MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017042	ATCT	2	8	129095	129102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_017042	T	7	7	129114	129120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017042	TTA	2	6	129131	129136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017042	AGC	2	6	129160	129165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017042	TTTCT	2	10	129171	129180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_017042	T	6	6	129208	129213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017042	AAC	2	6	129222	129227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017042	TTG	2	6	129231	129236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017042	TAC	2	6	129252	129257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017042	TGCT	2	8	129259	129266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017042	TTC	2	6	129407	129412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017042	TTA	2	6	129424	129429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017042	ATA	2	6	129496	129501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017042	TGCT	2	8	129576	129583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_017042	T	6	6	129589	129594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017042	T	8	8	129608	129615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017042	TTTCTT	2	12	129620	129631	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_017042	ATT	2	6	129655	129660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017042	CTG	2	6	129662	129667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017042	TTTA	2	8	129681	129688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017042	A	7	7	129693	129699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017042	TCA	2	6	129739	129744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017042	TCAC	2	8	129790	129797	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_017042	TAAA	2	8	129830	129837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017042	AGTATT	2	12	129846	129857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017042	T	7	7	129882	129888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017042	CAA	2	6	129896	129901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017042	T	6	6	130010	130015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017042	CAA	2	6	130142	130147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017042	T	6	6	130217	130222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017042	T	6	6	130242	130247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017042	T	6	6	130287	130292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017042	TAA	2	6	130339	130344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017042	CTT	2	6	130354	130359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1039	NC_017042	ATT	2	6	130699	130704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017042	ATTA	2	8	130740	130747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017042	TTAT	2	8	130755	130762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017042	T	6	6	133341	133346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017042	TAA	2	6	133397	133402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017042	TTG	2	6	133437	133442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1046	NC_017042	CAA	2	6	133508	133513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017042	A	6	6	133555	133560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_017042	T	6	6	134079	134084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017042	AT	3	6	134085	134090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017042	TAC	2	6	134124	134129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1053	NC_017042	A	6	6	134152	134157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017042	TCT	2	6	134165	134170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017042	TAAA	2	8	134184	134191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_017042	CAT	2	6	135278	135283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1060	NC_017042	ATCT	2	8	135389	135396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017042	TAA	2	6	135402	135407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017042	AT	3	6	136630	136635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017042	TATT	2	8	136664	136671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017042	TAA	2	6	136694	136699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017042	AACG	2	8	136776	136783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_017042	TAA	2	6	136788	136793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017042	CT	3	6	136816	136821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017042	AAT	2	6	137330	137335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017042	TAA	2	6	137348	137353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017042	TTA	2	6	137363	137368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_017042	ATA	2	6	137424	137429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017042	GTTT	2	8	137475	137482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017042	TA	3	6	137495	137500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_017042	T	7	7	138873	138879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_017042	TAC	3	9	138949	138957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_017042	TAG	2	6	142460	142465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1090	NC_017042	GGT	2	6	142495	142500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_017042	TTA	2	6	142770	142775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017042	TAA	2	6	142807	142812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_017042	TGC	2	6	142884	142889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1102	NC_017042	TGTT	2	8	142930	142937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017042	TGG	3	9	143040	143048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017042	TAT	2	6	143071	143076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017042	GATAA	2	10	143083	143092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017042	CAAT	2	8	143102	143109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017042	ATA	2	6	143195	143200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017042	AT	5	10	143205	143214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017042	ACG	2	6	143339	143344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017042	TTG	2	6	143413	143418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_017042	T	6	6	143524	143529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017042	ATT	2	6	143664	143669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017042	AG	3	6	143696	143701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017042	TTAA	2	8	144498	144505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017042	TAA	2	6	144531	144536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017042	ATAA	2	8	146821	146828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017042	GTAA	2	8	146869	146876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017042	T	6	6	146894	146899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017042	ATT	2	6	146900	146905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017042	GCT	2	6	146922	146927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017042	ATT	2	6	146990	146995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017042	ATAAAA	2	12	146997	147008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017042	TAA	3	9	147016	147024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017042	A	6	6	147023	147028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017042	ATTTAT	2	12	147030	147041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017042	AGT	2	6	148248	148253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017042	A	7	7	148254	148260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017042	TAAAT	2	10	148261	148270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017042	GTC	2	6	148288	148293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017042	TA	4	8	148333	148340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017042	ATT	2	6	148348	148353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017042	AT	3	6	150660	150665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017042	TAT	2	6	150678	150683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017042	GCT	2	6	150706	150711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_017042	AGA	2	6	150864	150869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_017042	AAGT	2	8	200289	200296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_017042	GCT	2	6	200344	200349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_017042	CTAC	2	8	202158	202165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1420	NC_017042	TAT	2	6	202258	202263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_017042	AGTA	2	8	202266	202273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_017042	TTA	2	6	204756	204761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_017042	CAA	2	6	204819	204824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_017042	CGCT	2	8	204829	204836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1425	NC_017042	ACA	2	6	204848	204853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_017042	GCAG	2	8	204879	204886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1427	NC_017042	TAA	2	6	204890	204895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_017042	AT	3	6	204935	204940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_017042	TAG	2	6	205077	205082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_017042	GCA	2	6	205085	205090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_017042	AAT	2	6	205111	205116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_017042	GCAAG	2	10	205142	205151	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1436	NC_017042	T	6	6	205265	205270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_017042	TA	3	6	205305	205310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_017042	A	6	6	205380	205385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_017042	TA	3	6	205415	205420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_017042	AAAG	2	8	205424	205431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_017042	ATAA	2	8	205436	205443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_017042	AGC	2	6	205537	205542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1447	NC_017042	TAC	2	6	205839	205844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_017042	TAA	2	6	205872	205877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_017042	A	6	6	207000	207005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_017042	TTAAA	2	10	207085	207094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_017042	A	6	6	207098	207103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_017042	T	6	6	207929	207934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_017042	ACGT	2	8	207952	207959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1456	NC_017042	A	6	6	207967	207972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_017042	ACA	2	6	207979	207984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1462	NC_017042	AGT	2	6	209252	209257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_017042	GAT	2	6	209280	209285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_017042	ATT	2	6	209307	209312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_017042	TTA	2	6	209320	209325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1467	NC_017042	TAAT	2	8	209362	209369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1469	NC_017042	TATTT	2	10	209408	209417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_017042	TAC	2	6	209975	209980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1491	NC_017042	AAT	2	6	211045	211050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1492	NC_017042	AT	3	6	211049	211054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1498	NC_017042	CT	3	6	211237	211242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1499	NC_017042	TCT	2	6	211245	211250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_017042	CTA	2	6	211361	211366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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