MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017042	CTA	2	6	69095	69100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017042	A	6	6	69119	69124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017042	CTA	2	6	69140	69145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017042	A	6	6	69162	69167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017042	AACTCT	2	12	69181	69192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017042	ATT	2	6	69249	69254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017042	AT	3	6	69258	69263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017042	TAG	2	6	69285	69290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017042	CAAG	2	8	69303	69310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017042	AAT	2	6	69312	69317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017042	ATT	2	6	69336	69341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017042	TAA	2	6	69392	69397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017042	TATT	2	8	69410	69417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017042	AGCA	2	8	69432	69439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017042	GAT	2	6	69470	69475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017042	ATA	2	6	69498	69503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017042	AT	3	6	69532	69537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017042	TAAT	2	8	69555	69562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017042	AAG	2	6	69564	69569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017042	AT	3	6	69598	69603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017042	A	8	8	69606	69613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017042	AAT	2	6	69632	69637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017042	ATT	2	6	69699	69704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017042	AGA	2	6	69715	69720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017042	A	6	6	69758	69763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017042	A	6	6	69793	69798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017042	TCT	2	6	69811	69816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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529	NC_017042	ATTT	2	8	69900	69907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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531	NC_017042	TTA	2	6	69941	69946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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533	NC_017042	AAAGAT	2	12	69971	69982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_017042	ATT	2	6	70148	70153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_017042	CAAG	2	8	70247	70254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_017042	AT	3	6	70329	70334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017042	TTA	2	6	70389	70394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_017042	TA	3	6	70624	70629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017042	A	7	7	70648	70654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017042	AT	3	6	70661	70666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017042	AAG	2	6	70676	70681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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554	NC_017042	ATT	2	6	70692	70697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017042	A	6	6	70719	70724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017042	AAT	2	6	70773	70778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017042	AT	3	6	70826	70831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017042	A	6	6	70835	70840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017042	ATA	2	6	71723	71728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017042	GATA	2	8	72300	72307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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563	NC_017042	ATA	2	6	72415	72420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017042	ACTAA	2	10	73270	73279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
565	NC_017042	TAA	2	6	73349	73354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017042	TGG	2	6	73839	73844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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568	NC_017042	AAT	2	6	73975	73980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017042	ATT	2	6	74022	74027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017042	AAT	2	6	74095	74100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_017042	TGA	2	6	74188	74193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_017042	A	7	7	74449	74455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017042	AT	4	8	74465	74472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017042	ATT	2	6	74605	74610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017042	TA	3	6	74745	74750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017042	A	6	6	74795	74800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_017042	TA	3	6	77298	77303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017042	AT	3	6	77305	77310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017042	AATT	2	8	77336	77343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_017042	TAT	2	6	79829	79834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_017042	ATTT	2	8	83135	83142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017042	TCA	2	6	83152	83157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017042	TTA	2	6	83284	83289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017042	AACAT	2	10	83315	83324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
635	NC_017042	GTT	2	6	83366	83371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_017042	TTTA	2	8	83469	83476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017042	T	6	6	83492	83497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017042	ATT	2	6	83559	83564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017042	T	6	6	83563	83568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_017042	T	7	7	83585	83591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_017042	ACCTAA	2	12	83617	83628	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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934	NC_017042	A	7	7	117771	117777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
935	NC_017042	TTC	2	6	117828	117833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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943	NC_017042	AAT	2	6	124325	124330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
944	NC_017042	AGC	2	6	124715	124720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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949	NC_017042	GTA	2	6	126273	126278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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977	NC_017042	ATA	3	9	128056	128064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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997	NC_017042	ATT	2	6	128939	128944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_017042	T	6	6	129079	129084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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