MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 14320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017047	TCA	2	6	1796618	1796623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017047	T	6	6	1796629	1796634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017047	TGG	2	6	1796643	1796648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017047	AG	4	8	1796649	1796656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017047	AC	3	6	1796688	1796693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_017047	TGC	2	6	1796753	1796758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017047	TGA	2	6	1796845	1796850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017047	A	6	6	1796861	1796866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017047	ATAA	2	8	1796931	1796938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017047	TGT	2	6	1797006	1797011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017047	A	6	6	1797050	1797055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017047	TTAT	2	8	1797098	1797105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017047	TCAC	2	8	1798627	1798634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_017047	T	6	6	1798665	1798670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017047	GAT	2	6	1798691	1798696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017047	ATCT	2	8	1798707	1798714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_017047	AGG	2	6	1798721	1798726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017047	TGC	2	6	1799700	1799705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017047	CCA	2	6	1801995	1802000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017047	TGC	2	6	1802026	1802031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017047	GTT	2	6	1802034	1802039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017047	TTGG	2	8	1802094	1802101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017047	CAA	2	6	1802107	1802112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017047	A	6	6	1802188	1802193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017047	AGA	2	6	1802202	1802207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017047	ATC	2	6	1802219	1802224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017047	AT	4	8	1804866	1804873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017047	A	6	6	1804929	1804934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017047	ATT	2	6	1804990	1804995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017047	TA	3	6	1805009	1805014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017047	CAA	3	9	1805017	1805025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017047	ATTG	2	8	1805028	1805035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017047	TCCC	2	8	1805059	1805066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5034	NC_017047	C	6	6	1805064	1805069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5035	NC_017047	GCA	2	6	1805078	1805083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017047	CTG	2	6	1805084	1805089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017047	CCTC	2	8	1805092	1805099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5038	NC_017047	CAGG	2	8	1805219	1805226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_017047	ATT	2	6	1805235	1805240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017047	TTG	2	6	1805264	1805269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017047	TGC	2	6	1805297	1805302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017047	T	6	6	1806008	1806013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017047	CTG	2	6	1806096	1806101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017047	T	6	6	1806134	1806139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017047	TGGC	2	8	1806153	1806160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_017047	TCC	2	6	1806207	1806212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_017047	GCC	2	6	1806248	1806253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_017047	TA	3	6	1806336	1806341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017047	GTT	2	6	1806348	1806353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017047	TTG	2	6	1806366	1806371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017047	ATT	2	6	1806374	1806379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017047	TTAT	2	8	1806380	1806387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017047	T	6	6	1806405	1806410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017047	ATT	2	6	1806439	1806444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017047	TGGG	2	8	1806452	1806459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017047	ATT	2	6	1806460	1806465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017047	A	6	6	1806490	1806495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017047	GGC	2	6	1808094	1808099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017047	GTA	2	6	1808702	1808707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017047	ATC	2	6	1808758	1808763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017047	CGCA	2	8	1808816	1808823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_017047	GGAACC	2	12	1808849	1808860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017047	CG	3	6	1809036	1809041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_017047	AGT	2	6	1809058	1809063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017047	G	6	6	1809093	1809098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017047	GGCT	2	8	1809108	1809115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_017047	TA	3	6	1809141	1809146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017047	TCCA	2	8	1809269	1809276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_017047	A	6	6	1809276	1809281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017047	TCA	2	6	1809347	1809352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017047	TCA	2	6	1809371	1809376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017047	CATG	2	8	1809455	1809462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_017047	ATT	2	6	1810829	1810834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017047	T	6	6	1810833	1810838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017047	CGG	2	6	1812023	1812028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017047	TCA	2	6	1812033	1812038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017047	TTA	2	6	1812051	1812056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017047	CAT	2	6	1812681	1812686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017047	AGGG	2	8	1812725	1812732	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017047	A	6	6	1812769	1812774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017047	CGG	2	6	1813456	1813461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017047	GATG	2	8	1813537	1813544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017047	ATA	2	6	1814921	1814926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017047	T	7	7	1814927	1814933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017047	AGGGA	2	10	1815020	1815029	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017047	CG	3	6	1817220	1817225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_017047	AAC	2	6	1817249	1817254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017047	AAC	2	6	1817259	1817264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017047	TATTG	2	10	1817275	1817284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017047	CTG	2	6	1817337	1817342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_017047	TTTA	2	8	1820745	1820752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017047	GTT	2	6	1820761	1820766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017047	TGG	2	6	1820781	1820786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_017047	GCG	2	6	1820827	1820832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_017047	TGGG	2	8	1822693	1822700	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017047	GA	3	6	1822771	1822776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017047	T	7	7	1823621	1823627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017047	CTG	2	6	1823640	1823645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017047	TCTG	2	8	1823670	1823677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_017047	TCA	2	6	1823679	1823684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017047	CCG	2	6	1823693	1823698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_017047	GCG	2	6	1824244	1824249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017047	TTC	2	6	1824375	1824380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017047	TTGG	2	8	1824422	1824429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017047	AATC	2	8	1824455	1824462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5109	NC_017047	ACG	2	6	1824745	1824750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017047	GTGAC	2	10	1824816	1824825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5111	NC_017047	CCG	2	6	1824858	1824863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_017047	GGA	3	9	1824882	1824890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017047	GCAG	2	8	1826674	1826681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017047	GC	3	6	1826688	1826693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_017047	GTT	2	6	1826700	1826705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017047	TCTG	2	8	1826722	1826729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_017047	CGG	2	6	1827170	1827175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017047	GTC	2	6	1827228	1827233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5120	NC_017047	GCGG	2	8	1828119	1828126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_017047	GGCA	2	8	1828129	1828136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_017047	GA	3	6	1828759	1828764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017047	GCC	2	6	1828933	1828938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_017047	T	6	6	1828939	1828944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017047	GCT	2	6	1828971	1828976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017047	GCG	2	6	1828984	1828989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017047	TG	3	6	1829122	1829127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017047	CGC	2	6	1829142	1829147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_017047	GGT	2	6	1829154	1829159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017047	TTC	2	6	1829205	1829210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017047	CGTG	2	8	1829263	1829270	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5133	NC_017047	GAA	2	6	1829393	1829398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_017047	CTG	2	6	1829639	1829644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_017047	TATT	3	12	1874310	1874321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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