MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016931	GTAA	2	8	509631	509638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016931	TAT	3	9	509662	509670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016931	GCT	2	6	509698	509703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016931	AGG	2	6	509768	509773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016931	GAG	2	6	511053	511058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016931	GTT	2	6	511061	511066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016931	A	6	6	511119	511124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016931	T	6	6	511142	511147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_016931	CAA	2	6	511206	511211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_016931	GAG	2	6	511220	511225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016931	TC	3	6	511242	511247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_016931	GTA	2	6	511306	511311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016931	CTG	2	6	511320	511325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_016931	AT	3	6	511381	511386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016931	AGT	2	6	511393	511398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016931	TAA	2	6	511411	511416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_016931	TTA	2	6	511426	511431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016931	GCGA	2	8	512033	512040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_016931	TTG	3	9	512050	512058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016931	CGA	2	6	512102	512107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_016931	A	6	6	512119	512124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016931	ATT	2	6	512146	512151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016931	T	6	6	512150	512155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016931	T	7	7	512218	512224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016931	GAA	2	6	512225	512230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016931	TTC	2	6	512244	512249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_016931	ATTG	2	8	512259	512266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016931	AT	4	8	512316	512323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016931	TAT	2	6	512341	512346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016931	TTGCA	2	10	512534	512543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3531	NC_016931	T	6	6	512544	512549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016931	TTGC	2	8	512551	512558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_016931	TTC	2	6	512576	512581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_016931	TATCGG	2	12	512666	512677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3535	NC_016931	TAA	2	6	512679	512684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016931	A	6	6	512695	512700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016931	ATT	2	6	512731	512736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016931	T	6	6	512735	512740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016931	TA	3	6	512773	512778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016931	ATTT	2	8	512785	512792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_016931	ATA	2	6	512868	512873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016931	ATTT	2	8	512886	512893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016931	AT	3	6	512901	512906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_016931	ATT	2	6	512911	512916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016931	ATT	2	6	512947	512952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016931	AT	3	6	512965	512970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016931	A	7	7	512992	512998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_016931	TAT	2	6	513006	513011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_016931	TAA	3	9	513020	513028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016931	AT	3	6	513037	513042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016931	TTC	2	6	513058	513063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_016931	ATA	2	6	513084	513089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_016931	ATT	2	6	513094	513099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016931	ATT	2	6	513103	513108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016931	AT	3	6	513160	513165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016931	ATT	2	6	513175	513180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016931	TTTG	2	8	513219	513226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_016931	GT	3	6	513340	513345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_016931	TTTTA	2	10	515028	515037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_016931	TA	3	6	515036	515041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016931	TAA	2	6	515057	515062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016931	ATT	2	6	515104	515109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016931	AT	4	8	515774	515781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016931	AATA	2	8	515782	515789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016931	TA	3	6	515860	515865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_016931	TC	3	6	517717	517722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_016931	ATA	2	6	517735	517740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016931	TAG	2	6	517761	517766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016931	TAAA	2	8	517787	517794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_016931	A	6	6	517792	517797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_016931	ACT	2	6	518575	518580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_016931	TAT	2	6	518584	518589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_016931	TAAA	2	8	518603	518610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_016931	GCT	2	6	518618	518623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_016931	TGA	2	6	518635	518640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_016931	AAG	2	6	518647	518652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016931	TTA	2	6	518655	518660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_016931	AGG	2	6	518728	518733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_016931	GCA	2	6	518753	518758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_016931	CCA	2	6	518809	518814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_016931	ATTTT	2	10	518840	518849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_016931	TTTA	2	8	518877	518884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016931	ATT	2	6	518960	518965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016931	TTA	2	6	518966	518971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_016931	GCTG	2	8	519022	519029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_016931	TG	3	6	519028	519033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016931	AAAT	2	8	519073	519080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_016931	A	7	7	519086	519092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016931	A	6	6	519102	519107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_016931	A	6	6	519126	519131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_016931	AG	3	6	519136	519141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_016931	TAA	2	6	519142	519147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016931	TAT	2	6	520351	520356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_016931	A	6	6	520358	520363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016931	TAA	2	6	520389	520394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_016931	GCT	2	6	520411	520416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_016931	AGA	2	6	520422	520427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_016931	AGG	2	6	520434	520439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016931	TATAA	2	10	520462	520471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016931	A	7	7	520542	520548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016931	TGTT	2	8	521560	521567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016931	ATT	2	6	521607	521612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016931	TA	3	6	521613	521618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016931	T	7	7	521623	521629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016931	ATTA	2	8	523404	523411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_016931	T	6	6	525593	525598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_016931	TTTAT	2	10	525625	525634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_016931	A	6	6	525646	525651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016931	AGT	2	6	525657	525662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016931	AT	4	8	526911	526918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016931	GTAA	2	8	529113	529120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016931	T	7	7	531768	531774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016931	ATT	2	6	531777	531782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016931	ATT	2	6	531809	531814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016931	TAA	2	6	534383	534388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016931	ATT	2	6	534400	534405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016931	TAAT	2	8	534414	534421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_016931	A	6	6	534422	534427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016931	CGG	2	6	534478	534483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_016931	CCA	2	6	534501	534506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_016931	AATG	2	8	534544	534551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016931	TAG	2	6	534685	534690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016931	AAGTG	2	10	534707	534716	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016931	CT	3	6	534731	534736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_016931	GAA	2	6	534751	534756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_016931	TAA	2	6	534760	534765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_016931	AAG	2	6	534784	534789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016931	TAAA	2	8	534835	534842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016931	T	6	6	534948	534953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016931	ATTAC	2	10	534991	535000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3631	NC_016931	GAT	2	6	535040	535045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_016931	CAA	2	6	535086	535091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_016931	AAT	2	6	535109	535114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_016931	GCTC	2	8	535220	535227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3636	NC_016931	ATT	2	6	535286	535291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_016931	A	9	9	535325	535333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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