MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 8039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016929	GTA	2	6	717443	717448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016929	AATA	2	8	718216	718223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016929	AAAAGC	2	12	718233	718244	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5004	NC_016929	TA	3	6	718262	718267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016929	AAT	2	6	718268	718273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016929	TAA	2	6	718380	718385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016929	TCA	2	6	718438	718443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_016929	GCAA	2	8	718488	718495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_016929	CAA	2	6	718645	718650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016929	TA	3	6	718655	718660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016929	ATA	2	6	718737	718742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016929	GGATTT	2	12	718763	718774	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016929	GGT	2	6	718791	718796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016929	T	6	6	718825	718830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016929	TTTA	2	8	718875	718882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016929	ATT	2	6	718893	718898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016929	AAAAC	2	10	718929	718938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_016929	AT	3	6	718989	718994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016929	AACAT	2	10	719009	719018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_016929	A	6	6	719086	719091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016929	TA	3	6	719092	719097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016929	T	6	6	719150	719155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016929	AAG	2	6	719233	719238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016929	TAA	2	6	719245	719250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016929	TATT	2	8	719313	719320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016929	TAA	2	6	719379	719384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016929	A	6	6	719383	719388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016929	TTA	2	6	719389	719394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016929	GGA	2	6	719419	719424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016929	GAA	2	6	719443	719448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016929	TAA	2	6	719478	719483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016929	AT	3	6	719498	719503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016929	CGA	2	6	719520	719525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_016929	TAATT	2	10	719539	719548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016929	AGA	2	6	719563	719568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016929	ATT	2	6	719591	719596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016929	A	6	6	719598	719603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016929	ATG	2	6	719613	719618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016929	TAA	2	6	719625	719630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016929	AAAT	2	8	719733	719740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016929	AAC	2	6	719742	719747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_016929	ATC	2	6	719748	719753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_016929	TAAT	2	8	719768	719775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016929	A	6	6	719795	719800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016929	AAT	2	6	719845	719850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016929	ACT	2	6	719854	719859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016929	CACTG	2	10	719862	719871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5048	NC_016929	TCA	2	6	719890	719895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_016929	TTTA	2	8	719929	719936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016929	TAA	2	6	719965	719970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016929	CAA	2	6	719987	719992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_016929	A	6	6	720006	720011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016929	T	6	6	721598	721603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016929	ATA	2	6	721607	721612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016929	A	6	6	721620	721625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016929	TC	3	6	721631	721636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_016929	T	8	8	722648	722655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016929	GCA	2	6	722660	722665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_016929	ATTAAT	2	12	722693	722704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016929	AGTTT	2	10	722731	722740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016929	TAT	2	6	722746	722751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016929	ATGA	2	8	722777	722784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016929	TAA	2	6	722792	722797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016929	TTTA	2	8	722804	722811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016929	A	6	6	722814	722819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016929	TAA	2	6	722890	722895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016929	CAA	2	6	722937	722942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_016929	ATG	2	6	722962	722967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016929	AAGA	2	8	722985	722992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016929	ATTT	2	8	722994	723001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016929	ACCT	2	8	723007	723014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_016929	CTCAA	2	10	723073	723082	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5073	NC_016929	T	6	6	723104	723109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016929	ATT	2	6	723113	723118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016929	TAA	2	6	723146	723151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_016929	A	9	9	723257	723265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016929	AC	3	6	723279	723284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_016929	CAA	2	6	723288	723293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016929	CTTAAA	2	12	723303	723314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5082	NC_016929	ATA	2	6	723320	723325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016929	A	6	6	723573	723578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016929	ATG	2	6	723621	723626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016929	TAGA	2	8	723657	723664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016929	AAG	2	6	723725	723730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016929	AGA	2	6	723806	723811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016929	AGG	2	6	723815	723820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016929	GCT	2	6	723837	723842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_016929	ATA	2	6	724276	724281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_016929	AATT	2	8	725091	725098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016929	GAA	2	6	725104	725109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016929	TAA	2	6	725142	725147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_016929	ATA	2	6	725200	725205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016929	TA	3	6	725229	725234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016929	ATATAA	2	12	725248	725259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016929	ATA	2	6	725266	725271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016929	A	6	6	725273	725278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016929	AAG	2	6	725308	725313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016929	CA	3	6	725327	725332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_016929	GAA	2	6	725398	725403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016929	ATA	2	6	725423	725428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016929	ATA	2	6	726784	726789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016929	ACA	2	6	726803	726808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016929	TAC	2	6	726859	726864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016929	ATC	2	6	726888	726893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_016929	CT	3	6	727004	727009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_016929	A	7	7	727058	727064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_016929	ATA	2	6	727088	727093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016929	CTC	2	6	727100	727105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_016929	T	6	6	727121	727126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016929	TTC	2	6	727153	727158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016929	TCT	2	6	727199	727204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_016929	GATG	2	8	727233	727240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016929	GCT	2	6	727259	727264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_016929	TTG	2	6	727273	727278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016929	TTTATT	2	12	727323	727334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016929	TAC	2	6	727364	727369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5130	NC_016929	T	6	6	727464	727469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016929	TTCT	2	8	727500	727507	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_016929	ATT	2	6	727539	727544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016929	T	6	6	727550	727555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_016929	GAA	2	6	727582	727587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_016929	CTT	2	6	727685	727690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5137	NC_016929	TAA	2	6	727840	727845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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