MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 8509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017048	GAT	2	6	616901	616906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017048	TAA	2	6	616949	616954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017048	ATA	2	6	616998	617003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017048	TAA	3	9	617012	617020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017048	A	7	7	617025	617031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017048	A	6	6	617047	617052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017048	AGC	2	6	617070	617075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017048	TAG	2	6	617109	617114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017048	AGA	2	6	617166	617171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017048	TAA	2	6	617224	617229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017048	ATA	2	6	617246	617251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017048	GTT	2	6	617300	617305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017048	TAGA	2	8	617315	617322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017048	AT	3	6	617347	617352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017048	TA	3	6	619294	619299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017048	ATT	2	6	619321	619326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017048	AT	3	6	619329	619334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017048	TAA	2	6	619418	619423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017048	T	6	6	619432	619437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017048	TAG	2	6	619464	619469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017048	TAATA	2	10	619474	619483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017048	T	7	7	619485	619491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017048	TA	4	8	619516	619523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017048	ATT	2	6	619524	619529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017048	TTTG	2	8	619540	619547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017048	GT	3	6	619608	619613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017048	ATA	2	6	619617	619622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017048	TA	3	6	619665	619670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017048	A	6	6	619717	619722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017048	ATA	2	6	619754	619759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017048	ATT	2	6	619769	619774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017048	TG	3	6	619783	619788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017048	GTT	2	6	619810	619815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017048	CTA	2	6	619825	619830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017048	TTG	2	6	619847	619852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017048	TAA	2	6	619867	619872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017048	ATTT	2	8	619897	619904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017048	AAT	2	6	619924	619929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017048	TTACTA	2	12	619932	619943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5040	NC_017048	AAAC	2	8	619944	619951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_017048	ATT	2	6	619969	619974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017048	AT	3	6	620000	620005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017048	AATA	2	8	620009	620016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017048	T	6	6	620030	620035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017048	TCT	2	6	620099	620104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017048	AGA	2	6	620146	620151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017048	TAA	2	6	620180	620185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017048	TAT	2	6	620247	620252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017048	TAT	2	6	620294	620299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017048	ACTC	2	8	620319	620326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_017048	AG	4	8	620329	620336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017048	TAA	2	6	620339	620344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017048	TTC	2	6	620349	620354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017048	T	6	6	620365	620370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017048	AC	3	6	620472	620477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_017048	AAG	2	6	620592	620597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017048	ATA	2	6	620602	620607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017048	TAT	2	6	620612	620617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017048	AGAT	2	8	620720	620727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017048	TA	3	6	620781	620786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017048	ATC	2	6	620835	620840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017048	CAA	2	6	620934	620939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017048	TAA	2	6	620945	620950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017048	T	6	6	620957	620962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017048	AAT	2	6	621023	621028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017048	AAT	2	6	621035	621040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017048	TATT	2	8	621070	621077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017048	T	6	6	621102	621107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017048	AAAAG	2	10	621108	621117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017048	ATTT	2	8	622729	622736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017048	TTA	3	9	622738	622746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017048	AAT	2	6	622839	622844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017048	ATTAA	2	10	622885	622894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017048	ATT	2	6	622914	622919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017048	A	6	6	622921	622926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017048	AT	3	6	624729	624734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017048	GC	3	6	624749	624754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_017048	AAAT	2	8	624782	624789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017048	TAT	2	6	626566	626571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017048	CAA	2	6	626607	626612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017048	ATT	2	6	626623	626628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017048	TA	3	6	626656	626661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017048	AAT	2	6	626666	626671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017048	TAGTT	2	10	626714	626723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017048	TAAT	2	8	626736	626743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_017048	AT	3	6	628838	628843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_017048	AT	3	6	630253	630258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017048	ACA	2	6	630287	630292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017048	CAAT	2	8	630329	630336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_017048	TAT	2	6	631880	631885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_017048	TAGAA	2	10	631900	631909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017048	ATTT	2	8	632018	632025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_017048	TG	3	6	632049	632054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017048	A	6	6	632062	632067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017048	TAT	2	6	632075	632080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017048	A	6	6	632081	632086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017048	TAAA	2	8	634802	634809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017048	AT	3	6	634866	634871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017048	GTA	2	6	634887	634892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_017048	GT	3	6	636050	636055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017048	CATT	2	8	636083	636090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_017048	TA	3	6	636108	636113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017048	T	6	6	636156	636161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017048	ATG	2	6	636181	636186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_017048	TTTA	2	8	636269	636276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017048	ATTA	2	8	636282	636289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017048	TA	3	6	636288	636293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017048	AAG	2	6	636337	636342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017048	AAG	2	6	636383	636388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017048	AAG	2	6	636436	636441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017048	AAT	2	6	636447	636452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017048	ATT	2	6	636459	636464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017048	TA	3	6	636491	636496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017048	ATA	3	9	636508	636516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017048	A	6	6	636526	636531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017048	GAA	2	6	636560	636565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017048	TGA	2	6	636569	636574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_017048	GTA	2	6	636683	636688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_017048	AAAG	2	8	636728	636735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017048	ATT	2	6	636766	636771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_017048	AT	3	6	636819	636824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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