MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017044	AAATC	2	10	182120	182129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_017044	TTTAA	2	10	182188	182197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017044	ATAA	2	8	182303	182310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017044	TA	3	6	182320	182325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017044	ATT	2	6	182359	182364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017044	TAA	2	6	182392	182397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017044	GAGAG	2	10	182405	182414	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017044	TTA	2	6	182416	182421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017044	A	7	7	182429	182435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017044	ATT	2	6	182472	182477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017044	TCAG	2	8	182528	182535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_017044	A	6	6	186690	186695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017044	T	6	6	186700	186705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017044	GAG	2	6	186812	186817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017044	TA	3	6	186891	186896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017044	GTC	2	6	191075	191080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017044	CGCTC	2	10	191115	191124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1018	NC_017044	A	6	6	191186	191191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017044	ATA	2	6	191239	191244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017044	GGT	2	6	191301	191306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017044	CAA	2	6	191314	191319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017044	TAC	2	6	191359	191364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017044	ATT	2	6	191367	191372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017044	A	8	8	191376	191383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017044	A	6	6	191390	191395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017044	T	6	6	191401	191406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017044	ATT	2	6	192616	192621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017044	A	6	6	192654	192659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017044	TTTTA	2	10	192692	192701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017044	AT	3	6	192707	192712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017044	ATA	2	6	192762	192767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017044	GTC	2	6	194321	194326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017044	AGC	2	6	194333	194338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017044	TTAC	2	8	194388	194395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_017044	A	6	6	194417	194422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017044	AT	5	10	195330	195339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017044	AAGAG	2	10	195368	195377	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017044	TA	3	6	195873	195878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017044	TAA	2	6	195893	195898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017044	GTT	2	6	197727	197732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017044	A	7	7	197746	197752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017044	A	6	6	197756	197761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017044	AAT	2	6	197891	197896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017044	GTT	2	6	200053	200058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017044	TCA	2	6	200075	200080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017044	T	7	7	200129	200135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017044	ATT	2	6	200136	200141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017044	T	6	6	200140	200145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017044	ATG	2	6	200178	200183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017044	CAA	2	6	200198	200203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017044	CAA	2	6	200245	200250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017044	A	6	6	200334	200339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017044	ATA	2	6	201123	201128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017044	T	6	6	201150	201155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017044	TAA	2	6	201907	201912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017044	AGTA	2	8	201919	201926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017044	TA	3	6	201979	201984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017044	TTA	2	6	202010	202015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017044	ACG	2	6	202017	202022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017044	ATTG	2	8	202063	202070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017044	T	6	6	202085	202090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017044	TAA	2	6	202100	202105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017044	A	6	6	202136	202141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017044	GCA	2	6	202153	202158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017044	A	6	6	202158	202163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017044	AAT	2	6	203366	203371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017044	TTG	2	6	203418	203423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017044	GTA	2	6	203459	203464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017044	GCT	2	6	203515	203520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017044	CAA	2	6	203547	203552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017044	GCT	2	6	203561	203566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017044	TAT	2	6	206865	206870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017044	GTC	2	6	206932	206937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017044	ATTT	2	8	207011	207018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017044	A	6	6	207028	207033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017044	T	6	6	207046	207051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017044	TTA	2	6	207063	207068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017044	ACC	2	6	207074	207079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_017044	CTTT	2	8	207085	207092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_017044	T	7	7	207090	207096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017044	T	6	6	207098	207103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017044	AT	3	6	207112	207117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017044	ATGT	2	8	207360	207367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017044	TTG	2	6	207383	207388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017044	CGC	2	6	207415	207420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_017044	TTG	2	6	207439	207444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017044	CTG	2	6	207460	207465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017044	ATT	2	6	207502	207507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017044	T	6	6	207512	207517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017044	CAA	2	6	207580	207585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017044	CCT	2	6	207589	207594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_017044	ATG	2	6	207599	207604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017044	TTTA	2	8	208213	208220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017044	AT	3	6	208224	208229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017044	A	6	6	208353	208358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017044	T	6	6	208374	208379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017044	ATT	2	6	208380	208385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017044	T	6	6	208384	208389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017044	GCT	2	6	208412	208417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017044	CAA	2	6	208442	208447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017044	ACA	2	6	208477	208482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017044	AATTA	2	10	211104	211113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017044	TAAAT	2	10	211121	211130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017044	TAA	2	6	211136	211141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017044	AT	3	6	211147	211152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017044	TAAAA	2	10	211156	211165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017044	A	6	6	211162	211167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017044	TTAA	2	8	211189	211196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017044	AGACA	2	10	211218	211227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_017044	AT	3	6	211230	211235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017044	TATTTA	2	12	211247	211258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017044	ATA	2	6	211263	211268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017044	TGAT	2	8	211275	211282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017044	ATT	2	6	211550	211555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017044	AAG	2	6	211577	211582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017044	TA	3	6	211618	211623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017044	TA	3	6	211632	211637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017044	T	6	6	211641	211646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017044	CAA	2	6	211649	211654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017044	TGG	2	6	211679	211684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017044	A	6	6	211693	211698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017044	GTTTT	2	10	211703	211712	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017044	GTT	2	6	211760	211765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017044	TAA	2	6	211844	211849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017044	TGC	2	6	211866	211871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017044	TATT	2	8	211883	211890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017044	TAA	2	6	212723	212728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017044	TTA	2	6	212760	212765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017044	TGT	2	6	212783	212788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017044	T	6	6	212799	212804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017044	TC	4	8	212814	212821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017044	TAT	2	6	212863	212868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017044	T	6	6	212889	212894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017044	T	6	6	212943	212948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017044	ATA	2	6	213005	213010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017044	T	7	7	213032	213038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017044	ATT	2	6	213087	213092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_017044	AGA	2	6	213144	213149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_017044	ATTAT	2	10	213235	213244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_017044	AGC	2	6	250343	250348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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