MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017047	G	6	6	1024654	1024659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017047	GC	3	6	1024664	1024669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_017047	A	6	6	1024784	1024789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017047	ACG	2	6	1024814	1024819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017047	AAC	2	6	1024857	1024862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017047	CGG	2	6	1025002	1025007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017047	CGAT	2	8	1025013	1025020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_017047	GTT	2	6	1025119	1025124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017047	TCC	2	6	1025143	1025148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017047	TGG	2	6	1025174	1025179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017047	GGCA	2	8	1025212	1025219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_017047	GTG	2	6	1025256	1025261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017047	AGA	2	6	1025293	1025298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017047	CG	3	6	1025379	1025384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_017047	GGGC	2	8	1025424	1025431	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_017047	TGC	2	6	1025443	1025448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017047	GCG	2	6	1025488	1025493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017047	CG	3	6	1025502	1025507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_017047	GGCT	2	8	1025537	1025544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_017047	GCC	2	6	1025608	1025613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_017047	GCT	2	6	1025719	1025724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017047	TTA	2	6	1025788	1025793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017047	CTG	2	6	1025924	1025929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017047	CGG	2	6	1025968	1025973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017047	TATT	2	8	1025981	1025988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017047	AAC	2	6	1026054	1026059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017047	GGA	2	6	1026082	1026087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017047	TAA	2	6	1028365	1028370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017047	GAC	2	6	1028387	1028392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017047	ATG	2	6	1028490	1028495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017047	GTAGG	2	10	1031341	1031350	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017047	ATA	2	6	1031356	1031361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017047	GAT	2	6	1031369	1031374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017047	TGT	2	6	1032307	1032312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017047	GT	3	6	1032324	1032329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017047	CGTGTC	2	12	1032847	1032858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017047	A	6	6	1033422	1033427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017047	CTA	2	6	1033430	1033435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017047	CTGA	2	8	1033468	1033475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_017047	A	6	6	1035504	1035509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017047	CGG	2	6	1035518	1035523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017047	TGG	2	6	1035537	1035542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017047	CAT	2	6	1036292	1036297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017047	CCTTAA	2	12	1036303	1036314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017047	T	6	6	1036328	1036333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017047	TTA	2	6	1037541	1037546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017047	GGC	2	6	1037574	1037579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017047	CCG	2	6	1037608	1037613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_017047	GCTT	2	8	1037639	1037646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_017047	TG	3	6	1037659	1037664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017047	CGA	2	6	1037759	1037764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017047	CAT	2	6	1037827	1037832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017047	GAA	2	6	1037844	1037849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017047	AGC	2	6	1038129	1038134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017047	AAT	2	6	1038138	1038143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017047	GCC	2	6	1038462	1038467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_017047	ATT	2	6	1038482	1038487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017047	TGC	2	6	1038534	1038539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_017047	A	8	8	1038558	1038565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017047	CGG	2	6	1038575	1038580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_017047	CA	3	6	1038622	1038627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_017047	CAG	2	6	1038693	1038698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017047	AATG	2	8	1038868	1038875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017047	GCA	2	6	1038876	1038881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017047	CGA	2	6	1038887	1038892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017047	TTAT	2	8	1039057	1039064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017047	CGT	2	6	1039066	1039071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017047	CAT	2	6	1039100	1039105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017047	CCT	2	6	1039137	1039142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_017047	CAT	2	6	1039145	1039150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_017047	ATG	2	6	1039219	1039224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017047	AACA	2	8	1039232	1039239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_017047	TTTTA	2	10	1039266	1039275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017047	GAT	2	6	1039355	1039360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017047	ATA	2	6	1039390	1039395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017047	TAA	2	6	1039401	1039406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017047	CTTA	2	8	1039475	1039482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_017047	GTT	2	6	1039491	1039496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017047	GTG	2	6	1042218	1042223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017047	TTC	2	6	1042510	1042515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017047	TCA	2	6	1042546	1042551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017047	TGC	2	6	1042556	1042561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_017047	GCT	2	6	1042567	1042572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017047	GAT	2	6	1043894	1043899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017047	T	6	6	1044060	1044065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017047	CAGG	2	8	1044066	1044073	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_017047	ATTA	2	8	1044139	1044146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017047	TAA	2	6	1044148	1044153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017047	A	7	7	1044158	1044164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017047	T	6	6	1045069	1045074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017047	TTGATT	2	12	1045081	1045092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017047	ATG	2	6	1045094	1045099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017047	GCTT	2	8	1045101	1045108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_017047	T	6	6	1045207	1045212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017047	TCA	2	6	1045250	1045255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3097	NC_017047	AGAA	2	8	1046349	1046356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017047	TTA	2	6	1046401	1046406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017047	GGC	2	6	1046431	1046436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017047	ATC	2	6	1046437	1046442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017047	ATG	2	6	1046444	1046449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017047	T	8	8	1046484	1046491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017047	AATA	2	8	1046983	1046990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017047	CTT	2	6	1047019	1047024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3107	NC_017047	AAG	2	6	1047100	1047105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017047	A	6	6	1047111	1047116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017047	TTA	2	6	1049887	1049892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017047	T	8	8	1050730	1050737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017047	CTT	2	6	1050751	1050756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017047	AAT	2	6	1050760	1050765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017047	T	6	6	1050819	1050824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017047	GTC	2	6	1050912	1050917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017047	TAAT	2	8	1050942	1050949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017047	T	6	6	1051001	1051006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017047	CGT	2	6	1051022	1051027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017047	TAAAA	2	10	1051049	1051058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017047	A	6	6	1051055	1051060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017047	CCGA	2	8	1051221	1051228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_017047	TGAG	2	8	1051271	1051278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017047	CAC	2	6	1051280	1051285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_017047	CT	3	6	1051377	1051382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_017047	TGC	2	6	1055071	1055076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017047	TCA	2	6	1055465	1055470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_017047	TCC	2	6	1055525	1055530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_017047	T	6	6	1055554	1055559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017047	TCA	2	6	1055614	1055619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017047	A	6	6	1055651	1055656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_017047	TGT	2	6	1055735	1055740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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