MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017042	AGG	2	6	211389	211394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017042	TTA	2	6	211403	211408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017042	T	7	7	211464	211470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017042	TTG	2	6	211504	211509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017042	TCTTT	2	10	211527	211536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1506	NC_017042	TAAT	2	8	211781	211788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017042	TA	3	6	211798	211803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017042	AATCAA	2	12	211818	211829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1509	NC_017042	AAT	2	6	211854	211859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017042	TA	3	6	211907	211912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017042	CGT	2	6	211937	211942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017042	TTTG	2	8	212615	212622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017042	TTG	2	6	212653	212658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017042	A	6	6	212720	212725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017042	T	7	7	212741	212747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017042	ATT	2	6	212748	212753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017042	T	6	6	212752	212757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017042	ACT	2	6	212780	212785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017042	GTA	2	6	212822	212827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017042	ATT	2	6	212872	212877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017042	AGC	2	6	212887	212892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017042	T	6	6	212956	212961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017042	CTG	2	6	212998	213003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017042	GTT	2	6	213023	213028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017042	T	6	6	214895	214900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017042	TG	3	6	214945	214950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017042	TAC	2	6	214993	214998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017042	AAAT	2	8	215047	215054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017042	CTGT	2	8	217502	217509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_017042	AAT	2	6	225943	225948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017042	GCT	2	6	226002	226007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017042	TAT	2	6	228855	228860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017042	TCGC	2	8	228863	228870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017042	ATA	2	6	228906	228911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017042	GTT	2	6	232389	232394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017042	T	7	7	232393	232399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017042	TA	3	6	232412	232417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017042	GAA	2	6	232469	232474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017042	ATC	2	6	232486	232491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017042	A	7	7	232512	232518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017042	GAA	2	6	232524	232529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017042	CTA	2	6	232555	232560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017042	T	8	8	232565	232572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017042	GAAG	2	8	232575	232582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017042	AGA	2	6	232583	232588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017042	AT	3	6	232610	232615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017042	A	6	6	232706	232711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017042	T	8	8	232716	232723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017042	CAA	2	6	232783	232788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017042	AAT	2	6	232854	232859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017042	ATTA	2	8	232873	232880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017042	TA	3	6	232884	232889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017042	TTA	2	6	232915	232920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017042	ATA	2	6	232944	232949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017042	T	6	6	232958	232963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017042	TAC	2	6	232991	232996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017042	CTC	2	6	233002	233007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017042	TGA	2	6	233033	233038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017042	AGC	2	6	233039	233044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017042	AGT	2	6	233102	233107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017042	CGAT	2	8	233113	233120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_017042	TAA	2	6	233164	233169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017042	TAA	2	6	233219	233224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017042	TAAT	2	8	233248	233255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017042	AGC	2	6	233273	233278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017042	A	7	7	233279	233285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017042	TAT	2	6	233321	233326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017042	TGA	2	6	233345	233350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017042	CGT	2	6	233397	233402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017042	ATT	2	6	233451	233456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017042	TGC	2	6	233462	233467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017042	AGA	2	6	233489	233494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017042	AGA	2	6	233543	233548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017042	TAT	2	6	233569	233574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017042	CTG	2	6	233620	233625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017042	TGC	2	6	233711	233716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017042	AT	3	6	233758	233763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017042	TAG	2	6	233764	233769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017042	AGC	2	6	233803	233808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017042	TAT	2	6	233864	233869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017042	TCC	2	6	233937	233942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_017042	A	6	6	233968	233973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017042	TAT	2	6	233974	233979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017042	AGC	2	6	234031	234036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017042	TAT	2	6	234078	234083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017042	GTA	2	6	234101	234106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017042	ATG	2	6	234175	234180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017042	AGT	2	6	234210	234215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017042	AAG	2	6	234251	234256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017042	TTA	2	6	234265	234270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017042	TA	3	6	234269	234274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017042	TTGC	2	8	234327	234334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_017042	ATTT	2	8	234367	234374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017042	CTG	2	6	234409	234414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017042	CTG	2	6	234445	234450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017042	T	6	6	234499	234504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017042	GAT	2	6	234525	234530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017042	A	6	6	234533	234538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017042	A	7	7	234541	234547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017042	TAA	2	6	234556	234561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017042	ATC	2	6	234615	234620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017042	TGA	2	6	234631	234636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017042	T	7	7	234699	234705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017042	AAATA	2	10	234707	234716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017042	TA	3	6	234715	234720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017042	AT	3	6	234730	234735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017042	CTA	2	6	235201	235206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_017042	GTC	2	6	235219	235224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017042	AT	3	6	236360	236365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017042	AGC	2	6	236432	236437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017042	ATA	2	6	236464	236469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017042	A	6	6	236766	236771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017042	TA	3	6	236795	236800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017042	CAA	2	6	236821	236826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017042	AT	3	6	236828	236833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017042	TTG	2	6	237788	237793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017042	TGC	2	6	237830	237835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017042	GAG	2	6	239210	239215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017042	GCGA	2	8	239247	239254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_017042	AAT	2	6	239288	239293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017042	AAT	2	6	239361	239366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017042	TTG	2	6	241911	241916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017042	ATA	2	6	241967	241972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017042	AAT	2	6	241994	241999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017042	TA	3	6	245874	245879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017042	AT	4	8	245885	245892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017042	ATA	2	6	245911	245916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017042	ACA	2	6	245921	245926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017042	TCTA	2	8	247935	247942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_017042	TTTA	2	8	247946	247953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017042	ATA	2	6	249545	249550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017042	GTA	2	6	250330	250335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017042	AG	3	6	250369	250374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017042	TTTTAA	2	12	250376	250387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_017042	T	6	6	250451	250456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1958	NC_017042	ATTA	2	8	310050	310057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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