MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 8039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016929	TAAA	2	8	835103	835110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016929	AAT	3	9	835158	835166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016929	TTGC	2	8	835167	835174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_016929	T	6	6	835221	835226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016929	AAT	2	6	835231	835236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016929	CTA	2	6	835271	835276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016929	TCAAGA	2	12	835341	835352	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6008	NC_016929	A	6	6	835364	835369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016929	GTT	2	6	835382	835387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016929	ATC	2	6	835442	835447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016929	TAG	2	6	835477	835482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_016929	TTA	2	6	838718	838723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016929	TAT	2	6	838734	838739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_016929	GCA	2	6	838797	838802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016929	TAC	2	6	838809	838814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_016929	T	7	7	841341	841347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016929	ATT	2	6	841348	841353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016929	A	7	7	841354	841360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016929	TA	3	6	841382	841387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016929	ATT	2	6	841407	841412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016929	AAC	2	6	841435	841440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016929	TTA	2	6	842664	842669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016929	ATT	2	6	842888	842893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016929	CTA	2	6	842924	842929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016929	ACA	2	6	842931	842936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_016929	T	6	6	842948	842953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016929	A	7	7	842954	842960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016929	TTTA	2	8	842961	842968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016929	A	7	7	842976	842982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016929	ATT	2	6	843019	843024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016929	GAG	2	6	843057	843062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016929	ACA	2	6	843152	843157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_016929	AAT	2	6	843170	843175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016929	TAT	2	6	843176	843181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016929	ATTT	3	12	843188	843199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016929	AAT	2	6	843235	843240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016929	TATATT	2	12	843253	843264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016929	TAAA	2	8	843267	843274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016929	AAT	2	6	843291	843296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016929	AAAAT	2	10	843314	843323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016929	AAT	2	6	843336	843341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016929	CAAA	2	8	845229	845236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_016929	CAA	2	6	845261	845266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016929	TATAA	2	10	845290	845299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016929	AATT	2	8	846656	846663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016929	AGT	2	6	846753	846758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016929	AATAT	2	10	846784	846793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016929	AATT	2	8	846842	846849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016929	AGT	2	6	846871	846876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016929	GCTA	2	8	847196	847203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_016929	CATTA	2	10	847215	847224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6052	NC_016929	GAA	2	6	849081	849086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016929	AAG	2	6	849089	849094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016929	A	6	6	849114	849119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016929	TCAT	2	8	853109	853116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_016929	ACG	2	6	853127	853132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_016929	A	6	6	854401	854406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016929	A	7	7	854418	854424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016929	AAG	2	6	854450	854455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016929	ATCTT	2	10	854563	854572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_016929	AAT	2	6	854597	854602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016929	AAC	2	6	854632	854637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016929	GCT	2	6	854656	854661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016929	AAT	2	6	854732	854737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016929	GAA	2	6	854755	854760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016929	A	6	6	854852	854857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016929	ATC	2	6	854906	854911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6069	NC_016929	TAA	2	6	854952	854957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016929	A	6	6	854956	854961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016929	TGG	2	6	854979	854984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6073	NC_016929	T	6	6	855058	855063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016929	ATTA	2	8	855064	855071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_016929	ATT	2	6	855082	855087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_016929	TAA	2	6	855093	855098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016929	GTAT	2	8	855102	855109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016929	TTA	2	6	855127	855132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016929	TTA	2	6	855866	855871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_016929	ATA	2	6	857735	857740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_016929	TAA	2	6	857751	857756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016929	TAC	2	6	860938	860943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_016929	ATT	2	6	862268	862273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_016929	TA	4	8	862593	862600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_016929	GA	3	6	863871	863876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016929	ACCT	2	8	863888	863895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6092	NC_016929	TA	3	6	867873	867878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016929	TA	3	6	867886	867891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016929	ATT	2	6	867897	867902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_016929	AACA	2	8	867939	867946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6100	NC_016929	T	6	6	870222	870227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016929	T	6	6	870246	870251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016929	T	6	6	870261	870266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016929	ATTT	2	8	870272	870279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016929	CT	4	8	870287	870294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_016929	CA	3	6	870319	870324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_016929	TAA	2	6	870381	870386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016929	TAAA	2	8	870468	870475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016929	AT	3	6	870483	870488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016929	TAAAA	2	10	870502	870511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016929	GTG	2	6	870537	870542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_016929	ATC	2	6	870713	870718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6118	NC_016929	ATTT	2	8	870744	870751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016929	TAA	2	6	870767	870772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016929	TAG	2	6	870774	870779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6123	NC_016929	T	6	6	871577	871582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016929	ATA	2	6	871594	871599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_016929	TAA	2	6	871641	871646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_016929	T	6	6	871649	871654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016929	A	6	6	871700	871705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_016929	TTAAT	2	10	871719	871728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016929	CA	4	8	871733	871740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_016929	T	6	6	871903	871908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_016929	CAA	2	6	871920	871925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_016929	ATTA	2	8	871941	871948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_016929	ATA	2	6	871949	871954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_016929	AT	3	6	871964	871969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_016929	AAT	2	6	871981	871986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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