MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	CTTTT	2	10	18	27	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017047	CGATG	2	10	10889	10898	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017047	TTTCC	2	10	35142	35151	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017047	ACCCC	2	10	55035	55044	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_017047	TTATT	2	10	57681	57690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017047	CTTCC	2	10	67932	67941	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017047	ACCCC	2	10	73785	73794	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_017047	TGGGG	2	10	95208	95217	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017047	AAGGA	2	10	98441	98450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017047	ACACA	2	10	98630	98639	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017047	TGGGG	2	10	124934	124943	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017047	GAAAG	2	10	126023	126032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017047	TTTCA	2	10	127556	127565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017047	CGTCA	2	10	138788	138797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017047	CACCG	2	10	138990	138999	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017047	TTTTA	2	10	143804	143813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017047	AAAAT	2	10	144164	144173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017047	AACAG	2	10	146847	146856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017047	GATGC	2	10	149545	149554	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017047	CAAAA	2	10	176697	176706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017047	TAAAA	2	10	179261	179270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017047	CACCG	2	10	182210	182219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017047	ATTTT	2	10	182538	182547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017047	CCCCA	2	10	190821	190830	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_017047	TAAGT	2	10	192646	192655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017047	GACTA	2	10	214563	214572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017047	TGGGG	2	10	238484	238493	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017047	CCCCT	2	10	252562	252571	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_017047	CGCAG	2	10	258550	258559	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017047	AAAAG	2	10	272211	272220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017047	TGGTT	2	10	289276	289285	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017047	AAATA	2	10	289330	289339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017047	GCTGG	2	10	292692	292701	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017047	GGCGG	2	10	306501	306510	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017047	TTTTA	2	10	331715	331724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017047	TTACA	2	10	381368	381377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017047	TCGGG	2	10	405982	405991	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017047	ATAAA	2	10	406210	406219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017047	AGGCT	2	10	409875	409884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017047	AGGAA	2	10	419713	419722	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017047	AAGGA	2	10	421458	421467	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017047	TCAAT	2	10	424521	424530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017047	AGTGT	2	10	428072	428081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017047	TTGTT	2	10	431352	431361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017047	CTTCG	2	10	499932	499941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017047	CCTGG	2	10	512855	512864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017047	TTTGA	2	10	538899	538908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017047	CGGCG	2	10	549721	549730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017047	TTGGG	2	10	553468	553477	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017047	TGAAA	2	10	565907	565916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017047	ATCGA	2	10	568316	568325	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017047	AATTC	2	10	568374	568383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017047	ATTTT	2	10	574698	574707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017047	ACCCC	2	10	591769	591778	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_017047	AGGGT	2	10	613476	613485	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017047	GATTT	2	10	620904	620913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017047	CTTTT	2	10	622416	622425	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017047	TGCTC	2	10	624154	624163	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017047	ACCCG	2	10	636727	636736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017047	TTAAC	2	10	645996	646005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017047	AATCA	2	10	650862	650871	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017047	TTTGA	2	10	654147	654156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017047	TATTT	2	10	658888	658897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017047	CTTTT	2	10	666766	666775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017047	ACAGC	2	10	667761	667770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017047	AACCT	2	10	667944	667953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017047	GTTCA	2	10	695537	695546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017047	TTATC	2	10	705083	705092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017047	TGTGC	2	10	709200	709209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017047	AGGGA	2	10	722555	722564	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017047	GTTGA	2	10	727864	727873	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017047	GGGCG	2	10	729989	729998	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017047	AAAAT	2	10	732318	732327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017047	TACAT	2	10	732951	732960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017047	TGCTT	2	10	741096	741105	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017047	ATAAA	2	10	743772	743781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017047	AGGCT	2	10	747572	747581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017047	CAAAA	2	10	784203	784212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017047	GAAAA	2	10	786999	787008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017047	TGGGG	2	10	798583	798592	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017047	GTCGC	2	10	798787	798796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017047	GGGCA	2	10	799241	799250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017047	AAATA	2	10	803003	803012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017047	TGGGG	2	10	820927	820936	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017047	TTTTG	2	10	839550	839559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017047	CGTGG	2	10	847935	847944	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017047	AAAAG	2	10	851854	851863	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017047	GATGA	2	10	857658	857667	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017047	CGATT	2	10	861750	861759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017047	TTAGG	2	10	896417	896426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017047	ATAAA	2	10	921886	921895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017047	AGGCT	2	10	925550	925559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017047	ACTGG	2	10	927868	927877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017047	TTCAC	2	10	958331	958340	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017047	CATTT	2	10	1001029	1001038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017047	CCGGA	2	10	1007651	1007660	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017047	AGGGA	2	10	1010489	1010498	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017047	CTTTT	2	10	1018900	1018909	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017047	TCAGA	2	10	1023075	1023084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017047	CGGCG	2	10	1023890	1023899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017047	CGCTG	2	10	1023976	1023985	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017047	GTAGG	2	10	1031341	1031350	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017047	TTTTA	2	10	1039266	1039275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017047	TAAAA	2	10	1051049	1051058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017047	CTTTT	2	10	1059488	1059497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017047	TGTTT	2	10	1073028	1073037	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017047	ATTAA	2	10	1073165	1073174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017047	AAAAC	2	10	1112974	1112983	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017047	AAAAG	2	10	1116935	1116944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017047	GGGAC	2	10	1125399	1125408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017047	TGCCT	2	10	1137281	1137290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017047	TTTTC	2	10	1163272	1163281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017047	GCATG	2	10	1164485	1164494	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017047	GCATG	2	10	1164633	1164642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017047	CCCTG	2	10	1188970	1188979	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017047	ATTTT	2	10	1189039	1189048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017047	AAATT	2	10	1189242	1189251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017047	CCATC	2	10	1215572	1215581	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017047	TGGTG	2	10	1215952	1215961	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017047	AAAAG	2	10	1216522	1216531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017047	CGTCA	2	10	1259788	1259797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017047	CGGCA	2	10	1261521	1261530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017047	CCCCA	2	10	1268082	1268091	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_017047	AATTG	2	10	1277561	1277570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017047	GGCGG	2	10	1279906	1279915	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017047	ATGTG	2	10	1314297	1314306	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017047	TGTTT	2	10	1315394	1315403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017047	TTCAT	2	10	1324284	1324293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017047	TGGGG	2	10	1326343	1326352	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017047	CTGAC	2	10	1330230	1330239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017047	CGCAA	2	10	1344928	1344937	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017047	TGGGG	2	10	1364629	1364638	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017047	TGGGG	2	10	1376842	1376851	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017047	CGAAC	2	10	1379481	1379490	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017047	AGGGG	2	10	1381621	1381630	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017047	CCTTC	2	10	1410946	1410955	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017047	GCAAG	2	10	1413179	1413188	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017047	TGGGG	2	10	1417953	1417962	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017047	TGGGG	2	10	1423738	1423747	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017047	AATTA	2	10	1428307	1428316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017047	ATTAA	2	10	1430334	1430343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017047	TGAAT	2	10	1434152	1434161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017047	AGGTT	2	10	1448718	1448727	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017047	AGAAA	2	10	1452059	1452068	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017047	ACCCC	2	10	1472398	1472407	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_017047	CACTA	2	10	1498959	1498968	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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