MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016930	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016930	TAAA	2	8	6327	6334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016930	ATTA	2	8	10888	10895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016930	ATTA	2	8	11102	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016930	ATCT	2	8	11408	11415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016930	TTAG	2	8	14451	14458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016930	TTGC	2	8	16032	16039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016930	TAAA	2	8	18139	18146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016930	AAAC	2	8	18187	18194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016930	TAAA	2	8	18262	18269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016930	TTAT	2	8	18460	18467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016930	ACTA	2	8	24155	24162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016930	TAAA	2	8	26866	26873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016930	AGGA	2	8	26924	26931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016930	TAAA	2	8	26956	26963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016930	GCTA	2	8	26966	26973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016930	TAAT	2	8	28213	28220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016930	AATG	2	8	35944	35951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016930	GTTT	2	8	36446	36453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016930	ATAA	2	8	36937	36944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016930	AACA	2	8	37034	37041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016930	CTGA	2	8	38987	38994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016930	ATTG	2	8	39165	39172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016930	ATTA	2	8	39593	39600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016930	ATTA	2	8	39648	39655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016930	TGCT	2	8	39771	39778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016930	GCTT	2	8	39898	39905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016930	ATTA	2	8	40379	40386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016930	TAAT	2	8	40672	40679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016930	ATTA	2	8	40742	40749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016930	AAAT	2	8	40846	40853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016930	TACC	2	8	42926	42933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016930	AAAC	2	8	42934	42941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016930	TAAT	2	8	43010	43017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016930	ATTT	2	8	43037	43044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016930	ATTA	2	8	43045	43052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016930	AAAT	2	8	43064	43071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016930	AAAT	2	8	43079	43086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016930	AGTA	2	8	46982	46989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016930	ATAC	2	8	47200	47207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016930	AAGT	2	8	47751	47758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016930	CTTG	2	8	48219	48226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016930	ATCT	2	8	48797	48804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016930	TGCT	2	8	48962	48969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016930	TTTA	2	8	49373	49380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016930	TCAC	2	8	49482	49489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016930	TAAA	2	8	49522	49529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016930	TTTA	2	8	50255	50262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016930	ATTA	2	8	50637	50644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016930	ATTA	2	8	53462	53469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016930	TAAA	2	8	54081	54088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016930	ATCT	2	8	55286	55293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016930	AACG	2	8	56665	56672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016930	TTAA	2	8	57266	57273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016930	TAAA	2	8	60412	60419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016930	ATTT	2	8	60433	60440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016930	ATTT	2	8	62429	62436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016930	TTAA	2	8	64002	64009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016930	TAGT	2	8	64490	64497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016930	ATAA	2	8	66540	66547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016930	AAGT	2	8	70488	70495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016930	CAAT	2	8	72083	72090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016930	CAAT	2	8	72818	72825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016930	TAAA	2	8	73761	73768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016930	TTTA	2	8	73806	73813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016930	AAAT	2	8	73880	73887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016930	TAAA	2	8	75450	75457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016930	ATTT	2	8	75480	75487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016930	AAAT	2	8	81431	81438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016930	TATC	2	8	85248	85255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016930	TAGC	2	8	85351	85358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016930	AGGT	2	8	86094	86101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016930	TAAA	2	8	90784	90791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016930	TTTA	2	8	93454	93461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016930	AAAT	2	8	93478	93485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016930	AATT	2	8	93702	93709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016930	TAAA	2	8	95057	95064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016930	ATTA	2	8	95305	95312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016930	AATG	2	8	96514	96521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016930	TCCA	2	8	98280	98287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016930	AAGC	2	8	98375	98382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016930	ATGT	2	8	100433	100440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016930	TTTA	2	8	101358	101365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016930	AAAG	2	8	105202	105209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016930	ATTT	2	8	105353	105360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016930	TTTA	2	8	105394	105401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016930	ATTC	2	8	111005	111012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016930	ATTA	2	8	111086	111093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016930	GAAA	2	8	111207	111214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016930	ACTC	2	8	115151	115158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016930	CAAA	2	8	115173	115180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016930	CTAT	2	8	115244	115251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016930	AAGT	2	8	118500	118507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016930	AAAT	2	8	119848	119855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016930	CTAC	2	8	120369	120376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016930	AGTA	2	8	120472	120479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016930	CGCT	2	8	123073	123080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016930	TCAC	2	8	123102	123109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016930	GCAG	2	8	123122	123129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016930	ATTC	2	8	127579	127586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016930	TAAT	2	8	127600	127607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016930	TTTA	2	8	127773	127780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016930	TAAT	2	8	129417	129424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016930	TTTG	2	8	130251	130258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016930	TGAT	2	8	149595	149602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016930	ATTA	2	8	149863	149870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016930	CGAT	2	8	150103	150110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016930	TAAT	2	8	150238	150245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016930	TAGA	2	8	150636	150643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016930	ATTT	2	8	150922	150929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016930	AAAG	2	8	152250	152257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016930	GGTG	2	8	152622	152629	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016930	ATAA	2	8	152632	152639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016930	TAAA	2	8	160928	160935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016930	TCTA	2	8	165350	165357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016930	TTTA	2	8	165360	165367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016930	TTTA	2	8	167956	167963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016930	TCAT	2	8	170809	170816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016930	TGTT	2	8	174840	174847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016930	ATTA	2	8	176005	176012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016930	TTAA	2	8	178158	178165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016930	ATAA	2	8	179309	179316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016930	TCAG	2	8	179534	179541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016930	CTAG	2	8	188332	188339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016930	TTAC	2	8	191408	191415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016930	GGAT	2	8	194903	194910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016930	AGTA	2	8	199045	199052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016930	ATTG	2	8	199189	199196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016930	CTTT	2	8	204212	204219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016930	TTTA	2	8	205343	205350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016930	TATT	2	8	208326	208333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016930	TGAT	2	8	208402	208409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016930	TTAA	2	8	208434	208441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016930	TATT	2	8	209007	209014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016930	AGGT	2	8	209428	209435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016930	AACC	2	8	209557	209564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016930	ATTT	2	8	209838	209845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016930	GCGA	2	8	210453	210460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016930	CTAA	2	8	213038	213045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016930	TAAT	2	8	213068	213075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016930	AGCA	2	8	213107	213114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016930	ATTT	2	8	215059	215066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016930	ATTT	2	8	215805	215812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016930	TAAA	2	8	216959	216966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016930	TAAT	2	8	226807	226814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016930	AAGT	2	8	226921	226928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016930	AATG	2	8	227117	227124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016930	AGCT	2	8	227907	227914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016930	ATTT	2	8	228063	228070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016930	TTTC	2	8	231851	231858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016930	TTAG	2	8	232277	232284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016930	TACT	2	8	233497	233504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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