MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017048	AT	3	6	145100	145105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017048	CAA	2	6	145166	145171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017048	CAG	2	6	145184	145189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017048	TAA	2	6	145218	145223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017048	GAC	2	6	145224	145229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017048	GCA	2	6	145230	145235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017048	TGG	2	6	145259	145264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017048	TTA	2	6	145314	145319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017048	TTAA	2	8	145356	145363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017048	TAA	2	6	145413	145418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017048	TAA	2	6	147607	147612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017048	TAAT	2	8	148371	148378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017048	A	6	6	148400	148405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017048	ATA	2	6	150901	150906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017048	TAT	2	6	150972	150977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017048	ACAA	2	8	150994	151001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_017048	ACT	2	6	151016	151021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017048	ATT	2	6	151032	151037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017048	TAC	2	6	151038	151043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017048	AT	3	6	151068	151073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017048	TAA	2	6	151110	151115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017048	CAGT	2	8	151229	151236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_017048	TTTTA	2	10	151254	151263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017048	T	7	7	151280	151286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017048	TAAA	2	8	151290	151297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017048	CTTT	2	8	151321	151328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_017048	T	6	6	151339	151344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017048	AT	3	6	151382	151387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017048	TAG	2	6	151407	151412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017048	AT	3	6	151471	151476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017048	TAT	2	6	151490	151495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017048	AT	3	6	151498	151503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017048	ATAA	2	8	151508	151515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017048	T	7	7	151529	151535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017048	TCTTTT	2	12	151559	151570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1536	NC_017048	TAA	2	6	151574	151579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017048	AAGC	2	8	151590	151597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_017048	ATT	2	6	151619	151624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017048	TA	3	6	151641	151646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017048	AT	3	6	151666	151671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017048	T	6	6	151692	151697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017048	GTT	2	6	151730	151735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017048	TAG	3	9	151794	151802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017048	A	6	6	151845	151850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017048	A	6	6	151871	151876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017048	TAA	2	6	151906	151911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017048	ATA	2	6	151921	151926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017048	TAA	2	6	152976	152981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017048	AAT	2	6	152985	152990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017048	T	6	6	152995	153000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017048	AAT	2	6	153007	153012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017048	CAAG	2	8	153031	153038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_017048	TAG	2	6	153095	153100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017048	TAC	2	6	153106	153111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017048	AAT	2	6	153180	153185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017048	TGA	2	6	153255	153260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017048	AT	3	6	153264	153269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017048	CTA	2	6	153319	153324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017048	TAT	2	6	153369	153374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017048	TAA	2	6	153396	153401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017048	TA	3	6	153404	153409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017048	TTA	2	6	153434	153439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017048	ATT	2	6	153449	153454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017048	TAA	2	6	153455	153460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017048	ATA	2	6	153501	153506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017048	ATT	2	6	153507	153512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017048	AGT	2	6	153514	153519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017048	TA	4	8	153520	153527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017048	TAA	3	9	153571	153579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017048	ATT	2	6	153584	153589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017048	ATA	2	6	153601	153606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017048	TAT	2	6	153665	153670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017048	ATG	2	6	153694	153699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_017048	GA	3	6	153777	153782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_017048	CT	4	8	153854	153861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_017048	CTAG	2	8	153896	153903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_017048	ATC	2	6	153910	153915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_017048	TAT	2	6	154049	154054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017048	ATT	2	6	154091	154096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017048	AT	3	6	154112	154117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_017048	TAA	2	6	154162	154167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017048	TAA	2	6	154254	154259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017048	ATT	2	6	154264	154269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017048	AAG	2	6	154355	154360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017048	ACT	2	6	154394	154399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017048	TAA	2	6	154466	154471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017048	A	6	6	154484	154489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017048	TAA	2	6	154540	154545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1610	NC_017048	AT	3	6	156939	156944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017048	TAA	2	6	156972	156977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017048	TA	3	6	156981	156986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017048	T	10	10	157040	157049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_017048	AATC	2	8	158725	158732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017048	TCT	2	6	158733	158738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_017048	TAAA	2	8	158762	158769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017048	GAA	2	6	158819	158824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017048	AGTTT	2	10	158834	158843	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017048	T	6	6	158841	158846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_017048	AAATT	2	10	159107	159116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017048	AAT	2	6	159132	159137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017048	ATT	3	9	159158	159166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017048	AATA	2	8	159170	159177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017048	GTAAA	2	10	159213	159222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017048	ACA	2	6	159272	159277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017048	ATTA	2	8	159284	159291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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