MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 7674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017043	TA	3	6	1263035	1263040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_017043	A	6	6	1263040	1263045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_017043	A	6	6	1263062	1263067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_017043	TAA	2	6	1263069	1263074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_017043	TGT	2	6	1263106	1263111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_017043	TTTG	2	8	1263114	1263121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_017043	TA	3	6	1263122	1263127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_017043	ATT	3	9	1263134	1263142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_017043	AAT	2	6	1263163	1263168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_017043	T	6	6	1264646	1264651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_017043	TTTAT	2	10	1264657	1264666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_017043	AT	3	6	1264670	1264675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_017043	TATTAA	2	12	1264683	1264694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_017043	GTT	2	6	1264696	1264701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_017043	T	7	7	1264700	1264706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_017043	ACT	2	6	1264752	1264757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_017043	A	7	7	1264758	1264764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_017043	GTA	2	6	1264784	1264789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_017043	TAA	3	9	1264796	1264804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_017043	AG	3	6	1265356	1265361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_017043	GTA	2	6	1265397	1265402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_017043	TTAATT	2	12	1265478	1265489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_017043	CGCTC	2	10	1265822	1265831	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7524	NC_017043	AATT	2	8	1265914	1265921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_017043	ATA	2	6	1267429	1267434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_017043	T	6	6	1267441	1267446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_017043	ACA	2	6	1269929	1269934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_017043	AAT	2	6	1269959	1269964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_017043	TTAA	2	8	1269965	1269972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_017043	TAT	2	6	1270012	1270017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_017043	ATA	2	6	1270030	1270035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_017043	GCT	2	6	1270113	1270118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_017043	GTGTT	2	10	1270119	1270128	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_017043	TCC	2	6	1270146	1270151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_017043	TTA	2	6	1270152	1270157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_017043	TAA	2	6	1270178	1270183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_017043	AAT	2	6	1270193	1270198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_017043	AT	3	6	1270909	1270914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_017043	TAT	2	6	1270943	1270948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_017043	TTA	2	6	1270949	1270954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_017043	TTA	2	6	1270992	1270997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_017043	CAA	2	6	1271176	1271181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_017043	ACA	2	6	1271225	1271230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_017043	AGACA	2	10	1271237	1271246	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7545	NC_017043	ATT	2	6	1271655	1271660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_017043	GTT	2	6	1271671	1271676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_017043	ACA	3	9	1271733	1271741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_017043	AGTA	2	8	1271856	1271863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_017043	ACT	2	6	1271887	1271892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_017043	TCT	2	6	1271907	1271912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_017043	CT	3	6	1271911	1271916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7552	NC_017043	TCA	2	6	1271978	1271983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_017043	TAT	2	6	1272000	1272005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_017043	TC	3	6	1272048	1272053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7555	NC_017043	TATC	2	8	1272455	1272462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7556	NC_017043	AGC	2	6	1272524	1272529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_017043	TAG	2	6	1272639	1272644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_017043	AT	3	6	1272656	1272661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_017043	CTA	2	6	1272680	1272685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_017043	A	7	7	1272815	1272821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_017043	TTG	2	6	1272861	1272866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_017043	AAAT	2	8	1272972	1272979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_017043	GAT	2	6	1272990	1272995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_017043	TAG	2	6	1273016	1273021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_017043	CTA	2	6	1273034	1273039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_017043	TTTG	2	8	1273064	1273071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_017043	GTC	2	6	1273104	1273109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_017043	GGTT	2	8	1273143	1273150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_017043	ACATA	2	10	1273209	1273218	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7570	NC_017043	GTA	2	6	1273261	1273266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_017043	AAC	2	6	1273269	1273274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_017043	ATAA	2	8	1273312	1273319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_017043	AAT	2	6	1273368	1273373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_017043	CAT	2	6	1273451	1273456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_017043	ATTAAT	2	12	1273495	1273506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_017043	CTT	2	6	1273542	1273547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7577	NC_017043	TAGTAT	2	12	1273569	1273580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_017043	GTT	2	6	1273584	1273589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_017043	TAT	2	6	1273641	1273646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_017043	TGA	2	6	1273824	1273829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_017043	TAT	2	6	1273854	1273859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_017043	TGC	2	6	1273861	1273866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_017043	GCA	2	6	1273941	1273946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_017043	TCG	2	6	1273973	1273978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_017043	TA	3	6	1273992	1273997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_017043	ATAA	2	8	1274023	1274030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_017043	AT	3	6	1274032	1274037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_017043	T	7	7	1274430	1274436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_017043	T	6	6	1274450	1274455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_017043	CATA	2	8	1274460	1274467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7591	NC_017043	AAG	2	6	1274488	1274493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_017043	AAAC	2	8	1274509	1274516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7593	NC_017043	ATG	2	6	1274574	1274579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_017043	ACT	2	6	1274587	1274592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_017043	TCC	2	6	1274654	1274659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7596	NC_017043	TAA	2	6	1274677	1274682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_017043	ATC	2	6	1274690	1274695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_017043	CTATAT	2	12	1274707	1274718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7599	NC_017043	ACA	2	6	1274748	1274753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7600	NC_017043	TA	3	6	1274801	1274806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_017043	CTA	2	6	1274946	1274951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_017043	AAT	2	6	1274986	1274991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_017043	CATATT	2	12	1275022	1275033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7604	NC_017043	CTT	2	6	1275102	1275107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_017043	TGCTTG	2	12	1275148	1275159	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7606	NC_017043	ATA	2	6	1275198	1275203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_017043	CTT	2	6	1275219	1275224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_017043	TCA	2	6	1275230	1275235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_017043	T	6	6	1275334	1275339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_017043	GCT	2	6	1275365	1275370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_017043	TTA	2	6	1275405	1275410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_017043	TAC	2	6	1275424	1275429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_017043	TATCAA	2	12	1275448	1275459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7614	NC_017043	ATT	2	6	1275467	1275472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_017043	TGC	2	6	1275521	1275526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_017043	TAA	2	6	1275588	1275593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_017043	TCTGC	2	10	1275665	1275674	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7618	NC_017043	GTAGA	2	10	1275734	1275743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_017043	CTAC	2	8	1275802	1275809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7620	NC_017043	TGT	2	6	1275844	1275849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_017043	GGC	2	6	1275856	1275861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_017043	AGC	2	6	1275891	1275896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_017043	TA	3	6	1275932	1275937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_017043	ATTTA	2	10	1275945	1275954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_017043	TAGA	2	8	1275990	1275997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_017043	TTTG	2	8	1275998	1276005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_017043	T	7	7	1276097	1276103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_017043	GGC	2	6	1276122	1276127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_017043	ATT	2	6	1276175	1276180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_017043	GCT	2	6	1276266	1276271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7631	NC_017043	TTC	2	6	1276319	1276324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7643	NC_017043	AACT	2	8	1276629	1276636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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