MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016931	TGA	2	6	458732	458737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016931	TAT	2	6	459960	459965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016931	TTG	2	6	460005	460010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016931	GTC	2	6	460023	460028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_016931	GCGA	2	8	460032	460039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_016931	TTC	2	6	460068	460073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016931	A	6	6	460122	460127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016931	CAA	2	6	460138	460143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_016931	ATAA	2	8	460162	460169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016931	GCA	2	6	460183	460188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016931	CA	3	6	460193	460198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_016931	AAT	2	6	460231	460236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016931	TTTA	2	8	460294	460301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016931	TA	3	6	460309	460314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016931	GCAG	2	8	460351	460358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_016931	AT	4	8	460371	460378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016931	AAT	2	6	460383	460388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016931	AAAT	2	8	460416	460423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016931	ATTT	2	8	460439	460446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016931	T	6	6	460466	460471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016931	TTA	2	6	460502	460507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016931	ATT	2	6	460544	460549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016931	ATTA	2	8	460579	460586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016931	T	6	6	460851	460856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016931	TA	3	6	460936	460941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016931	AT	3	6	460965	460970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016931	TA	3	6	460975	460980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016931	A	7	7	462756	462762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016931	GAG	2	6	462772	462777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016931	ATA	2	6	462803	462808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016931	A	6	6	462808	462813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016931	T	7	7	462829	462835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016931	GCTT	2	8	462840	462847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_016931	ATG	2	6	462876	462881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016931	CA	3	6	462892	462897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_016931	AAC	2	6	462997	463002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016931	AT	3	6	463054	463059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016931	AT	3	6	463071	463076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016931	TA	4	8	463083	463090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016931	TA	4	8	463108	463115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016931	AGA	2	6	463272	463277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016931	AT	3	6	464359	464364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016931	TAA	3	9	464380	464388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016931	AAT	2	6	464389	464394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016931	ATT	2	6	464446	464451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016931	TCT	2	6	464458	464463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016931	AATATG	2	12	464468	464479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016931	TAT	2	6	464489	464494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016931	A	6	6	465090	465095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016931	ATT	2	6	466384	466389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016931	CAA	2	6	466439	466444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016931	GAT	2	6	466462	466467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016931	CA	3	6	466479	466484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_016931	ATA	2	6	466507	466512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_016931	TAT	2	6	466544	466549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016931	A	7	7	466571	466577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016931	AGTA	2	8	467030	467037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016931	ATT	2	6	467040	467045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016931	TAG	2	6	467108	467113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016931	TAA	2	6	467129	467134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016931	TATT	2	8	467155	467162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016931	TAA	2	6	467562	467567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016931	TG	3	6	467568	467573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016931	TTCC	2	8	467579	467586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_016931	AAT	2	6	467601	467606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016931	ATC	2	6	467619	467624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_016931	TTG	2	6	467643	467648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016931	ACC	2	6	467712	467717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_016931	AAC	2	6	467720	467725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_016931	TTC	2	6	467790	467795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_016931	GCT	2	6	467797	467802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_016931	T	6	6	467802	467807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016931	T	6	6	467827	467832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016931	CAT	2	6	467833	467838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_016931	TA	3	6	467991	467996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016931	ATT	2	6	468134	468139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016931	TAA	2	6	468143	468148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016931	AT	3	6	468159	468164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016931	T	6	6	468176	468181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016931	T	7	7	468248	468254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3086	NC_016931	TTA	2	6	468290	468295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_016931	ATTT	2	8	468417	468424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_016931	TAA	3	9	468454	468462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_016931	TTAC	2	8	468641	468648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3101	NC_016931	TAGT	2	8	468828	468835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016931	ATTA	2	8	468990	468997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016931	ATT	2	6	469056	469061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016931	TA	3	6	469081	469086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016931	AT	3	6	469149	469154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016931	ATT	2	6	469203	469208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016931	ATGG	2	8	469219	469226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016931	ATG	2	6	469336	469341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016931	TAA	2	6	469372	469377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016931	AAC	2	6	469436	469441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_016931	GGCAA	2	10	469464	469473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_016931	AGT	2	6	469476	469481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_016931	ACTG	2	8	469607	469614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_016931	GCA	2	6	469636	469641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3120	NC_016931	A	7	7	469652	469658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016931	A	6	6	469778	469783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016931	TACAT	2	10	469829	469838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3123	NC_016931	TAAAG	2	10	469849	469858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016931	AAG	2	6	469873	469878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_016931	TCT	2	6	469945	469950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016931	AAAT	2	8	470004	470011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016931	GGTA	2	8	470024	470031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016931	TTA	2	6	470055	470060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_016931	CAT	2	6	470090	470095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_016931	TAT	2	6	470100	470105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016931	AAC	2	6	470165	470170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_016931	AAT	3	9	470205	470213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016931	A	6	6	470261	470266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_016931	ATT	3	9	470367	470375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_016931	TATC	2	8	470401	470408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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