MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 7674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017043	ATA	2	6	254955	254960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017043	TTAGT	2	10	254977	254986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017043	TTA	2	6	254988	254993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017043	TAA	2	6	255091	255096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017043	TAA	2	6	255107	255112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017043	TAA	2	6	255154	255159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017043	TGT	2	6	255195	255200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017043	ATT	2	6	255287	255292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017043	TGC	2	6	255341	255346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017043	GTA	2	6	255352	255357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017043	GTA	2	6	255393	255398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017043	TAA	2	6	255420	255425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017043	T	6	6	255511	255516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017043	AAT	2	6	255612	255617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017043	AGC	2	6	255656	255661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017043	TAAA	2	8	255707	255714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017043	A	6	6	255740	255745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017043	AAG	2	6	255770	255775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017043	TCA	2	6	255777	255782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017043	ATT	2	6	255785	255790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017043	CTT	2	6	255847	255852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017043	ATC	2	6	255927	255932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017043	AT	3	6	255956	255961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017043	CAT	2	6	255973	255978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017043	AGAA	2	8	255983	255990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017043	CAT	2	6	256024	256029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017043	GTA	2	6	256083	256088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017043	TAG	2	6	256102	256107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017043	CTA	2	6	256141	256146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017043	A	6	6	256155	256160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017043	AT	3	6	256319	256324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017043	GAA	2	6	256336	256341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017043	TAA	2	6	256347	256352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017043	AAT	2	6	256426	256431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017043	AAT	2	6	256453	256458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017043	TAT	2	6	256461	256466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017043	CAA	2	6	256494	256499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017043	TAAATC	2	12	256531	256542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1539	NC_017043	ATC	2	6	256651	256656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017043	ATA	2	6	256670	256675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017043	AGC	2	6	256679	256684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017043	ACT	2	6	256685	256690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017043	T	7	7	256759	256765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017043	T	6	6	256839	256844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017043	ATT	2	6	256845	256850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017043	T	6	6	256849	256854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017043	GT	3	6	256888	256893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017043	AC	3	6	256902	256907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017043	GTA	2	6	257233	257238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017043	TATT	2	8	258143	258150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017043	ATTT	2	8	258153	258160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017043	T	8	8	258165	258172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017043	CTC	2	6	258219	258224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_017043	TGCT	2	8	258226	258233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_017043	CA	3	6	258235	258240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_017043	TCT	2	6	258269	258274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017043	CTT	2	6	258288	258293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017043	AAAG	2	8	258320	258327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017043	GCA	2	6	258329	258334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017043	CGA	2	6	258345	258350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017043	CTA	2	6	258612	258617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017043	ACC	2	6	258657	258662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_017043	CTG	2	6	258749	258754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017043	AAAC	2	8	259003	259010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_017043	CTAG	2	8	259069	259076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_017043	TCG	3	9	260662	260670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017043	TTA	2	6	260721	260726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017043	TCGC	2	8	260755	260762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_017043	GAC	2	6	260766	260771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017043	TA	4	8	260794	260801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017043	ATTA	2	8	260833	260840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017043	AAT	2	6	260841	260846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017043	A	8	8	260911	260918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017043	CTTT	2	8	260924	260931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017043	TA	3	6	260949	260954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017043	TACG	2	8	260965	260972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_017043	T	6	6	261000	261005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017043	T	8	8	261022	261029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017043	TTA	2	6	261061	261066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017043	A	6	6	261076	261081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017043	TTG	2	6	264372	264377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017043	A	6	6	264439	264444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017043	T	6	6	264445	264450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017043	TTAT	2	8	264457	264464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017043	TAA	2	6	265531	265536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017043	TAA	2	6	265561	265566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017043	AAT	2	6	265576	265581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017043	A	7	7	265597	265603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017043	ACA	2	6	265615	265620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_017043	A	6	6	265620	265625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017043	TTAAT	2	10	265630	265639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017043	CGCA	2	8	265644	265651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_017043	TTA	2	6	265660	265665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017043	ACT	2	6	265675	265680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1596	NC_017043	TA	3	6	265722	265727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017043	ATT	2	6	265808	265813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017043	T	6	6	265899	265904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017043	AGT	2	6	265925	265930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017043	TCT	2	6	265989	265994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017043	ATA	2	6	266009	266014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017043	TTG	2	6	266048	266053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017043	TAT	2	6	266069	266074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017043	TAAT	2	8	266127	266134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017043	ATA	2	6	266150	266155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017043	A	6	6	266173	266178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017043	TAT	2	6	268484	268489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017043	TA	3	6	268563	268568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017043	AAC	2	6	268569	268574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017043	AATT	2	8	268677	268684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017043	A	6	6	268704	268709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017043	CAA	2	6	268735	268740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_017043	TTC	2	6	268779	268784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017043	GTT	2	6	268814	268819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017043	ATA	2	6	268825	268830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017043	TTAT	2	8	268831	268838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017043	TGT	2	6	268839	268844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017043	TATTTT	2	12	268885	268896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017043	T	6	6	268893	268898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017043	CCT	2	6	268909	268914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_017043	TTG	2	6	268957	268962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017043	CAA	2	6	269029	269034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017043	ATT	2	6	269062	269067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017043	TTAT	2	8	270769	270776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017043	ATTTG	2	10	270859	270868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017043	A	6	6	270875	270880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017043	T	6	6	270896	270901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017043	CAA	2	6	270980	270985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017043	ATT	2	6	272981	272986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017043	A	7	7	273020	273026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017043	ATT	2	6	273044	273049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017043	CA	3	6	273105	273110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_017043	CA	3	6	273139	273144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_017043	T	7	7	273173	273179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_017043	AT	3	6	273215	273220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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