MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017044	TA	4	8	270187	270194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017044	T	6	6	272487	272492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017044	AT	3	6	272514	272519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017044	A	7	7	272528	272534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017044	AGC	2	6	273160	273165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017044	ATA	2	6	273192	273197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017044	ATGACG	2	12	273240	273251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_017044	ATA	2	6	275297	275302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017044	A	7	7	275317	275323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017044	TTA	2	6	275704	275709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017044	TCGC	2	8	275738	275745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_017044	ATG	2	6	275786	275791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017044	ATTC	2	8	275840	275847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_017044	TC	3	6	275846	275851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_017044	CT	3	6	275907	275912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_017044	TAA	2	6	275937	275942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017044	AT	3	6	275968	275973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017044	TAAA	2	8	275985	275992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017044	ATT	2	6	276020	276025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017044	T	6	6	276079	276084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017044	A	6	6	277178	277183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017044	TTA	2	6	277201	277206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017044	GA	3	6	277242	277247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017044	ATTGCA	2	12	277281	277292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1525	NC_017044	A	6	6	277304	277309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017044	AT	3	6	277317	277322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017044	TGA	2	6	277328	277333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017044	CAA	2	6	277336	277341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017044	TAC	2	6	277406	277411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017044	TAT	2	6	277439	277444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017044	TTC	2	6	277714	277719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017044	TGC	2	6	277727	277732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017044	A	7	7	277766	277772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017044	A	6	6	277815	277820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017044	TAT	2	6	277890	277895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017044	TAG	2	6	277939	277944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017044	TAT	2	6	277986	277991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017044	ACC	2	6	278024	278029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_017044	GGT	2	6	278046	278051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017044	AT	3	6	278269	278274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017044	GTC	2	6	278326	278331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017044	TTG	2	6	278352	278357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017044	ATTTC	2	10	278370	278379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_017044	A	6	6	278400	278405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017044	TA	3	6	278439	278444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017044	A	6	6	278453	278458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017044	CAA	2	6	278499	278504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017044	GCA	2	6	278511	278516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017044	AAT	2	6	278536	278541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017044	GAAA	2	8	278570	278577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017044	TAT	2	6	278580	278585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017044	TAT	2	6	278591	278596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017044	GTT	2	6	281360	281365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017044	GTC	2	6	281433	281438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017044	GAG	2	6	281444	281449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017044	TTG	2	6	281453	281458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017044	CAA	2	6	281531	281536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017044	AGC	2	6	281546	281551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017044	ATA	2	6	281578	281583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017044	TTA	2	6	281644	281649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017044	C	7	7	281675	281681	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1562	NC_017044	TC	3	6	281719	281724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_017044	TAA	2	6	281727	281732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017044	T	7	7	281763	281769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017044	ACT	2	6	281770	281775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017044	TCTT	2	8	281810	281817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_017044	ATT	2	6	281848	281853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017044	ATT	2	6	282076	282081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017044	TGTT	2	8	282100	282107	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017044	TTA	2	6	282121	282126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017044	AT	3	6	282139	282144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017044	TC	3	6	282164	282169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017044	ATT	2	6	282220	282225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017044	TAG	2	6	282246	282251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017044	TAT	2	6	282252	282257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017044	TG	3	6	282281	282286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017044	ATTGG	2	10	282298	282307	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017044	TTG	2	6	282326	282331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017044	TTG	2	6	282346	282351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017044	TA	3	6	282355	282360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017044	TTAT	2	8	282367	282374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017044	TGA	2	6	282402	282407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017044	ATT	2	6	282421	282426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017044	TCTT	2	8	282479	282486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_017044	TTATT	2	10	282489	282498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017044	TAGC	2	8	282527	282534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_017044	ATG	2	6	282544	282549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017044	TTA	2	6	282587	282592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017044	ATA	2	6	282626	282631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017044	ATA	2	6	282635	282640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017044	CTCG	2	8	282646	282653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_017044	TTG	2	6	282685	282690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017044	TAA	2	6	283035	283040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017044	T	6	6	283261	283266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017044	TA	3	6	283284	283289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017044	TG	3	6	283322	283327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017044	AT	3	6	283335	283340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017044	TAA	2	6	283344	283349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017044	CCT	2	6	283788	283793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_017044	TTAT	2	8	283810	283817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017044	TAT	2	6	283840	283845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017044	T	6	6	283845	283850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017044	ATT	2	6	283858	283863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017044	ATT	2	6	283874	283879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017044	TAT	2	6	283895	283900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017044	CTTT	2	8	283930	283937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_017044	ATTAAA	2	12	283961	283972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017044	TAT	3	9	285427	285435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017044	A	6	6	285446	285451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017044	TAAT	2	8	285540	285547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017044	TAG	2	6	285549	285554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017044	ATG	2	6	285555	285560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017044	TAAAAT	2	12	286049	286060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017044	ATA	2	6	286184	286189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017044	AAT	2	6	286227	286232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017044	AATT	2	8	286238	286245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017044	ATA	2	6	286288	286293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017044	TGG	2	6	286302	286307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017044	ACCT	2	8	286406	286413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017044	TTA	2	6	286417	286422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017044	GGA	2	6	286488	286493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017044	TAG	2	6	286517	286522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017044	A	7	7	286556	286562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017044	ACA	2	6	286571	286576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017044	ACC	2	6	286677	286682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_017044	CT	3	6	286698	286703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_017044	TTAG	2	8	286926	286933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017044	ACT	2	6	287012	287017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017044	TCAA	2	8	287177	287184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_017044	CAGA	2	8	287213	287220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_017044	AGA	2	6	287310	287315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017044	AAC	2	6	287320	287325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017044	AGC	2	6	287343	287348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_017044	CAT	2	6	287349	287354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017044	AAAG	2	8	287357	287364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017044	CAA	2	6	287402	287407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_017044	CCTGAA	2	12	287676	287687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1771	NC_017044	TATGA	2	10	307029	307038	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_017044	TAA	2	6	329882	329887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_017044	ATT	2	6	329898	329903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_017044	ATA	2	6	330247	330252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_017044	TCA	2	6	330972	330977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_017044	TAA	2	6	333158	333163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_017044	A	7	7	333209	333215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_017044	AGA	2	6	333824	333829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1949	NC_017044	GTT	2	6	338303	338308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_017044	T	6	6	338370	338375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_017044	TTTAT	2	10	338381	338390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1956	NC_017044	TAA	2	6	338516	338521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_017044	A	6	6	338528	338533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_017044	ATT	2	6	346540	346545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_017044	A	8	8	346556	346563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1987	NC_017044	TAA	2	6	348965	348970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_017044	TTTAA	2	10	354456	354465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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