MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017048	AAT	2	6	58911	58916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017048	TAC	2	6	58943	58948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017048	TTC	2	6	58970	58975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017048	ACT	2	6	58980	58985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017048	CTT	2	6	59001	59006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017048	T	9	9	59049	59057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017048	GTG	2	6	59078	59083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017048	TTTA	2	8	59094	59101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017048	AAC	2	6	59127	59132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017048	ATC	2	6	59133	59138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017048	CCTAT	2	10	59191	59200	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
512	NC_017048	AAT	2	6	59204	59209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017048	TAAT	2	8	59233	59240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017048	TGC	2	6	59274	59279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017048	ATT	2	6	59296	59301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017048	AAT	2	6	59442	59447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017048	TTA	2	6	59500	59505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017048	CTG	3	9	59534	59542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017048	TTA	2	6	59545	59550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017048	ATA	2	6	59563	59568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017048	AAT	2	6	59604	59609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017048	T	6	6	59648	59653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017048	TTA	2	6	59665	59670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017048	TCT	2	6	59674	59679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017048	TAT	2	6	59730	59735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017048	CTT	2	6	59758	59763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017048	ATA	2	6	59779	59784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017048	ATA	2	6	59800	59805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017048	T	8	8	59815	59822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017048	CAC	2	6	59851	59856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_017048	TTTA	2	8	59897	59904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017048	AGT	2	6	59957	59962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017048	TAA	2	6	59971	59976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017048	TAA	2	6	59993	59998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017048	AAT	2	6	60122	60127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017048	TA	3	6	60158	60163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017048	ATT	2	6	60195	60200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017048	TAC	2	6	60218	60223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017048	TAA	2	6	60230	60235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017048	CT	3	6	60255	60260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017048	ATG	2	6	60279	60284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017048	ATTT	2	8	60295	60302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017048	A	6	6	60307	60312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017048	ATA	2	6	60336	60341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017048	A	6	6	60355	60360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017048	AT	3	6	60394	60399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017048	AAT	2	6	60412	60417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017048	AT	3	6	60452	60457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017048	TTA	2	6	60499	60504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017048	ATT	2	6	60515	60520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017048	TTAC	2	8	60821	60828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_017048	AC	3	6	60841	60846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017048	TAA	2	6	60850	60855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017048	TACCT	2	10	60917	60926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
555	NC_017048	ATT	2	6	60998	61003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017048	TA	3	6	61030	61035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017048	TAA	2	6	61085	61090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017048	T	6	6	61111	61116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017048	T	8	8	61120	61127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017048	AAT	2	6	61165	61170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017048	TCA	2	6	61310	61315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017048	AAT	2	6	61342	61347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017048	AGT	2	6	61368	61373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017048	ATT	2	6	61402	61407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017048	TGC	2	6	61411	61416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017048	ATT	2	6	61427	61432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017048	TAT	2	6	61439	61444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017048	CTT	2	6	61445	61450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017048	TCT	2	6	61464	61469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017048	TGAG	2	8	61512	61519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017048	TA	3	6	61616	61621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017048	TAT	2	6	61701	61706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017048	AAT	2	6	61726	61731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017048	AAT	2	6	61740	61745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017048	ATA	2	6	61764	61769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017048	TTA	2	6	61812	61817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017048	GTACTT	2	12	61819	61830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
578	NC_017048	GTGTAT	2	12	61844	61855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017048	AGG	2	6	61877	61882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017048	AGT	2	6	61924	61929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017048	AAT	2	6	61947	61952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017048	TTATA	2	10	61985	61994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017048	TCTT	2	8	62022	62029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_017048	T	6	6	62080	62085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017048	TTG	2	6	62092	62097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017048	TTA	2	6	62101	62106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017048	TA	3	6	62144	62149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017048	T	9	9	62160	62168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017048	TTGT	2	8	62251	62258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017048	TTA	2	6	62280	62285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017048	ATT	2	6	62333	62338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017048	TA	3	6	62368	62373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017048	ATT	2	6	62381	62386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017048	TAAA	2	8	62418	62425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017048	TTTA	2	8	62456	62463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017048	ATA	2	6	62507	62512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017048	TAA	2	6	62545	62550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017048	ATT	2	6	62624	62629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017048	TAT	2	6	62658	62663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017048	CT	3	6	62721	62726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_017048	TATAA	2	10	62741	62750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017048	AAT	2	6	62844	62849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017048	CATA	2	8	62899	62906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_017048	CAT	2	6	62920	62925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017048	ATATTT	2	12	62969	62980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017048	AATT	2	8	62994	63001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017048	TTA	2	6	63011	63016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017048	A	7	7	63028	63034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017048	CAA	2	6	63047	63052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017048	A	6	6	63051	63056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017048	ATT	2	6	63064	63069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017048	TA	3	6	63144	63149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017048	TTA	2	6	63211	63216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017048	ATT	2	6	63227	63232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017048	TTA	2	6	63313	63318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017048	TA	3	6	63317	63322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017048	ATTT	2	8	63376	63383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017048	TGA	2	6	63394	63399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017048	TAT	2	6	63439	63444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017048	AT	3	6	63443	63448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017048	ATC	2	6	63495	63500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017048	ATATT	2	10	63509	63518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017048	TTG	2	6	63542	63547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017048	TTA	2	6	63883	63888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017048	TAATT	2	10	63923	63932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017048	T	7	7	63934	63940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017048	A	7	7	63984	63990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017048	TTA	2	6	63993	63998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017048	TTTA	2	8	64034	64041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017048	ATTT	2	8	64852	64859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017048	ATAA	2	8	64871	64878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017048	ATT	2	6	64887	64892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017048	TAA	3	9	64938	64946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017048	TAA	2	6	65883	65888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017048	AAT	2	6	65932	65937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017048	AAT	2	6	66012	66017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017048	CA	3	6	66025	66030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_017048	TAT	2	6	68183	68188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017048	TAT	2	6	68227	68232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017048	CACAA	2	10	68297	68306	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
641	NC_017048	TGA	2	6	68360	68365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017048	AAT	2	6	68366	68371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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