MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016931	TTC	2	6	61847	61852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016931	T	6	6	61903	61908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016931	AT	3	6	61912	61917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016931	CTTGA	2	10	61945	61954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_016931	ATT	2	6	61965	61970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016931	TTA	2	6	62214	62219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016931	CTT	2	6	62290	62295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016931	CTGA	2	8	62301	62308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016931	TAT	2	6	62338	62343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016931	AT	3	6	62359	62364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016931	AAT	2	6	62394	62399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016931	ATT	2	6	62908	62913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016931	T	7	7	62932	62938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016931	TA	3	6	62940	62945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016931	CTT	2	6	62975	62980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016931	ATTA	2	8	62982	62989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016931	AT	3	6	63007	63012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016931	TTATT	2	10	63035	63044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016931	ATC	2	6	63069	63074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_016931	TGCT	2	8	63105	63112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_016931	TAA	2	6	63126	63131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016931	TTTTA	2	10	63140	63149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016931	TCA	2	6	63198	63203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016931	ATT	2	6	63227	63232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016931	GCTT	2	8	63233	63240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_016931	AT	3	6	63286	63291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016931	AAT	2	6	63295	63300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016931	AGAGTT	2	12	63357	63368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016931	T	6	6	63382	63387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016931	TAG	2	6	63417	63422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016931	GTT	3	9	64067	64075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016931	TAA	2	6	64081	64086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016931	GAT	2	6	64127	64132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016931	AT	3	6	64142	64147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016931	TAT	2	6	64163	64168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016931	AAAT	2	8	64169	64176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016931	TA	3	6	65387	65392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016931	AT	3	6	65393	65398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016931	ATT	2	6	65413	65418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016931	TTG	2	6	66152	66157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016931	TACC	2	8	66257	66264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_016931	AAAC	2	8	66265	66272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_016931	TAAT	2	8	66341	66348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016931	TAA	2	6	66392	66397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016931	A	6	6	66399	66404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016931	T	7	7	66406	66412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016931	AGTA	2	8	66434	66441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016931	AGG	2	6	66464	66469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016931	GCA	2	6	66474	66479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016931	ATT	2	6	66483	66488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016931	CGG	2	6	66490	66495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016931	TCT	2	6	66504	66509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016931	AGC	2	6	67279	67284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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555	NC_016931	AGC	2	6	67318	67323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016931	TAG	2	6	67326	67331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016931	TAG	2	6	67341	67346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016931	AGA	2	6	67645	67650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016931	ATA	2	6	67712	67717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016931	TAG	2	6	67787	67792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016931	CAA	2	6	67909	67914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016931	A	7	7	67940	67946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016931	AGA	2	6	67951	67956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016931	A	6	6	68030	68035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016931	CAAT	2	8	68060	68067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_016931	AAG	2	6	68117	68122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016931	ATA	2	6	68198	68203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016931	AAG	2	6	68216	68221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016931	ATG	2	6	68237	68242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016931	TGT	2	6	68247	68252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016931	AAAAC	2	10	68260	68269	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
572	NC_016931	TTA	2	6	68281	68286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016931	ATA	2	6	68318	68323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016931	A	7	7	68325	68331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016931	GTA	2	6	68332	68337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016931	ACT	2	6	68401	68406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_016931	TGA	2	6	68459	68464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016931	A	6	6	68484	68489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016931	TA	3	6	68533	68538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016931	CGG	2	6	68572	68577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016931	CGG	2	6	68584	68589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016931	ATT	2	6	68702	68707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_016931	AAAG	2	8	68818	68825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016931	ATA	2	6	68872	68877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016931	TAT	2	6	68938	68943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_016931	GAG	2	6	69039	69044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_016931	TGA	2	6	69271	69276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_016931	TAA	2	6	69324	69329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_016931	ATAAA	2	10	69375	69384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016931	A	6	6	69382	69387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016931	ATTT	2	8	69393	69400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016931	AATC	2	8	69401	69408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_016931	TAA	2	6	69421	69426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_016931	GAT	2	6	69717	69722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016931	TAAT	2	8	69961	69968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016931	TA	3	6	69971	69976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016931	AAT	2	6	70085	70090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016931	GTT	2	6	70123	70128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016931	TAA	2	6	70153	70158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016931	GTCTTT	2	12	70159	70170	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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614	NC_016931	AATA	2	8	70195	70202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016931	TTTC	2	8	70207	70214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_016931	AAG	2	6	70286	70291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_016931	AGT	2	6	70351	70356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016931	ACT	2	6	70395	70400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016931	TGA	2	6	70461	70466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016931	AAC	2	6	70484	70489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016931	GAT	2	6	70504	70509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016931	CAA	2	6	70627	70632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016931	GTT	2	6	70735	70740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016931	TTA	2	6	70835	70840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016931	CTT	2	6	70844	70849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016931	CTT	2	6	70852	70857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016931	AT	3	6	70891	70896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016931	ATC	2	6	70901	70906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016931	ATCA	2	8	70944	70951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_016931	TGA	2	6	70970	70975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016931	ATA	2	6	70978	70983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016931	TAG	2	6	71040	71045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016931	TAT	2	6	71046	71051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016931	TTA	2	6	71210	71215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016931	AAG	2	6	71222	71227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016931	TAA	2	6	71234	71239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016931	TAA	2	6	71250	71255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016931	GCT	2	6	71296	71301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_016931	TAA	2	6	71330	71335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016931	AAAGA	2	10	71417	71426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_016931	A	7	7	71483	71489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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931	NC_016931	A	6	6	128278	128283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
932	NC_016931	AT	3	6	128288	128293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
933	NC_016931	TA	3	6	128570	128575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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947	NC_016931	AAG	2	6	131429	131434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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