MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016931	TTC	2	6	1221535	1221540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_016931	GT	3	6	1221591	1221596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_016931	ATT	2	6	1221631	1221636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_016931	TGC	2	6	1221688	1221693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_016931	T	6	6	1221767	1221772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_016931	GTA	2	6	1221795	1221800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_016931	ATT	2	6	1221897	1221902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_016931	CCAG	2	8	1221983	1221990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8509	NC_016931	TGC	2	6	1222053	1222058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_016931	TTAC	2	8	1222064	1222071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8511	NC_016931	CAA	2	6	1222109	1222114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_016931	TTTA	2	8	1222163	1222170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_016931	TC	3	6	1224316	1224321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8514	NC_016931	TAA	2	6	1224390	1224395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_016931	AAT	2	6	1224396	1224401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_016931	GTAA	2	8	1224598	1224605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_016931	TG	3	6	1224984	1224989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_016931	GTT	2	6	1225054	1225059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_016931	TCTCT	2	10	1225095	1225104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8520	NC_016931	TCA	2	6	1225166	1225171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_016931	TA	3	6	1225230	1225235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_016931	AGC	2	6	1225256	1225261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_016931	ATA	2	6	1225288	1225293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_016931	TCG	2	6	1225313	1225318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_016931	TTC	2	6	1225332	1225337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_016931	GCAA	2	8	1225363	1225370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_016931	ATT	2	6	1225383	1225388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_016931	ATA	2	6	1228489	1228494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_016931	TA	3	6	1228528	1228533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_016931	AAT	2	6	1228544	1228549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_016931	T	6	6	1228553	1228558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_016931	GTT	2	6	1228572	1228577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_016931	T	6	6	1228576	1228581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_016931	TAA	3	9	1228601	1228609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_016931	AAG	2	6	1228614	1228619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_016931	ATT	2	6	1228625	1228630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_016931	A	7	7	1228637	1228643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_016931	AACAG	2	10	1228665	1228674	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8539	NC_016931	ACAGA	2	10	1228775	1228784	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8540	NC_016931	TAA	4	12	1228828	1228839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_016931	AAT	2	6	1228849	1228854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_016931	A	6	6	1228861	1228866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_016931	AATG	2	8	1228944	1228951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_016931	TAA	2	6	1228980	1228985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_016931	TTA	2	6	1228995	1229000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_016931	TGA	2	6	1229006	1229011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_016931	TAC	2	6	1229023	1229028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_016931	ATT	2	6	1229039	1229044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_016931	AAGC	2	8	1229056	1229063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8550	NC_016931	GAAA	2	8	1229088	1229095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_016931	GAA	2	6	1229110	1229115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_016931	AAT	2	6	1229140	1229145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_016931	AAG	2	6	1229151	1229156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_016931	AT	3	6	1229201	1229206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_016931	ATT	2	6	1229217	1229222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_016931	AAC	2	6	1229230	1229235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_016931	TGG	2	6	1229245	1229250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_016931	AAT	2	6	1229251	1229256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_016931	TAT	2	6	1229280	1229285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_016931	AATA	2	8	1229323	1229330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_016931	GGT	2	6	1229332	1229337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_016931	GATA	2	8	1229421	1229428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_016931	A	6	6	1229465	1229470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_016931	ATT	2	6	1229530	1229535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_016931	ATA	2	6	1229630	1229635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_016931	TAAT	2	8	1229636	1229643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_016931	AAAT	2	8	1229742	1229749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_016931	ATG	2	6	1229766	1229771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8572	NC_016931	TAT	2	6	1229899	1229904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_016931	GTA	2	6	1229915	1229920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8581	NC_016931	AAATT	2	10	1230179	1230188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_016931	A	6	6	1230233	1230238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8588	NC_016931	ATA	2	6	1230591	1230596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_016931	AAAT	2	8	1230623	1230630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8593	NC_016931	TTC	2	6	1230855	1230860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8595	NC_016931	A	6	6	1230944	1230949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8601	NC_016931	ATA	2	6	1231119	1231124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_016931	TA	3	6	1231154	1231159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_016931	AAT	2	6	1231195	1231200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_016931	A	6	6	1232486	1232491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_016931	TGTT	2	8	1234065	1234072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_016931	T	6	6	1234076	1234081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_016931	ATGG	2	8	1234144	1234151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8612	NC_016931	A	6	6	1234778	1234783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_016931	T	6	6	1234788	1234793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_016931	GATAAA	2	12	1236958	1236969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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8616	NC_016931	CGCTC	2	10	1237073	1237082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8617	NC_016931	TTC	2	6	1237132	1237137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_016931	AAT	2	6	1237152	1237157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_016931	A	7	7	1237200	1237206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_016931	ATT	2	6	1237217	1237222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_016931	GTG	2	6	1237234	1237239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_016931	TTA	2	6	1237251	1237256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_016931	ATA	2	6	1237261	1237266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_016931	ATT	2	6	1237308	1237313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_016931	TTA	2	6	1237335	1237340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_016931	TA	3	6	1237471	1237476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_016931	AATA	2	8	1237528	1237535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_016931	TAT	2	6	1237585	1237590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_016931	CAAA	2	8	1238048	1238055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8630	NC_016931	A	6	6	1238099	1238104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_016931	AGA	2	6	1238225	1238230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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