MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 7674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017043	ATTTA	2	10	169015	169024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017043	TAA	2	6	169034	169039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017043	TTAT	2	8	169049	169056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017043	TA	3	6	169069	169074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017043	AAC	2	6	169093	169098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017043	TTAT	2	8	169453	169460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017043	ATA	2	6	169480	169485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017043	GAT	2	6	170180	170185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017043	GCT	2	6	170287	170292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017043	CAA	2	6	170306	170311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017043	TTA	2	6	170313	170318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017043	CAAA	2	8	170323	170330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_017043	GTT	2	6	171810	171815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017043	A	6	6	171825	171830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017043	TAA	2	6	171889	171894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017043	TCGC	2	8	171974	171981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017043	T	6	6	172535	172540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017043	T	7	7	172544	172550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017043	ATATT	2	10	172561	172570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017043	TAC	2	6	172581	172586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017043	ATA	2	6	172616	172621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017043	A	8	8	172621	172628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017043	TTG	2	6	172629	172634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017043	T	9	9	172657	172665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017043	TAG	2	6	172748	172753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017043	TGA	2	6	172797	172802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017043	ACA	2	6	172808	172813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017043	GAA	2	6	174495	174500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017043	ATT	2	6	174525	174530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017043	TA	3	6	174541	174546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017043	TAG	2	6	174558	174563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017043	AAT	2	6	174582	174587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017043	ATA	2	6	175611	175616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017043	T	7	7	175622	175628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017043	AAT	2	6	175629	175634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017043	ATT	2	6	175643	175648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017043	T	6	6	175657	175662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017043	A	6	6	175665	175670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017043	CTG	2	6	175862	175867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017043	AAGA	2	8	175915	175922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017043	ATACT	2	10	175934	175943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_017043	TCA	2	6	175989	175994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017043	TTA	2	6	176203	176208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017043	TAA	2	6	176210	176215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017043	AAT	2	6	176270	176275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017043	ATA	2	6	176320	176325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017043	TTA	2	6	176334	176339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017043	TACAAA	2	12	176353	176364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1050	NC_017043	TAA	2	6	176427	176432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017043	TAG	2	6	176448	176453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017043	A	6	6	176454	176459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017043	TAA	2	6	176497	176502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017043	TAATA	2	10	176518	176527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017043	A	6	6	176568	176573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017043	CAA	2	6	176584	176589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017043	A	6	6	176628	176633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017043	A	6	6	176737	176742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017043	TTGA	2	8	176785	176792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017043	CTA	2	6	176809	176814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1062	NC_017043	ATT	2	6	176893	176898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017043	AAT	2	6	176903	176908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017043	ATT	2	6	176953	176958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017043	GCC	2	6	176974	176979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017043	TGG	2	6	177000	177005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017043	TAA	2	6	177007	177012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017043	GCA	2	6	177017	177022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_017043	A	7	7	177038	177044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017043	TGA	2	6	177082	177087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017043	TAA	2	6	177103	177108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017043	CAT	2	6	177123	177128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1075	NC_017043	TAA	2	6	177161	177166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017043	TAACT	2	10	177448	177457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_017043	A	6	6	177531	177536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017043	TAGT	2	8	177620	177627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017043	TAGG	2	8	177641	177648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_017043	TA	3	6	177963	177968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017043	T	6	6	178048	178053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017043	ATA	3	9	178142	178150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_017043	T	7	7	180671	180677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017043	A	6	6	180722	180727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017043	ATTT	2	8	180749	180756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017043	TAAT	2	8	182030	182037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017043	T	6	6	182041	182046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017043	TTTAA	2	10	182054	182063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017043	TTA	2	6	182080	182085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017043	AT	3	6	182095	182100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017043	TAT	2	6	182123	182128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017043	TA	3	6	182419	182424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017043	AT	3	6	182444	182449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017043	TTTTA	2	10	183456	183465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017043	TAAT	2	8	183498	183505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017043	TAA	2	6	183516	183521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017043	AAT	2	6	184264	184269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017043	TAT	2	6	184273	184278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017043	A	6	6	184805	184810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017043	T	6	6	184815	184820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017043	AAT	2	6	184835	184840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017043	T	6	6	184870	184875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017043	ACA	2	6	184914	184919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017043	ATG	2	6	184939	184944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017043	TCT	2	6	185158	185163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017043	CTG	2	6	185180	185185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017043	ATA	2	6	185215	185220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017043	TTA	3	9	185234	185242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017043	TC	3	6	185280	185285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_017043	TAT	2	6	185296	185301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017043	TA	3	6	185361	185366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017043	GGC	2	6	185368	185373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017043	TTAA	2	8	185395	185402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017043	TAA	2	6	185415	185420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017043	ATATC	2	10	185435	185444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1127	NC_017043	AAT	2	6	185464	185469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017043	TGT	2	6	186192	186197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017043	CAT	2	6	186213	186218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017043	GTT	2	6	186230	186235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017043	GTC	2	6	186250	186255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017043	A	6	6	186297	186302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017043	T	8	8	186318	186325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017043	ATT	2	6	186326	186331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017043	GCT	2	6	186357	186362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017043	TA	3	6	190706	190711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_017043	GAG	2	6	190777	190782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_017043	A	6	6	242417	242422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_017043	TAA	2	6	242442	242447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_017043	AT	3	6	242460	242465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017043	ATT	2	6	242472	242477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_017043	T	6	6	242480	242485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_017043	AAATT	2	10	242492	242501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_017043	CTAT	2	8	242538	242545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1422	NC_017043	TAA	2	6	242560	242565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_017043	A	6	6	242922	242927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_017043	T	6	6	244017	244022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_017043	ATGCT	2	10	244072	244081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1442	NC_017043	TCT	2	6	244616	244621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_017043	TA	3	6	245009	245014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_017043	TAT	2	6	245104	245109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1454	NC_017043	TCA	2	6	245262	245267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_017043	CTT	2	6	245300	245305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1460	NC_017043	TTA	2	6	246448	246453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1461	NC_017043	TA	3	6	246498	246503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1477	NC_017043	A	6	6	247561	247566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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