MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017044	ATT	2	6	78568	78573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017044	ATTT	2	8	78581	78588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017044	T	7	7	78611	78617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017044	TAA	2	6	79940	79945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017044	GCT	2	6	84494	84499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017044	TA	4	8	84510	84517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017044	AAAT	2	8	84535	84542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017044	ATACA	2	10	84617	84626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_017044	GTA	2	6	84627	84632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017044	AAT	2	6	84633	84638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017044	AT	4	8	84637	84644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017044	ATA	3	9	84654	84662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017044	AT	4	8	87550	87557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017044	TAA	2	6	87593	87598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017044	T	6	6	87599	87604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017044	A	7	7	87612	87618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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518	NC_017044	T	7	7	87690	87696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017044	TATTAA	2	12	87703	87714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017044	AAT	2	6	87761	87766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017044	ATT	2	6	87778	87783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017044	T	6	6	87852	87857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017044	ATA	3	9	87868	87876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017044	TAA	2	6	87917	87922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017044	A	8	8	87928	87935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017044	TAT	2	6	87936	87941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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535	NC_017044	CAA	2	6	88709	88714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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539	NC_017044	ATA	2	6	88789	88794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_017044	TAA	2	6	88934	88939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017044	TA	3	6	89328	89333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017044	TGT	2	6	89363	89368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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547	NC_017044	ATA	2	6	89424	89429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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550	NC_017044	TCC	2	6	90767	90772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017044	TTA	2	6	90773	90778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017044	TAA	2	6	90813	90818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017044	TAA	2	6	90823	90828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017044	AGG	2	6	92584	92589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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557	NC_017044	ATA	2	6	92655	92660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_017044	CAT	2	6	93450	93455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017044	TTTTAA	2	12	93475	93486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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565	NC_017044	A	6	6	95893	95898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017044	ATA	2	6	96127	96132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017044	AT	3	6	96139	96144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017044	AT	3	6	96157	96162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017044	AT	3	6	96174	96179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017044	TAAAAA	2	12	96203	96214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017044	A	7	7	96210	96216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017044	AT	3	6	96222	96227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017044	TTTA	2	8	96231	96238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017044	AGAAA	2	10	96361	96370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017044	ATT	2	6	96376	96381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017044	AATT	2	8	96481	96488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_017044	TAAA	2	8	97837	97844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_017044	ATT	2	6	97996	98001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_017044	ATTA	2	8	98076	98083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017044	AATTA	2	10	99346	99355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017044	AAT	2	6	101125	101130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_017044	ATGT	2	8	103192	103199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017044	TAT	2	6	103203	103208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_017044	A	7	7	103258	103264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017044	CAA	2	6	103318	103323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017044	TAT	3	9	104101	104109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017044	TA	3	6	104124	104129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017044	ATT	2	6	104201	104206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017044	TAA	2	6	106379	106384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017044	TTA	2	6	106412	106417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_017044	T	6	6	106842	106847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017044	AAT	2	6	106916	106921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017044	CTA	2	6	106926	106931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017044	TAG	2	6	106989	106994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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626	NC_017044	TAT	2	6	107081	107086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017044	TAT	2	6	107089	107094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017044	ATTT	2	8	107095	107102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017044	ATA	2	6	107120	107125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017044	ATT	2	6	107165	107170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017044	TTA	2	6	107171	107176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017044	TC	3	6	107503	107508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017044	TTG	2	6	107529	107534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017044	TTG	2	6	107538	107543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017044	TG	3	6	107542	107547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017044	AAC	2	6	107650	107655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017044	AT	4	8	107712	107719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017044	AAT	2	6	107751	107756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017044	A	6	6	107789	107794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017044	T	6	6	107815	107820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017044	TTA	2	6	107828	107833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017044	T	6	6	107916	107921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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