MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017044	ATA	2	6	436256	436261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_017044	ATA	2	6	436395	436400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_017044	TTG	2	6	436404	436409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017044	TAATT	2	10	436414	436423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_017044	CTC	2	6	436461	436466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_017044	AAGCT	2	10	436470	436479	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2507	NC_017044	A	6	6	436527	436532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_017044	GCA	2	6	436556	436561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_017044	TCC	2	6	436590	436595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_017044	TGC	2	6	436617	436622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_017044	TCT	2	6	436626	436631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_017044	TAC	2	6	436637	436642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_017044	GTA	2	6	436673	436678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_017044	ATT	2	6	436748	436753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_017044	A	7	7	436791	436797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_017044	TAT	2	6	436835	436840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_017044	CAG	2	6	436867	436872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_017044	AGC	2	6	436968	436973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_017044	TAT	2	6	437073	437078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_017044	GATTT	2	10	437084	437093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_017044	GAA	2	6	437155	437160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_017044	AT	3	6	437166	437171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_017044	AAGT	2	8	437189	437196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_017044	TAA	2	6	437367	437372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_017044	A	6	6	438144	438149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_017044	TA	3	6	439774	439779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_017044	T	6	6	439845	439850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_017044	TAA	2	6	439856	439861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_017044	TTA	2	6	439919	439924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_017044	ATTG	2	8	439973	439980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_017044	TA	3	6	439994	439999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_017044	AGTT	2	8	440017	440024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_017044	A	7	7	440052	440058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_017044	ATT	2	6	440074	440079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_017044	ATA	2	6	440108	440113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_017044	CGT	2	6	441156	441161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_017044	CGCTC	2	10	441197	441206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2538	NC_017044	CAA	2	6	441599	441604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_017044	CTC	2	6	441650	441655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_017044	ACT	2	6	441699	441704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_017044	ATT	2	6	442301	442306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_017044	T	7	7	442325	442331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_017044	TAA	2	6	442468	442473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_017044	AGC	2	6	442514	442519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_017044	A	6	6	442544	442549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017044	TAA	2	6	442550	442555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_017044	AAT	2	6	442677	442682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_017044	GTG	2	6	442694	442699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_017044	GTT	2	6	442702	442707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_017044	ATT	2	6	442846	442851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_017044	AT	3	6	442867	442872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_017044	A	6	6	442874	442879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_017044	AAT	2	6	442908	442913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017044	ATTC	2	8	442927	442934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_017044	TAG	2	6	442985	442990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017044	AAT	2	6	443008	443013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017044	GCT	2	6	443203	443208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_017044	TA	3	6	443209	443214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017044	TTA	2	6	443265	443270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_017044	CTA	2	6	443272	443277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_017044	TA	3	6	443375	443380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_017044	GAA	2	6	443419	443424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_017044	TAA	2	6	443431	443436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017044	ATT	2	6	443451	443456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_017044	ATT	2	6	443478	443483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2569	NC_017044	TAA	2	6	443593	443598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_017044	ATT	2	6	443613	443618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_017044	GTA	2	6	443630	443635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2581	NC_017044	AGA	2	6	444158	444163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_017044	A	6	6	444319	444324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2592	NC_017044	AG	3	6	445049	445054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_017044	TTA	2	6	448863	448868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017044	AATTCT	2	12	448896	448907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2599	NC_017044	TAT	3	9	449659	449667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_017044	ATT	2	6	449992	449997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2605	NC_017044	TAA	2	6	450218	450223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2609	NC_017044	TA	3	6	450878	450883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2613	NC_017044	TAT	2	6	451892	451897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017044	A	7	7	451908	451914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_017044	ATT	2	6	452183	452188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_017044	T	6	6	452211	452216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_017044	AAT	2	6	452217	452222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_017044	AAT	2	6	452225	452230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_017044	TAAT	2	8	453808	453815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_017044	GAG	2	6	454315	454320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_017044	TTG	2	6	454321	454326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2625	NC_017044	TAG	2	6	454548	454553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_017044	AT	3	6	454850	454855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_017044	GAACC	2	10	454867	454876	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2628	NC_017044	ATAA	2	8	454889	454896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_017044	T	6	6	455834	455839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_017044	GAAT	2	8	455908	455915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_017044	TA	4	8	455934	455941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_017044	AAT	2	6	459407	459412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_017044	TAAC	2	8	459965	459972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2634	NC_017044	A	6	6	459986	459991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_017044	TCC	2	6	459992	459997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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