MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 8039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016929	TAT	2	6	445461	445466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016929	TTA	2	6	445828	445833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016929	AAAT	2	8	445864	445871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016929	TGA	2	6	445909	445914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016929	T	6	6	445967	445972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016929	TCAAA	2	10	446080	446089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_016929	ATT	2	6	446091	446096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016929	AAAC	2	8	446127	446134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_016929	ATG	2	6	446163	446168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016929	ATA	2	6	446180	446185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016929	TAC	2	6	446217	446222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016929	TAT	2	6	446232	446237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016929	TAG	2	6	446428	446433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016929	AAT	2	6	446457	446462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016929	ATA	2	6	446463	446468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016929	TAC	2	6	446506	446511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_016929	ATTA	2	8	446531	446538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016929	A	6	6	446548	446553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016929	TAA	2	6	446554	446559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016929	AAG	2	6	448038	448043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016929	AG	3	6	448082	448087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016929	GGT	2	6	448088	448093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016929	TTA	2	6	448129	448134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016929	ATA	2	6	448197	448202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016929	CAA	2	6	448215	448220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016929	ATA	2	6	448224	448229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016929	ATA	2	6	448236	448241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016929	AAAT	2	8	448260	448267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016929	TCT	2	6	448277	448282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016929	TG	3	6	448310	448315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016929	AT	3	6	448316	448321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016929	AAG	2	6	448347	448352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016929	TTTTAG	2	12	448369	448380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016929	ATT	2	6	448472	448477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016929	TA	4	8	448503	448510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016929	ATT	2	6	448541	448546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016929	TAT	2	6	448549	448554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016929	T	7	7	448586	448592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016929	AAG	2	6	448652	448657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016929	ATG	2	6	448698	448703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016929	ACATT	2	10	450673	450682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_016929	TAAAA	2	10	451268	451277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016929	AT	3	6	451285	451290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016929	T	6	6	451311	451316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016929	T	6	6	451325	451330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016929	CTT	2	6	451336	451341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_016929	CT	3	6	451350	451355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_016929	ATA	2	6	451356	451361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016929	T	6	6	451420	451425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016929	T	6	6	451429	451434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016929	ATC	2	6	451580	451585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016929	AATA	2	8	451599	451606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016929	ATTAT	2	10	451614	451623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016929	CTA	2	6	451636	451641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016929	ATT	2	6	451649	451654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016929	A	6	6	451687	451692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016929	TCTT	2	8	451741	451748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_016929	ATCAT	2	10	451780	451789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3059	NC_016929	ATA	2	6	451795	451800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016929	AATA	3	12	451797	451808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_016929	A	6	6	451847	451852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016929	TAG	2	6	451925	451930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016929	ACAA	2	8	452494	452501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_016929	CAA	2	6	452527	452532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_016929	T	6	6	452563	452568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016929	ATA	2	6	452599	452604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016929	TTA	2	6	452607	452612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016929	TAA	2	6	452688	452693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016929	TA	3	6	452715	452720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016929	TAT	2	6	452776	452781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016929	TAA	2	6	452792	452797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016929	T	6	6	452864	452869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016929	T	6	6	452934	452939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016929	AAC	2	6	452940	452945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_016929	ATA	2	6	452952	452957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016929	T	7	7	452999	453005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_016929	TAA	2	6	453008	453013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016929	GTT	2	6	453045	453050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016929	TGATTT	2	12	453057	453068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016929	AAG	2	6	453081	453086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016929	TAT	2	6	453110	453115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016929	TGT	2	6	453121	453126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016929	CTCA	2	8	453130	453137	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_016929	CAT	2	6	453145	453150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3086	NC_016929	ATG	2	6	453215	453220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016929	TAT	2	6	453231	453236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016929	AAAAT	2	10	453365	453374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016929	T	6	6	453391	453396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016929	GAA	2	6	453473	453478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016929	A	6	6	453493	453498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016929	TTAGAG	2	12	453503	453514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016929	CAA	2	6	453544	453549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016929	TTA	2	6	453560	453565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016929	TAAA	2	8	453584	453591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016929	TAA	2	6	453608	453613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016929	ATC	2	6	453635	453640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_016929	CTT	2	6	453655	453660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_016929	TCT	2	6	453666	453671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_016929	AAT	2	6	453735	453740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016929	TTAC	2	8	454238	454245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_016929	TTA	2	6	454297	454302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_016929	TG	3	6	454303	454308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016929	CAA	2	6	454310	454315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_016929	ATG	2	6	454323	454328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016929	TCTT	2	8	454334	454341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_016929	CAT	2	6	454343	454348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_016929	AAT	2	6	454377	454382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016929	AGT	2	6	454390	454395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016929	TA	3	6	454459	454464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016929	AT	3	6	454465	454470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_016929	T	7	7	454481	454487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016929	T	6	6	454502	454507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016929	TAC	2	6	454582	454587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_016929	GCTA	2	8	454609	454616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_016929	T	6	6	454617	454622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016929	GTT	2	6	454623	454628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016929	GCA	2	6	454672	454677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_016929	TTCC	2	8	454694	454701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_016929	T	6	6	454709	454714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016929	TATT	2	8	454728	454735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016929	A	7	7	454749	454755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016929	TAT	2	6	454793	454798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016929	TTC	2	6	454821	454826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_016929	ATG	2	6	454858	454863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016929	GTC	2	6	454887	454892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016929	AGT	2	6	454921	454926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016929	TTA	2	6	454976	454981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016929	TAA	2	6	455021	455026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_016929	GCA	2	6	455059	455064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_016929	TTTA	2	8	455074	455081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016929	ATA	2	6	455107	455112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_016929	T	7	7	455119	455125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016929	TAAT	2	8	455136	455143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_016929	CTA	2	6	455243	455248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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