MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017048	ATT	2	6	111073	111078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017048	T	6	6	111077	111082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017048	ATT	2	6	111083	111088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017048	TAA	2	6	111171	111176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017048	AGTA	2	8	111186	111193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017048	AGT	2	6	111205	111210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017048	TAC	2	6	111214	111219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017048	GGA	2	6	111247	111252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017048	TA	3	6	111293	111298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017048	TTA	2	6	111307	111312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017048	A	7	7	111322	111328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017048	T	6	6	111334	111339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017048	T	7	7	111350	111356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017048	T	6	6	116331	116336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017048	TA	3	6	116471	116476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017048	AGT	2	6	116500	116505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017048	T	7	7	116505	116511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017048	TAA	2	6	116521	116526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017048	ATA	2	6	116559	116564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017048	GAT	2	6	116577	116582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017048	TATTT	2	10	116638	116647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017048	AAAT	2	8	116691	116698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017048	A	6	6	116708	116713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017048	ATTTTG	2	12	116717	116728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017048	ATA	2	6	116809	116814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017048	TTA	2	6	116818	116823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017048	TAT	2	6	116873	116878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017048	TGC	2	6	116891	116896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017048	T	7	7	116933	116939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017048	TGC	2	6	116975	116980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017048	AT	3	6	117020	117025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017048	TAA	2	6	117052	117057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017048	GCT	2	6	117062	117067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017048	ATTT	2	8	117084	117091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017048	TAT	2	6	117146	117151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017048	TACA	2	8	117234	117241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_017048	AATA	2	8	117297	117304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017048	CTT	2	6	117309	117314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017048	T	6	6	117326	117331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017048	AAT	2	6	117339	117344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017048	AT	4	8	117359	117366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017048	T	6	6	117395	117400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017048	AAAT	2	8	117436	117443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017048	TA	3	6	117446	117451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017048	TAG	2	6	117478	117483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017048	AATT	2	8	117496	117503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017048	AAT	2	6	117557	117562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017048	ATT	2	6	117593	117598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017048	TTA	2	6	119178	119183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017048	T	7	7	119217	119223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017048	CAC	2	6	119227	119232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017048	GT	3	6	119233	119238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017048	TA	3	6	119265	119270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017048	TAA	2	6	119296	119301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017048	ATA	2	6	119345	119350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017048	TA	3	6	119656	119661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017048	TGT	2	6	119665	119670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017048	TAA	2	6	119694	119699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017048	TAA	2	6	119716	119721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017048	ATA	3	9	119727	119735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017048	TAA	2	6	119758	119763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017048	CCA	2	6	119869	119874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_017048	AGTA	2	8	119881	119888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017048	TATT	2	8	119964	119971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017048	ATTT	2	8	119992	119999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017048	TA	3	6	120000	120005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017048	TATTT	2	10	120026	120035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017048	CTTA	2	8	120051	120058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017048	T	6	6	120061	120066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017048	TA	3	6	120080	120085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017048	TTA	2	6	120125	120130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017048	TCT	2	6	120176	120181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017048	TTA	2	6	120185	120190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017048	CCTG	2	8	120207	120214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017048	T	6	6	120218	120223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017048	ATAA	2	8	120224	120231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017048	TAA	2	6	120321	120326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017048	ATAA	2	8	120333	120340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017048	TAT	3	9	120372	120380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017048	A	6	6	120389	120394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017048	CTT	2	6	120398	120403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017048	TA	3	6	120410	120415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017048	CAT	2	6	120450	120455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017048	ATACG	2	10	120464	120473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_017048	TAA	2	6	120504	120509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017048	A	6	6	120558	120563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017048	TAA	2	6	120572	120577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017048	AAG	2	6	120639	120644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017048	TAA	2	6	120691	120696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017048	TAA	2	6	120712	120717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017048	AAG	2	6	120722	120727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017048	AGA	2	6	120742	120747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017048	TAGA	2	8	120778	120785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017048	A	6	6	120790	120795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017048	TAT	2	6	121450	121455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017048	AGA	2	6	121531	121536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017048	TAG	3	9	121568	121576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017048	TA	3	6	121594	121599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017048	AGA	2	6	121622	121627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017048	AGA	2	6	121664	121669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017048	TA	3	6	121682	121687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017048	AGC	2	6	121706	121711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017048	ATA	2	6	121737	121742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017048	TAA	2	6	121747	121752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017048	CAA	2	6	121756	121761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017048	AAT	2	6	121785	121790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017048	GATT	2	8	121810	121817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017048	AG	3	6	121834	121839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017048	A	6	6	121873	121878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017048	ATTA	2	8	121891	121898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017048	TAG	2	6	121924	121929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017048	TAA	2	6	121965	121970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017048	A	6	6	121985	121990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017048	ATT	2	6	121993	121998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017048	TA	3	6	122003	122008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017048	ATC	2	6	122021	122026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017048	ATTA	2	8	122045	122052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017048	ATTA	2	8	122066	122073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017048	TA	3	6	122093	122098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017048	GTA	2	6	122124	122129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017048	AAT	2	6	122138	122143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017048	GAA	2	6	122160	122165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017048	GGA	2	6	122190	122195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017048	TAT	2	6	122289	122294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017048	AAC	2	6	122324	122329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017048	TAGT	3	12	122380	122391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017048	TAG	2	6	122435	122440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017048	GA	3	6	122448	122453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017048	ATA	3	9	122506	122514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017048	GTC	2	6	122548	122553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017048	AT	3	6	122555	122560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017048	AGA	2	6	122561	122566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017048	CA	3	6	122568	122573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_017048	AT	3	6	122609	122614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017048	AGA	2	6	122654	122659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017048	GTA	2	6	122667	122672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_017048	TAG	2	6	122699	122704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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