MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017047	TAG	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017047	TCA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017047	ACA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017047	ACG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017047	AGG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017047	TTC	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017047	TCA	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017047	CAT	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017047	GTT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017047	GAC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017047	ATC	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017047	AAG	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017047	TGA	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017047	TGA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017047	TGA	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017047	ACT	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017047	CCA	2	6	11039	11044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017047	GTT	2	6	11056	11061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017047	ATA	2	6	11213	11218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017047	ATG	2	6	11408	11413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017047	TCC	2	6	11489	11494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017047	CCA	2	6	12799	12804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017047	GCA	2	6	12813	12818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017047	TAA	2	6	12942	12947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017047	AAT	2	6	14239	14244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017047	GTT	2	6	17447	17452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017047	GAA	2	6	17536	17541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017047	GAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017047	CTT	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017047	GCT	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017047	TAT	2	6	24049	24054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017047	GGA	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017047	GCG	2	6	24155	24160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017047	ATT	2	6	25432	25437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017047	ATT	2	6	27466	27471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017047	ATG	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017047	GAG	2	6	31236	31241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017047	GAA	3	9	31354	31362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017047	TCT	2	6	33119	33124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017047	CTT	2	6	33217	33222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017047	TTC	2	6	33223	33228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017047	CAG	2	6	33273	33278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017047	AGA	2	6	35071	35076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017047	AAT	2	6	35289	35294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017047	TGA	3	9	35327	35335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017047	AAC	2	6	35487	35492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017047	TTG	2	6	37523	37528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017047	GGC	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017047	GCC	2	6	39531	39536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017047	TAT	2	6	41835	41840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017047	CTC	2	6	42280	42285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017047	GCT	2	6	42995	43000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017047	GTT	2	6	45111	45116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017047	TAA	2	6	45117	45122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017047	TAA	2	6	45169	45174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017047	TGG	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017047	GAA	2	6	45187	45192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017047	CAT	3	9	45273	45281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017047	GGC	2	6	45292	45297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017047	GGC	2	6	45950	45955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017047	GAT	2	6	47105	47110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017047	GCT	2	6	52690	52695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017047	CGA	2	6	52713	52718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017047	GAG	2	6	52723	52728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017047	CTC	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017047	ATT	2	6	56491	56496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017047	CAA	2	6	56587	56592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017047	AAG	2	6	56601	56606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017047	ATT	2	6	57627	57632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017047	CAT	2	6	57639	57644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017047	ATT	2	6	57746	57751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017047	GCC	2	6	57790	57795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017047	ATC	2	6	57828	57833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017047	TTG	2	6	57849	57854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017047	TTA	2	6	58067	58072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017047	TAT	2	6	58106	58111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017047	ATT	2	6	58137	58142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017047	TGA	2	6	58200	58205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017047	CAA	2	6	58305	58310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017047	GAA	2	6	60078	60083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017047	ATG	2	6	60098	60103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017047	GAC	2	6	60116	60121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017047	CCG	2	6	60131	60136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017047	ATA	2	6	60789	60794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017047	TCG	2	6	61939	61944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017047	TGT	2	6	63237	63242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017047	CTG	2	6	63259	63264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017047	GAG	2	6	63916	63921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017047	CAG	2	6	65441	65446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017047	TTC	2	6	65540	65545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017047	GGT	2	6	67747	67752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017047	AAG	2	6	67994	67999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017047	GGA	2	6	68104	68109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017047	CGC	2	6	73696	73701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017047	CTC	2	6	73722	73727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017047	ACA	2	6	73765	73770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017047	AAG	2	6	73810	73815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017047	GAA	2	6	75110	75115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017047	TGT	2	6	75900	75905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017047	CAC	2	6	81527	81532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017047	GAT	2	6	81639	81644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017047	TTA	3	9	81645	81653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017047	CTG	2	6	83884	83889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017047	ATA	2	6	83915	83920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017047	GGC	2	6	83939	83944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017047	GTC	2	6	84462	84467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017047	TAA	2	6	84511	84516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017047	TGT	2	6	84999	85004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017047	AGG	2	6	85028	85033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017047	CCT	2	6	85040	85045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017047	ACG	2	6	85101	85106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017047	AAT	2	6	85122	85127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017047	ATG	2	6	88038	88043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017047	GAG	2	6	95279	95284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017047	TCA	2	6	95300	95305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017047	GGA	2	6	96813	96818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017047	CCG	2	6	97009	97014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017047	TAA	2	6	97967	97972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017047	TAA	2	6	97978	97983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017047	ACA	2	6	98075	98080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017047	CAC	2	6	98101	98106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017047	TGA	2	6	98165	98170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017047	TGC	2	6	98183	98188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017047	TCA	2	6	98247	98252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017047	ATT	2	6	98485	98490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017047	GCA	2	6	98570	98575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017047	CTC	2	6	100366	100371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017047	CCG	2	6	104482	104487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017047	TAA	2	6	104515	104520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017047	ATC	2	6	104580	104585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017047	CGA	2	6	105652	105657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017047	ATT	2	6	105661	105666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017047	CAT	2	6	105822	105827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017047	ACA	2	6	107091	107096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017047	CGC	2	6	112743	112748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017047	TGT	2	6	119210	119215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017047	TGA	2	6	119263	119268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017047	ATA	2	6	119276	119281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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