MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 8039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016929	A	7	7	69555	69561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016929	ACAAT	2	10	69582	69591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
503	NC_016929	AT	3	6	69619	69624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016929	TAA	3	9	69681	69689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016929	TTA	2	6	69743	69748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016929	TA	3	6	69805	69810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016929	ATT	2	6	69814	69819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016929	T	6	6	69852	69857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016929	TGA	2	6	69882	69887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016929	A	6	6	69922	69927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016929	GAA	2	6	69981	69986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016929	TTA	2	6	70005	70010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016929	TTA	2	6	70045	70050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016929	GTAG	2	8	70116	70123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016929	AGT	2	6	70135	70140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016929	T	6	6	70159	70164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016929	GAA	2	6	70193	70198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016929	TA	3	6	70208	70213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016929	AAT	2	6	70215	70220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016929	TA	3	6	70244	70249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016929	GTG	2	6	70259	70264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016929	ATA	2	6	70301	70306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016929	ATT	2	6	70343	70348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016929	A	6	6	70373	70378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016929	ATA	2	6	70404	70409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016929	A	6	6	70438	70443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016929	ATAA	2	8	70472	70479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016929	ACA	2	6	70517	70522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016929	T	6	6	70525	70530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016929	TA	3	6	70977	70982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016929	AT	3	6	70983	70988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016929	GGT	2	6	71004	71009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016929	TTG	2	6	71011	71016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016929	T	6	6	71065	71070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016929	TAA	2	6	72302	72307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016929	TGC	2	6	72328	72333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016929	TTA	2	6	72358	72363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016929	TAA	2	6	72398	72403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016929	TTA	2	6	74178	74183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016929	TATTT	2	10	74211	74220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016929	TTA	2	6	74891	74896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016929	ACA	2	6	74984	74989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016929	A	7	7	74989	74995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016929	ACA	2	6	75042	75047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016929	TA	3	6	77299	77304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016929	ACTAA	2	10	77413	77422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_016929	AGA	2	6	77440	77445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016929	TAA	2	6	77475	77480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016929	A	6	6	77502	77507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016929	AAT	2	6	77512	77517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016929	TAA	2	6	77549	77554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016929	TGA	2	6	77555	77560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016929	ATT	2	6	77562	77567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016929	GTAA	2	8	77594	77601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016929	AAT	2	6	77618	77623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016929	A	6	6	79029	79034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016929	TA	3	6	79046	79051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016929	TAA	2	6	79085	79090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016929	A	6	6	79099	79104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016929	TGT	2	6	79143	79148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016929	ATT	2	6	79149	79154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016929	TTGTA	2	10	79206	79215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016929	AAT	2	6	79216	79221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016929	ATT	2	6	79233	79238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016929	ATTA	2	8	79244	79251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016929	T	6	6	79835	79840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016929	A	6	6	79845	79850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016929	TTA	2	6	79852	79857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016929	A	6	6	79869	79874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016929	AAT	2	6	79876	79881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016929	TAAG	2	8	79887	79894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016929	TATAAA	2	12	79899	79910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016929	TAA	2	6	79916	79921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016929	ATT	2	6	80401	80406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016929	AGATA	2	10	80447	80456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016929	TAT	2	6	80501	80506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_016929	ATTA	2	8	80543	80550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016929	TAAC	2	8	80555	80562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_016929	AATTA	2	10	80566	80575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016929	ATT	2	6	80591	80596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016929	T	6	6	82156	82161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016929	A	8	8	82169	82176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_016929	ATA	2	6	82369	82374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016929	GCAA	2	8	82392	82399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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592	NC_016929	T	6	6	82999	83004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016929	TAA	2	6	83093	83098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016929	A	7	7	83097	83103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016929	TCA	2	6	83136	83141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016929	A	6	6	83171	83176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_016929	T	8	8	83227	83234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_016929	ACT	2	6	83348	83353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016929	TAT	2	6	83382	83387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016929	TAA	2	6	83442	83447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_016929	AT	3	6	83721	83726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016929	GAT	2	6	83795	83800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016929	ATC	2	6	83846	83851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016929	TTA	2	6	83862	83867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016929	TAA	2	6	83981	83986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016929	CTG	2	6	84020	84025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016929	TAT	2	6	84091	84096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016929	AAT	2	6	84098	84103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016929	TAAA	2	8	84138	84145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016929	CT	3	6	84152	84157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016929	ATT	2	6	84189	84194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016929	TTA	2	6	84225	84230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016929	AATT	2	8	84311	84318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016929	CTGC	2	8	84325	84332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_016929	AAT	2	6	84458	84463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016929	TCC	2	6	84464	84469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016929	TAA	2	6	84482	84487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016929	TAG	2	6	84490	84495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016929	A	6	6	84531	84536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016929	ATAAA	2	10	84623	84632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016929	AT	3	6	84679	84684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016929	AT	4	8	85511	85518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016929	TA	3	6	85519	85524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016929	ATA	2	6	87753	87758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016929	TTC	2	6	87774	87779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016929	CTA	2	6	87830	87835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_016929	TAG	2	6	87894	87899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016929	AT	3	6	87908	87913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016929	TTTAT	2	10	87989	87998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016929	ATA	2	6	88014	88019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016929	TTA	2	6	88383	88388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016929	GTA	2	6	88431	88436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016929	TTG	2	6	88439	88444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016929	TAC	2	6	88457	88462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_016929	A	6	6	88489	88494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016929	T	6	6	88537	88542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016929	CAA	2	6	88590	88595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_016929	AAT	2	6	88619	88624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_016929	ATT	2	6	89329	89334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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