MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017047	TGG	2	6	1409909	1409914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017047	GGT	2	6	1409920	1409925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017047	GGC	3	9	1409985	1409993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017047	CGG	2	6	1410102	1410107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017047	GCTG	2	8	1410111	1410118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_017047	CGG	2	6	1410141	1410146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017047	ATC	2	6	1410148	1410153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017047	ATT	2	6	1410241	1410246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017047	TGG	2	6	1410251	1410256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017047	TGA	2	6	1410278	1410283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017047	CTG	2	6	1410367	1410372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017047	GAT	2	6	1410390	1410395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017047	GCT	2	6	1410427	1410432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017047	CTG	2	6	1410451	1410456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017047	TTC	2	6	1410459	1410464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017047	GCC	2	6	1410481	1410486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017047	GCG	2	6	1410583	1410588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017047	GGT	2	6	1410676	1410681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017047	CAC	2	6	1410728	1410733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_017047	CTG	2	6	1410751	1410756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017047	TGG	2	6	1410791	1410796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017047	TGC	2	6	1410855	1410860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017047	GCT	2	6	1410874	1410879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017047	A	6	6	1410898	1410903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017047	T	6	6	1410934	1410939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017047	CCTTC	2	10	1410946	1410955	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4027	NC_017047	CTC	2	6	1411864	1411869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017047	AGG	2	6	1411913	1411918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017047	GCA	2	6	1411920	1411925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017047	AGC	2	6	1411939	1411944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017047	TGA	2	6	1413077	1413082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017047	CGC	2	6	1413093	1413098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017047	TA	3	6	1413102	1413107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017047	ATT	2	6	1413120	1413125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017047	TTCA	2	8	1413161	1413168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_017047	GCAAG	2	10	1413179	1413188	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_017047	A	6	6	1414243	1414248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017047	ATT	2	6	1415872	1415877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017047	ATTT	2	8	1415881	1415888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017047	CCG	2	6	1415920	1415925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_017047	CTCC	2	8	1417928	1417935	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4042	NC_017047	TGGGG	2	10	1417953	1417962	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017047	GAG	2	6	1418051	1418056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017047	ATG	2	6	1418965	1418970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017047	A	7	7	1419032	1419038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017047	T	6	6	1420272	1420277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017047	T	6	6	1420319	1420324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017047	CTTTTT	2	12	1420365	1420376	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4049	NC_017047	T	7	7	1420372	1420378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017047	TCC	2	6	1420384	1420389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_017047	T	6	6	1420391	1420396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017047	AGG	3	9	1420421	1420429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017047	TG	3	6	1420463	1420468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017047	CAA	2	6	1420500	1420505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017047	A	6	6	1420504	1420509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017047	CTCC	2	8	1423714	1423721	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4057	NC_017047	TGGGG	2	10	1423738	1423747	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017047	CCTC	2	8	1423816	1423823	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4059	NC_017047	AGG	3	9	1423829	1423837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017047	A	6	6	1423842	1423847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017047	ATTT	2	8	1423957	1423964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017047	T	7	7	1423979	1423985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017047	CCTG	2	8	1424364	1424371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_017047	CAG	2	6	1424448	1424453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017047	AGA	2	6	1424454	1424459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017047	A	6	6	1426334	1426339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017047	T	9	9	1426388	1426396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017047	AAT	2	6	1427056	1427061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017047	GCCC	2	8	1427121	1427128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4070	NC_017047	GCAT	2	8	1427135	1427142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_017047	GGC	3	9	1427149	1427157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017047	A	6	6	1428271	1428276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017047	CTTT	2	8	1428292	1428299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_017047	T	6	6	1428297	1428302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017047	AATTA	2	10	1428307	1428316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017047	TAA	2	6	1428331	1428336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017047	ACCC	2	8	1428419	1428426	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4078	NC_017047	TGA	2	6	1428453	1428458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017047	TCA	2	6	1428469	1428474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017047	AGG	2	6	1429874	1429879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017047	AG	3	6	1429975	1429980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017047	CT	3	6	1429994	1429999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_017047	TC	3	6	1430004	1430009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_017047	GCC	2	6	1430055	1430060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_017047	TC	3	6	1430097	1430102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_017047	CTC	2	6	1430184	1430189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_017047	TAA	2	6	1430222	1430227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017047	TGA	2	6	1430236	1430241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017047	ATA	2	6	1430250	1430255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017047	TTTG	2	8	1430289	1430296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017047	T	6	6	1430328	1430333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017047	ATTAA	2	10	1430334	1430343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017047	CTG	2	6	1430361	1430366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017047	CAGA	2	8	1430461	1430468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_017047	GCTG	2	8	1430480	1430487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_017047	CAA	2	6	1430564	1430569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017047	GAG	2	6	1430869	1430874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017047	TGAG	2	8	1430919	1430926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017047	GGT	2	6	1430997	1431002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017047	AAT	2	6	1431135	1431140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017047	GCC	2	6	1431158	1431163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017047	CTT	2	6	1432620	1432625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017047	TGC	2	6	1433575	1433580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017047	TC	3	6	1433593	1433598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_017047	TCA	2	6	1433612	1433617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017047	ATG	2	6	1433626	1433631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017047	ATTA	2	8	1433646	1433653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017047	GCT	2	6	1433662	1433667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017047	TAA	2	6	1433753	1433758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017047	G	6	6	1433760	1433765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017047	A	7	7	1434141	1434147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017047	TGAAT	2	10	1434152	1434161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017047	TG	3	6	1434187	1434192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017047	TTG	2	6	1434196	1434201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017047	TGCT	2	8	1434341	1434348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_017047	TAA	2	6	1434456	1434461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017047	ATA	2	6	1434468	1434473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017047	ATG	2	6	1434491	1434496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017047	ATA	2	6	1434497	1434502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017047	A	6	6	1434514	1434519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017047	GAA	2	6	1435698	1435703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017047	CTT	2	6	1439438	1439443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017047	ATG	2	6	1441795	1441800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017047	G	6	6	1443065	1443070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017047	TTATAT	2	12	1445870	1445881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017047	TGA	2	6	1447055	1447060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017047	TTCA	2	8	1447079	1447086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_017047	ATT	2	6	1448526	1448531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017047	T	6	6	1448536	1448541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017047	CAG	2	6	1448571	1448576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_017047	TGC	2	6	1448626	1448631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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