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017049	TAT	2	6	733334	733339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017049	TATT	2	8	733357	733364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017049	ATTA	2	8	733371	733378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017049	CAA	2	6	733385	733390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017049	ATA	2	6	733391	733396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017049	TAA	2	6	733399	733404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017049	AGA	2	6	733417	733422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017049	TA	3	6	733452	733457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017049	CTA	2	6	733543	733548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5063	NC_017049	ATA	2	6	733666	733671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017049	CATA	2	8	733699	733706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_017049	AT	3	6	733827	733832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017049	AAT	2	6	733841	733846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017049	AT	3	6	733855	733860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017049	TA	3	6	733897	733902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017049	AT	3	6	733955	733960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017049	TAC	2	6	734062	734067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5072	NC_017049	T	6	6	734259	734264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017049	AAT	2	6	734343	734348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_017049	CAATA	2	10	734421	734430	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_017049	A	6	6	734434	734439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017049	TAC	2	6	734488	734493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5081	NC_017049	ATT	2	6	734565	734570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017049	AATT	2	8	734576	734583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017049	TTAT	2	8	734595	734602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017049	TAT	2	6	734648	734653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017049	ACT	2	6	734656	734661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5089	NC_017049	TTA	2	6	734778	734783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017049	AAT	2	6	734793	734798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_017049	GTA	2	6	734850	734855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017049	TAA	2	6	735121	735126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_017049	TA	3	6	735184	735189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017049	ATT	2	6	735203	735208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017049	ATT	2	6	735215	735220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017049	ATT	2	6	735228	735233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017049	ATA	2	6	735275	735280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_017049	TAG	2	6	735398	735403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017049	AAT	2	6	735484	735489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017049	TAT	2	6	737493	737498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017049	ATT	2	6	737499	737504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017049	TTA	2	6	737517	737522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_017049	ACCTA	2	10	737538	737547	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5118	NC_017049	TAA	2	6	737570	737575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017049	ATA	2	6	737594	737599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_017049	A	6	6	738766	738771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017049	GTT	2	6	738784	738789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017049	A	8	8	738833	738840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017049	AT	3	6	739400	739405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017049	TAA	2	6	739411	739416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017049	TATTAA	2	12	739423	739434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017049	TAA	2	6	741701	741706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017049	GACT	2	8	741716	741723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_017049	TTAATA	2	12	741727	741738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017049	TGATAT	2	12	741749	741760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017049	CCTA	2	8	742396	742403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_017049	CAAAAA	2	12	742404	742415	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5133	NC_017049	AAT	2	6	742459	742464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017049	TAT	2	6	742511	742516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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