MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 2167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017047	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017047	AAGC	2	8	8947	8954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017047	AGTA	2	8	10298	10305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017047	TATT	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017047	TGTA	2	8	11081	11088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017047	TGTA	2	8	11109	11116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017047	GTTT	2	8	11119	11126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017047	ATAA	2	8	11281	11288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017047	GAAT	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017047	ATAA	2	8	11396	11403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017047	CAAA	2	8	22157	22164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017047	CTCC	2	8	31189	31196	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017047	CTGA	2	8	32112	32119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017047	TTTC	2	8	35111	35118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017047	GACG	2	8	35450	35457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017047	AAAG	2	8	38789	38796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017047	CGGG	2	8	38803	38810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017047	TTAA	2	8	45998	46005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017047	GGGA	2	8	55062	55069	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017047	CGGG	2	8	56446	56453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017047	ATTT	2	8	57669	57676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017047	AAAT	2	8	57801	57808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017047	GCCA	2	8	57862	57869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017047	TCAT	2	8	58009	58016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017047	ATTC	2	8	58017	58024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017047	TAAA	2	8	58041	58048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017047	GTTT	2	8	58143	58150	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017047	GGTG	2	8	58177	58184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017047	ATGG	2	8	58248	58255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017047	TCCG	2	8	59444	59451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017047	TTTC	2	8	65556	65563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017047	GATT	2	8	67802	67809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017047	AGCG	2	8	69522	69529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017047	TTAA	2	8	84476	84483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017047	GAAA	2	8	85091	85098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017047	CAGT	2	8	86951	86958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017047	CTCC	2	8	95183	95190	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017047	CCGC	2	8	98042	98049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017047	TGTT	3	12	98385	98396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017047	GCCT	2	8	100335	100342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017047	AAGA	2	8	100411	100418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017047	TTTC	2	8	104564	104571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017047	AAGC	2	8	105813	105820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017047	ACTG	2	8	107117	107124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017047	CCCG	2	8	118982	118989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017047	CTGG	2	8	119186	119193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017047	ATGT	2	8	119344	119351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017047	ATTT	2	8	123099	123106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017047	CGTT	2	8	123193	123200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017047	CGAC	2	8	123307	123314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017047	TCGG	2	8	124901	124908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017047	CTCC	2	8	124909	124916	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017047	GTCA	2	8	126077	126084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017047	GATA	2	8	126544	126551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017047	CCTG	2	8	127595	127602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017047	GGGA	2	8	131981	131988	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017047	TAAA	2	8	131996	132003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017047	ACTG	2	8	132157	132164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017047	TCAG	2	8	132192	132199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017047	AAAT	2	8	136005	136012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017047	AAAG	2	8	143702	143709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017047	GTCA	2	8	144156	144163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017047	CTGG	2	8	148828	148835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017047	CAGC	2	8	149253	149260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017047	GAAA	2	8	149472	149479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017047	CAAA	2	8	156421	156428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017047	GATG	2	8	160337	160344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017047	TGAG	2	8	162627	162634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017047	ATTT	2	8	169326	169333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017047	ATTA	2	8	170176	170183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017047	TTAA	2	8	170189	170196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017047	GCAG	2	8	174851	174858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017047	TTTA	2	8	174952	174959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017047	ATCA	2	8	175658	175665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017047	CAGC	2	8	176387	176394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017047	GCTG	2	8	176407	176414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017047	GAAT	2	8	179333	179340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017047	ACTT	2	8	179379	179386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017047	TGCT	2	8	182115	182122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017047	TGAT	2	8	182265	182272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017047	ATAA	2	8	182411	182418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017047	CCTG	2	8	185985	185992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017047	TAAA	2	8	198805	198812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017047	ATAA	2	8	198856	198863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017047	GGGC	2	8	198945	198952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017047	GAAA	2	8	199401	199408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017047	GAGG	2	8	199412	199419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017047	TATC	2	8	201132	201139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017047	GTCT	2	8	201196	201203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017047	TATT	2	8	202519	202526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017047	ATTA	2	8	204742	204749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017047	AAGC	2	8	208129	208136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017047	AGCC	2	8	210160	210167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017047	GCTC	2	8	210219	210226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017047	TAAT	2	8	228932	228939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017047	CTCC	2	8	238459	238466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_017047	CTAA	2	8	238586	238593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017047	ACAA	2	8	240178	240185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017047	GGAG	2	8	240331	240338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017047	TTTG	2	8	247704	247711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017047	CAAA	2	8	249493	249500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017047	CTGA	2	8	257289	257296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017047	CAGA	2	8	258694	258701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017047	CTTT	2	8	259680	259687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017047	TCTT	2	8	260066	260073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017047	TAAC	2	8	262835	262842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017047	TGCC	2	8	272265	272272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017047	TGAT	2	8	272301	272308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017047	GGCG	2	8	275674	275681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017047	CCTG	2	8	275682	275689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017047	GGCT	2	8	275706	275713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017047	AATT	2	8	288503	288510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017047	TAAA	2	8	289143	289150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017047	ATTC	2	8	289287	289294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017047	AACC	2	8	289507	289514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017047	CTGT	2	8	289607	289614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017047	GTGG	2	8	291920	291927	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017047	CAGG	2	8	299227	299234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017047	TTTA	2	8	302645	302652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017047	TAAA	2	8	304948	304955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017047	GACA	2	8	306344	306351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017047	GAAT	2	8	314242	314249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017047	TAAA	2	8	318752	318759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017047	TATT	2	8	319472	319479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017047	CCTG	2	8	321126	321133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017047	TTAC	2	8	324055	324062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017047	TTTG	2	8	329056	329063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017047	GCAG	2	8	330505	330512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017047	TGAA	2	8	331556	331563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017047	TAAA	2	8	344419	344426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017047	TTAA	2	8	345675	345682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017047	AAAG	2	8	352396	352403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017047	TGCG	2	8	357276	357283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017047	TAAG	2	8	363397	363404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017047	AGTT	2	8	367532	367539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017047	CAGC	2	8	370226	370233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017047	TTTG	2	8	370600	370607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017047	GGCA	2	8	370718	370725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017047	AGTG	2	8	370769	370776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017047	CATT	2	8	379577	379584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017047	CATT	2	8	381148	381155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017047	AAAC	2	8	381178	381185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017047	AGCC	2	8	392575	392582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017047	TGTA	2	8	392590	392597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017047	ATTG	2	8	401646	401653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017047	GTAG	2	8	407898	407905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017047	CTGA	2	8	408877	408884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017047	GTAC	2	8	408961	408968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017047	CGTC	2	8	409402	409409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017047	AAAG	2	8	409525	409532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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