MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017044	ATA	2	6	609998	610003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017044	CTG	2	6	610076	610081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017044	CAATG	2	10	610104	610113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_017044	GTA	2	6	610126	610131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017044	TGCC	2	8	610229	610236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_017044	GGC	2	6	610396	610401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017044	ATA	2	6	610427	610432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017044	AGT	2	6	610443	610448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017044	AGA	2	6	610518	610523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017044	TA	3	6	610527	610532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017044	TTAA	2	8	610618	610625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017044	CTG	2	6	610628	610633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_017044	A	6	6	610640	610645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017044	GCG	2	6	610694	610699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017044	CTA	2	6	610727	610732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017044	TTA	2	6	610733	610738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017044	ATA	2	6	610751	610756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017044	TAGAA	2	10	610767	610776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017044	ATA	2	6	610841	610846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017044	ATA	2	6	610881	610886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017044	TGGTA	2	10	610924	610933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017044	TGCAAA	2	12	610954	610965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3523	NC_017044	AT	3	6	611047	611052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017044	ATT	2	6	611152	611157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017044	T	6	6	611156	611161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017044	ATA	2	6	611198	611203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017044	ATA	2	6	611238	611243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017044	A	6	6	611259	611264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017044	A	6	6	611405	611410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017044	TAA	2	6	611448	611453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017044	AT	3	6	611465	611470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017044	GATG	2	8	611485	611492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017044	GAA	2	6	611500	611505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017044	TAAT	2	8	611525	611532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017044	AGG	2	6	611556	611561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017044	TAG	2	6	612454	612459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017044	TCAT	2	8	614456	614463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_017044	TAG	2	6	615125	615130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017044	A	7	7	615158	615164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017044	A	6	6	615191	615196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017044	ATA	2	6	615400	615405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017044	TAA	2	6	615459	615464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017044	TCA	2	6	616842	616847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017044	GAG	2	6	616852	616857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017044	GTT	2	6	616860	616865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017044	T	6	6	616907	616912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017044	TAAT	2	8	618041	618048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017044	TATAT	2	10	618076	618085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017044	TAA	2	6	618089	618094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017044	AT	3	6	620482	620487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017044	AGTAA	2	10	620506	620515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017044	TCAA	2	8	620530	620537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_017044	TAT	3	9	620582	620590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017044	CT	3	6	620594	620599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_017044	TTG	2	6	620639	620644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017044	TAA	2	6	620705	620710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017044	T	6	6	620719	620724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017044	TGC	2	6	620763	620768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_017044	TAC	2	6	620769	620774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_017044	GTA	2	6	620806	620811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017044	AAATT	2	10	620907	620916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017044	T	7	7	620939	620945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017044	CGT	2	6	620953	620958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017044	GTC	2	6	621034	621039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017044	TAT	2	6	621090	621095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017044	A	6	6	621099	621104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017044	ATTA	2	8	621118	621125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017044	ATTA	2	8	621373	621380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017044	TGG	2	6	621398	621403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017044	CTC	2	6	621472	621477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_017044	TAA	3	9	621488	621496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017044	TAA	2	6	621578	621583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017044	AGAT	2	8	621604	621611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017044	CAA	2	6	621626	621631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_017044	CTAA	2	8	621673	621680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_017044	CT	3	6	621681	621686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_017044	TGC	2	6	621756	621761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_017044	TACT	2	8	621791	621798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_017044	ATAA	2	8	621814	621821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_017044	TAC	2	6	621822	621827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017044	G	6	6	621844	621849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017044	ATA	2	6	621850	621855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017044	TAG	2	6	621876	621881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017044	ATA	2	6	621886	621891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017044	CTA	2	6	621977	621982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_017044	GAC	2	6	622024	622029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_017044	TAC	2	6	622080	622085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_017044	AGG	2	6	622158	622163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017044	TAA	2	6	622173	622178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017044	GCG	2	6	622190	622195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_017044	ATT	2	6	622236	622241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017044	ACAA	2	8	622251	622258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_017044	AAAT	2	8	622265	622272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017044	TAA	2	6	622280	622285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017044	ATA	2	6	622331	622336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017044	GCA	2	6	622354	622359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_017044	ATA	2	6	622383	622388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017044	ATG	2	6	622407	622412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017044	TAG	2	6	622513	622518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017044	GTGG	2	8	622591	622598	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017044	ATT	2	6	622605	622610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017044	CAGTT	2	10	622647	622656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_017044	CGG	2	6	622902	622907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017044	AATT	2	8	623041	623048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017044	TTTC	2	8	623067	623074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_017044	TTA	2	6	623085	623090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017044	ATT	2	6	623126	623131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017044	TTA	2	6	623135	623140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017044	TAGA	2	8	623180	623187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017044	ATA	2	6	623191	623196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017044	AGTT	2	8	623274	623281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017044	T	6	6	623280	623285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017044	ATA	2	6	623286	623291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017044	T	6	6	623363	623368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017044	TA	3	6	623483	623488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017044	AAAAT	2	10	623575	623584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017044	TA	3	6	623628	623633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017044	TTC	2	6	623638	623643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_017044	A	6	6	623677	623682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017044	ACT	2	6	623755	623760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017044	ATT	2	6	623777	623782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017044	A	6	6	623804	623809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017044	TAG	2	6	623818	623823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017044	TAA	2	6	623836	623841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017044	TAA	2	6	623855	623860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017044	TTA	2	6	623861	623866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017044	TAAA	2	8	624190	624197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017044	TAA	2	6	624206	624211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017044	AATT	2	8	624235	624242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017044	TA	3	6	624267	624272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_017044	ATT	2	6	624276	624281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_017044	CGT	2	6	625383	625388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_017044	GTAA	2	8	626315	626322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_017044	CT	3	6	626372	626377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3635	NC_017044	AAT	2	6	627473	627478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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