MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017044	T	7	7	515177	515183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017044	T	7	7	515191	515197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017044	AATA	2	8	515198	515205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017044	TTG	2	6	515259	515264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017044	T	7	7	517073	517079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017044	ATGTT	2	10	517101	517110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017044	TAT	2	6	517189	517194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017044	T	6	6	517194	517199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017044	TAA	2	6	517215	517220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017044	T	6	6	517235	517240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017044	AT	3	6	517252	517257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017044	A	6	6	519640	519645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017044	TTG	2	6	519649	519654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017044	AT	3	6	519699	519704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017044	AT	3	6	519708	519713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017044	TCT	2	6	519868	519873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017044	CCA	2	6	519879	519884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_017044	ACA	2	6	519896	519901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_017044	TAT	2	6	519912	519917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017044	TTA	2	6	519943	519948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017044	GAT	2	6	519964	519969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017044	GATTA	2	10	519984	519993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017044	A	6	6	519996	520001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017044	ATT	2	6	520036	520041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017044	A	6	6	520071	520076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3027	NC_017044	A	6	6	520090	520095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017044	T	7	7	520291	520297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017044	ATAA	2	8	520300	520307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017044	T	6	6	520310	520315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017044	ATACCG	2	12	520675	520686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017044	GGT	2	6	520694	520699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017044	TTA	2	6	520732	520737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017044	A	7	7	520766	520772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017044	TTA	2	6	522923	522928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017044	AAAT	2	8	523009	523016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017044	TAAA	2	8	523039	523046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017044	TGA	2	6	524372	524377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017044	TTA	2	6	524396	524401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017044	ATA	2	6	524516	524521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017044	AGA	2	6	525555	525560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017044	A	6	6	525560	525565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017044	CAT	2	6	525670	525675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017044	TTAATT	2	12	526549	526560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017044	AT	3	6	526580	526585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017044	GAA	2	6	526623	526628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017044	GCT	2	6	526710	526715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017044	CTA	2	6	526778	526783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3050	NC_017044	AAT	2	6	526900	526905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017044	TAA	2	6	526908	526913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017044	T	6	6	526984	526989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017044	ATA	2	6	526991	526996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017044	CCTG	2	8	527002	527009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_017044	AAAG	2	8	527082	527089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017044	AGA	2	6	527347	527352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017044	T	6	6	527387	527392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_017044	TAT	2	6	527491	527496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017044	TATT	2	8	530327	530334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017044	ATT	3	9	530336	530344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017044	A	6	6	530406	530411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017044	T	7	7	530421	530427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017044	ATT	2	6	530428	530433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017044	TCA	2	6	530445	530450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3067	NC_017044	TAT	2	6	531749	531754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017044	TCATTG	2	12	531757	531768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3070	NC_017044	A	7	7	531808	531814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017044	T	6	6	531824	531829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017044	AAT	2	6	531899	531904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017044	TATT	2	8	531909	531916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017044	TCG	2	6	532917	532922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_017044	TAT	2	6	534792	534797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017044	ATTTA	2	10	535344	535353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017044	T	6	6	536223	536228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017044	TA	3	6	536641	536646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_017044	TTA	2	6	536718	536723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_017044	GATA	2	8	536761	536768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017044	T	7	7	536780	536786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017044	ATTTT	2	10	536795	536804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_017044	AAT	2	6	537885	537890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_017044	AAT	2	6	537903	537908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017044	ACT	2	6	538666	538671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3100	NC_017044	AATA	2	8	538752	538759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017044	ATT	2	6	538780	538785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017044	TAA	2	6	538805	538810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017044	GAG	2	6	539490	539495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017044	ACA	2	6	539538	539543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017044	ATTAA	2	10	539572	539581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017044	A	6	6	541047	541052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017044	T	6	6	541057	541062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017044	CAA	2	6	541114	541119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017044	TAG	2	6	541126	541131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3111	NC_017044	AT	3	6	543170	543175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017044	AGG	2	6	543213	543218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_017044	ATGTC	2	10	544209	544218	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3115	NC_017044	A	6	6	544286	544291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017044	TAG	2	6	544336	544341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017044	CAA	2	6	544353	544358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017044	GCGA	2	8	545357	545364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_017044	TTG	2	6	545374	545379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017044	GTTT	2	8	545384	545391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017044	A	7	7	545449	545455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017044	ATA	2	6	548038	548043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017044	ATA	2	6	548079	548084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017044	AATA	2	8	548091	548098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017044	ATT	2	6	548106	548111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017044	TTA	2	6	548118	548123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017044	AT	3	6	548135	548140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017044	AATTTA	2	12	548142	548153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017044	ATAA	2	8	548154	548161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017044	TAT	2	6	549306	549311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017044	TAT	2	6	549317	549322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017044	TTC	2	6	549342	549347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_017044	T	7	7	549420	549426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017044	CGT	2	6	549449	549454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_017044	CTC	2	6	549466	549471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3136	NC_017044	ATG	3	9	549475	549483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017044	GCA	2	6	549497	549502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_017044	A	6	6	551505	551510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3272	NC_017044	TAT	2	6	567584	567589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3413	NC_017044	AT	3	6	599876	599881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_017044	CTTT	2	8	600071	600078	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3415	NC_017044	TTA	2	6	600124	600129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3416	NC_017044	T	6	6	600131	600136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3417	NC_017044	GCTTGT	2	12	600142	600153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3418	NC_017044	AT	3	6	600199	600204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3419	NC_017044	TTATT	2	10	600259	600268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3420	NC_017044	T	6	6	600277	600282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3421	NC_017044	TA	3	6	600316	600321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3422	NC_017044	TGT	2	6	600326	600331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3423	NC_017044	TTCA	2	8	600395	600402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3424	NC_017044	CAG	3	9	600412	600420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3426	NC_017044	AT	3	6	600441	600446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3427	NC_017044	ATTTA	2	10	600503	600512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3428	NC_017044	T	6	6	600588	600593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3429	NC_017044	TAAA	2	8	600617	600624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3430	NC_017044	TGA	2	6	600644	600649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3431	NC_017044	TAA	2	6	600683	600688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_017044	TAT	4	12	600718	600729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_017044	GTG	2	6	600811	600816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_017044	TTA	2	6	600826	600831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_017044	TCA	2	6	600834	600839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3436	NC_017044	T	6	6	600842	600847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3440	NC_017044	TTC	2	6	601240	601245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3442	NC_017044	T	6	6	601273	601278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3445	NC_017044	CAT	2	6	601433	601438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3450	NC_017044	T	6	6	602266	602271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3451	NC_017044	AT	3	6	602273	602278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_017044	TAA	3	9	602290	602298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3464	NC_017044	AT	3	6	605436	605441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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