MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017047	ATT	2	6	182531	182536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017047	ATTTT	2	10	182538	182547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017047	AAT	2	6	182624	182629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017047	A	7	7	185958	185964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017047	CCTG	2	8	185985	185992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017047	TG	3	6	186877	186882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017047	ACA	2	6	186894	186899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017047	TTG	2	6	186958	186963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017047	ACG	2	6	186994	186999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017047	AG	3	6	187004	187009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017047	A	7	7	187023	187029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017047	CAG	2	6	187093	187098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017047	CAA	2	6	187101	187106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017047	AC	3	6	187124	187129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017047	CAA	2	6	187134	187139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017047	CTT	2	6	187805	187810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017047	GA	3	6	187856	187861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017047	CCCCA	2	10	190821	190830	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
519	NC_017047	AAC	3	9	190841	190849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017047	AAC	2	6	190926	190931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017047	T	6	6	191290	191295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017047	TAT	2	6	191328	191333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017047	ACG	2	6	191349	191354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017047	GAG	2	6	192277	192282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017047	TAAGT	2	10	192646	192655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017047	T	8	8	192655	192662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017047	TA	3	6	192670	192675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017047	TTTTAA	2	12	192695	192706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017047	T	6	6	192708	192713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017047	T	6	6	192800	192805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017047	GAA	2	6	194198	194203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017047	CGC	2	6	195239	195244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017047	GAC	2	6	195300	195305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017047	GTG	2	6	195319	195324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017047	GCT	2	6	198195	198200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017047	ACT	2	6	198214	198219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017047	A	8	8	198225	198232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017047	T	6	6	198257	198262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017047	AAC	3	9	198268	198276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017047	CAT	2	6	198763	198768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017047	TAAA	2	8	198805	198812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017047	TTTCCG	2	12	198831	198842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017047	ATAA	2	8	198856	198863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017047	AAT	2	6	198896	198901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017047	TCT	2	6	198925	198930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017047	GGGC	2	8	198945	198952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
547	NC_017047	GT	3	6	199003	199008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017047	ACG	2	6	199015	199020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017047	GAAA	2	8	199401	199408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017047	GAGG	2	8	199412	199419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017047	A	6	6	199438	199443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017047	CTG	2	6	199450	199455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017047	CGC	2	6	201030	201035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_017047	GGAAAA	2	12	201062	201073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017047	T	7	7	201081	201087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017047	TATC	2	8	201132	201139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017047	TCC	2	6	201150	201155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_017047	ACG	2	6	201179	201184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017047	GTCT	2	8	201196	201203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017047	AG	3	6	201300	201305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017047	TATT	2	8	202519	202526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017047	TCA	2	6	202535	202540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017047	A	6	6	202610	202615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017047	TAA	2	6	202980	202985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017047	GAC	2	6	202986	202991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017047	ATTA	2	8	204742	204749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017047	CAA	2	6	204763	204768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017047	T	6	6	204811	204816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017047	TCC	2	6	208021	208026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017047	GC	3	6	208052	208057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_017047	AAC	2	6	208106	208111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017047	TTG	2	6	208120	208125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017047	AAGC	2	8	208129	208136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017047	TAA	2	6	208143	208148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017047	T	6	6	208190	208195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017047	CTC	2	6	209953	209958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_017047	A	7	7	210031	210037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017047	AATGAT	2	12	210053	210064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017047	TAT	2	6	210065	210070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017047	AGCC	2	8	210160	210167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017047	T	8	8	210178	210185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017047	GCTC	2	8	210219	210226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017047	GCC	2	6	210272	210277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_017047	TCT	2	6	210316	210321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017047	AGA	2	6	210357	210362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017047	TCT	2	6	214407	214412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017047	T	6	6	214513	214518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017047	GACTA	2	10	214563	214572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
589	NC_017047	GAG	2	6	214584	214589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017047	CAAAAG	2	12	215306	215317	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
591	NC_017047	T	7	7	215337	215343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017047	CAT	2	6	215345	215350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017047	ATA	2	6	218095	218100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017047	CTG	2	6	218229	218234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017047	ATC	2	6	218458	218463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017047	AAT	2	6	220135	220140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017047	GCA	2	6	222512	222517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017047	TGA	2	6	222592	222597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017047	TTG	2	6	223597	223602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017047	GTG	2	6	223633	223638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017047	TCC	2	6	223643	223648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017047	TAC	2	6	223654	223659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017047	T	6	6	223729	223734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017047	CTG	2	6	224379	224384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017047	GCGGTC	2	12	224390	224401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017047	ACA	2	6	224427	224432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017047	GAA	2	6	224496	224501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017047	TAT	2	6	225915	225920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017047	A	6	6	226590	226595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017047	T	6	6	226623	226628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017047	CTG	2	6	226629	226634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017047	A	6	6	227240	227245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017047	GCT	2	6	227263	227268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017047	CTA	2	6	227308	227313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017047	GGT	2	6	227324	227329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017047	CG	3	6	227386	227391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_017047	TCA	2	6	228628	228633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017047	CT	3	6	228670	228675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_017047	TTC	2	6	228705	228710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017047	TAG	2	6	228741	228746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017047	GCG	2	6	228855	228860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017047	TAAT	2	8	228932	228939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017047	CTCC	2	8	238459	238466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
624	NC_017047	TGGGG	2	10	238484	238493	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017047	GAG	2	6	238580	238585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017047	CTAA	2	8	238586	238593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_017047	TCC	2	6	240114	240119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017047	ACAA	2	8	240178	240185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_017047	TGA	2	6	240219	240224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017047	AGG	2	6	240262	240267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017047	GCT	2	6	240282	240287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017047	GGAG	2	8	240331	240338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017047	CAG	2	6	242071	242076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017047	TGC	2	6	243743	243748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017047	GCG	2	6	243758	243763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017047	AGACGA	2	12	243774	243785	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
637	NC_017047	AGC	2	6	243851	243856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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