MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017044	TAG	2	6	823132	823137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017044	T	7	7	823154	823160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017044	TAC	2	6	823180	823185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017044	CAG	2	6	823260	823265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017044	GAA	2	6	823287	823292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017044	GCAA	2	8	823301	823308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_017044	TTATA	2	10	823333	823342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017044	AGCGAT	2	12	823352	823363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5009	NC_017044	AT	3	6	823369	823374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017044	CTTAA	2	10	823454	823463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_017044	A	6	6	823462	823467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017044	ATTA	2	8	823469	823476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017044	TAG	2	6	823488	823493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017044	ATT	2	6	823509	823514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017044	AT	3	6	823542	823547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017044	CTA	2	6	823599	823604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017044	AAG	2	6	823605	823610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017044	AGA	2	6	823642	823647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017044	GAT	2	6	823745	823750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017044	TGA	2	6	823858	823863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017044	ATA	2	6	823866	823871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017044	GGC	2	6	823895	823900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017044	AGT	2	6	823984	823989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017044	TAAACA	2	12	824011	824022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_017044	AAATC	2	10	824049	824058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5026	NC_017044	TAC	2	6	824086	824091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017044	ATA	3	9	824105	824113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017044	TTA	2	6	824178	824183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017044	TTA	2	6	824246	824251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017044	GGC	2	6	824266	824271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017044	TGA	2	6	824377	824382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017044	GA	4	8	824381	824388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017044	TTA	2	6	824483	824488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017044	TTA	2	6	824502	824507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017044	ATG	2	6	824541	824546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017044	TAA	2	6	824572	824577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017044	CTA	2	6	824685	824690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017044	TTAAA	2	10	824697	824706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017044	ATA	2	6	824774	824779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017044	AGT	2	6	824788	824793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017044	TAC	2	6	824815	824820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017044	ACA	2	6	824849	824854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017044	TTA	2	6	824868	824873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017044	ACA	2	6	824877	824882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017044	GCTA	2	8	824956	824963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_017044	TAA	2	6	825021	825026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017044	TAT	2	6	825048	825053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017044	A	7	7	825095	825101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017044	ATTT	2	8	825202	825209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017044	TATGC	2	10	825215	825224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_017044	TTA	2	6	825383	825388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017044	GAT	2	6	825451	825456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017044	TTTA	2	8	825467	825474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017044	AGCT	2	8	825477	825484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_017044	TGC	2	6	825491	825496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017044	ATGA	2	8	825499	825506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017044	ATT	2	6	825519	825524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017044	TAAA	2	8	825539	825546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017044	TAA	2	6	825584	825589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017044	GCTAT	2	10	825713	825722	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5061	NC_017044	ATAAA	2	10	825746	825755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017044	CTA	2	6	825770	825775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017044	AAG	2	6	825797	825802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017044	TGA	2	6	825824	825829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017044	A	7	7	825966	825972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017044	ATA	2	6	825986	825991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017044	ATA	2	6	826019	826024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017044	GTA	2	6	826052	826057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017044	TTA	2	6	826090	826095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017044	AAC	2	6	826123	826128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017044	AT	3	6	826136	826141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017044	ACGC	2	8	826146	826153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_017044	AAG	2	6	826154	826159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017044	AT	4	8	826177	826184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017044	TGA	2	6	826194	826199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_017044	ATT	2	6	826351	826356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017044	TTG	2	6	826404	826409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017044	A	6	6	826471	826476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017044	T	7	7	826481	826487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017044	ACT	2	6	826511	826516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017044	TAG	2	6	826549	826554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5086	NC_017044	AAT	2	6	826673	826678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017044	TGT	2	6	826739	826744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017044	ATTT	2	8	826750	826757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017044	TAGG	2	8	826797	826804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017044	CAT	2	6	826866	826871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_017044	TTA	2	6	826947	826952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_017044	TAA	2	6	827051	827056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017044	TAA	2	6	827115	827120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017044	AGA	2	6	827216	827221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017044	ATT	2	6	827248	827253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017044	GTA	2	6	827313	827318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_017044	T	6	6	827472	827477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017044	TAA	2	6	827572	827577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017044	AGC	2	6	827617	827622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_017044	A	6	6	827701	827706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017044	ATA	2	6	828774	828779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017044	TAT	2	6	828788	828793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017044	T	6	6	828793	828798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017044	TAT	2	6	829230	829235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017044	TCTTA	2	10	829269	829278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5111	NC_017044	TGA	2	6	829289	829294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017044	T	7	7	829299	829305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017044	TTG	2	6	829355	829360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017044	TAC	2	6	829416	829421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5116	NC_017044	CAA	2	6	829454	829459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017044	CTCCC	2	10	829478	829487	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5118	NC_017044	TCTT	2	8	830029	830036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_017044	CTA	2	6	830787	830792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_017044	CCT	2	6	830824	830829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5122	NC_017044	CTAG	2	8	831262	831269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_017044	ATCGTC	2	12	832857	832868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017044	TTA	2	6	832917	832922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017044	TCGC	2	8	832951	832958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_017044	GAC	2	6	832962	832967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017044	TA	4	8	832992	832999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017044	ATTA	2	8	833031	833038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017044	AAT	2	6	833049	833054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017044	A	7	7	833119	833125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017044	CTTT	2	8	833131	833138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_017044	TA	3	6	833156	833161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017044	T	6	6	833209	833214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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