MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 1085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TAAG	2	8	736	743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	CTTA	2	8	907	914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017048	AATC	2	8	1155	1162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017048	CTTC	2	8	1189	1196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017048	ATTT	2	8	1617	1624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017048	TAAT	2	8	1656	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017048	AATA	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017048	CATA	2	8	1961	1968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017048	AATG	2	8	2085	2092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017048	CATC	2	8	3696	3703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017048	CGTT	2	8	3873	3880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017048	CTAT	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017048	CTTA	2	8	4209	4216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017048	AAAC	2	8	4236	4243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017048	AAAT	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017048	ACAT	2	8	4582	4589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017048	AGTT	2	8	4959	4966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017048	TAAA	2	8	4968	4975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017048	ATTA	2	8	5253	5260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017048	TCAT	2	8	7228	7235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017048	ATAA	2	8	7262	7269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017048	ATTA	2	8	8317	8324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017048	TAAA	2	8	8526	8533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017048	TTTA	2	8	12499	12506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017048	ATTT	2	8	12704	12711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017048	TACT	2	8	12723	12730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017048	AATA	2	8	16738	16745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017048	TTAC	2	8	20736	20743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017048	TCAT	2	8	24688	24695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017048	ACAT	2	8	24797	24804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017048	AAAG	2	8	24838	24845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017048	TACA	2	8	24968	24975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017048	TACA	2	8	25228	25235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017048	TAAA	2	8	25283	25290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017048	AATA	2	8	25886	25893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017048	TTTA	2	8	26002	26009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017048	ATTA	2	8	26043	26050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017048	TAAT	2	8	27437	27444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017048	AATT	2	8	27843	27850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017048	CTAT	2	8	30516	30523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017048	TGAA	2	8	30839	30846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017048	TAAT	2	8	31113	31120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017048	AAGA	2	8	31398	31405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017048	AAAT	2	8	31438	31445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017048	AATA	2	8	31455	31462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017048	AATT	2	8	31493	31500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017048	TACA	2	8	31709	31716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017048	ATTA	2	8	31895	31902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017048	ACAT	2	8	32780	32787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017048	AAGT	2	8	35645	35652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017048	ATGT	2	8	35691	35698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017048	ATTT	2	8	35863	35870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017048	TTTA	2	8	35926	35933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017048	TCAT	2	8	36274	36281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017048	ATTA	2	8	36331	36338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017048	TATT	2	8	36406	36413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017048	TAAT	2	8	47546	47553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017048	TTTA	2	8	49301	49308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017048	ATTT	2	8	51848	51855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017048	ATCT	2	8	52009	52016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017048	ATTT	2	8	52244	52251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017048	ATTA	2	8	53174	53181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017048	ATAA	2	8	53251	53258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017048	AGTA	2	8	53354	53361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017048	AAAG	2	8	58740	58747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017048	TAAA	2	8	58763	58770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017048	ATAA	2	8	58800	58807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017048	TTTA	2	8	59094	59101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017048	TAAT	2	8	59233	59240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017048	TTTA	2	8	59897	59904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017048	ATTT	2	8	60295	60302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017048	TTAC	2	8	60821	60828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017048	TGAG	2	8	61512	61519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017048	TCTT	2	8	62022	62029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017048	TTGT	2	8	62251	62258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017048	TAAA	2	8	62418	62425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017048	TTTA	2	8	62456	62463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017048	CATA	2	8	62899	62906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017048	AATT	2	8	62994	63001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017048	ATTT	2	8	63376	63383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017048	TTTA	2	8	64034	64041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017048	ATTT	2	8	64852	64859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017048	ATAA	2	8	64871	64878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017048	TACA	2	8	69776	69783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017048	GAAA	2	8	70148	70155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017048	GCAA	2	8	70458	70465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017048	TATT	2	8	71637	71644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017048	ATTT	2	8	71697	71704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017048	AATT	2	8	73815	73822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017048	TTTA	2	8	76245	76252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017048	TGAT	2	8	76410	76417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017048	ATTT	2	8	77863	77870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017048	GCAA	2	8	77885	77892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017048	AGAT	2	8	77959	77966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017048	TACT	2	8	81483	81490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017048	AATA	2	8	81537	81544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017048	AATC	2	8	81627	81634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017048	ATTA	2	8	81802	81809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017048	TAAA	2	8	84154	84161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017048	TAAA	2	8	84173	84180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017048	AAAT	2	8	84192	84199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017048	ATTA	2	8	84234	84241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017048	ATCT	2	8	84319	84326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017048	TTTA	2	8	84515	84522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017048	TGAT	2	8	84848	84855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017048	CATA	2	8	84983	84990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017048	TTAA	2	8	90632	90639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017048	GATT	2	8	90646	90653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017048	TTAT	2	8	90978	90985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017048	TTAA	2	8	91193	91200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017048	AATT	2	8	93481	93488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017048	AAAT	2	8	93489	93496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017048	AATG	2	8	93683	93690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017048	TTAA	2	8	94051	94058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017048	GAAA	2	8	94106	94113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017048	ATTA	2	8	94450	94457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017048	TGTT	2	8	94815	94822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017048	TAAC	2	8	94908	94915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017048	ATGA	2	8	94926	94933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017048	ATTG	2	8	96272	96279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017048	CTTT	2	8	97682	97689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017048	TATC	2	8	99880	99887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017048	TAAT	2	8	100078	100085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017048	AAAT	2	8	100398	100405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017048	ATTT	2	8	100421	100428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017048	ATTA	2	8	100598	100605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017048	TAGA	2	8	104355	104362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017048	TAAT	2	8	104553	104560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017048	ACTA	2	8	105297	105304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017048	AATT	2	8	105370	105377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017048	AACA	2	8	105893	105900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017048	AAAT	2	8	109713	109720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017048	ATTA	2	8	109877	109884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017048	AAAT	2	8	109919	109926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017048	ATAC	2	8	110135	110142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017048	ATTA	2	8	110683	110690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017048	ATTT	2	8	110878	110885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017048	AGTA	2	8	111186	111193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017048	AAAT	2	8	116691	116698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017048	ATTT	2	8	117084	117091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017048	TACA	2	8	117234	117241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017048	AATA	2	8	117297	117304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017048	AAAT	2	8	117436	117443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017048	AATT	2	8	117496	117503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017048	AGTA	2	8	119881	119888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017048	TATT	2	8	119964	119971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017048	ATTT	2	8	119992	119999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017048	ATAA	2	8	120333	120340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017048	TAGA	2	8	120778	120785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017048	GATT	2	8	121810	121817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017048	ATTA	2	8	121891	121898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017048	ATTA	2	8	122066	122073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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