MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016915	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016915	TG	3	6	17987	17992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016915	AT	3	6	18552	18557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016915	TA	3	6	19702	19707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016915	AT	3	6	19932	19937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016915	AT	3	6	20217	20222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016915	TA	3	6	25864	25869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016915	AT	3	6	26719	26724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016915	AG	3	6	27117	27122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016915	AT	4	8	28634	28641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016915	AT	3	6	34682	34687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016915	TA	3	6	34689	34694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016915	AT	3	6	37517	37522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016915	AT	3	6	37527	37532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016915	TA	3	6	37634	37639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016915	AG	3	6	38065	38070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016915	AT	3	6	38707	38712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016915	GA	3	6	38840	38845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016915	AT	3	6	40172	40177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016915	AT	3	6	40324	40329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016915	TA	3	6	40531	40536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016915	AT	3	6	40655	40660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016915	TA	5	10	40909	40918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016915	TA	3	6	41371	41376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016915	AT	3	6	41438	41443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016915	AT	3	6	42583	42588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016915	TA	3	6	43829	43834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016915	AT	3	6	43835	43840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016915	AT	3	6	48629	48634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016915	AT	3	6	49750	49755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016915	CA	3	6	51038	51043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016915	AT	3	6	51133	51138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016915	AT	3	6	52592	52597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016915	AT	3	6	58473	58478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016915	CT	3	6	58655	58660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016915	CT	4	8	59115	59122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016915	TA	3	6	59387	59392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016915	CT	3	6	62397	62402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016915	AG	3	6	65149	65154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016915	AT	3	6	72349	72354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016915	AT	3	6	73652	73657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016915	TA	4	8	83484	83491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016915	AT	4	8	86499	86506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016915	TA	3	6	86697	86702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016915	AT	3	6	87044	87049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016915	TA	3	6	87171	87176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016915	TC	3	6	87781	87786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016915	TA	3	6	88485	88490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016915	AT	3	6	95238	95243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016915	AT	3	6	95256	95261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016915	AT	3	6	95277	95282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016915	AT	3	6	95325	95330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016915	AT	3	6	97068	97073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016915	TA	3	6	103283	103288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016915	TC	3	6	106663	106668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016915	GT	3	6	106695	106700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016915	AT	4	8	106875	106882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016915	TA	3	6	107254	107259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016915	AT	3	6	113186	113191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016915	TA	3	6	114697	114702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016915	AT	3	6	114845	114850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016915	TA	3	6	121852	121857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016915	AT	3	6	121883	121888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016915	GT	3	6	124964	124969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016915	AT	3	6	125152	125157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016915	CT	3	6	130414	130419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016915	AT	3	6	131287	131292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016915	TA	3	6	131408	131413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016915	CG	3	6	148063	148068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016915	TA	3	6	151608	151613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016915	AT	3	6	151825	151830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016915	TA	3	6	152098	152103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016915	TA	3	6	152975	152980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016915	TA	3	6	153981	153986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016915	AT	3	6	154416	154421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016915	AT	3	6	154432	154437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016915	TA	3	6	154717	154722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016915	AT	3	6	154777	154782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016915	AT	3	6	156066	156071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016915	TA	3	6	156501	156506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016915	AT	3	6	156534	156539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016915	AT	3	6	163227	163232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016915	AT	3	6	163248	163253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016915	AT	4	8	163439	163446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016915	TA	3	6	165520	165525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016915	AT	4	8	165531	165538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016915	CT	3	6	170139	170144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016915	TA	4	8	173161	173168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016915	TA	4	8	173956	173963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016915	AG	3	6	174389	174394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016915	AG	3	6	177280	177285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016915	AT	3	6	179722	179727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016915	TC	3	6	180427	180432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016915	TA	3	6	181567	181572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016915	TA	3	6	186138	186143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016915	AT	5	10	194590	194599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016915	TA	3	6	195133	195138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016915	AT	3	6	206482	206487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016915	AT	3	6	207596	207601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016915	AT	3	6	210527	210532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016915	TA	3	6	210998	211003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016915	TA	3	6	211012	211017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016915	TC	4	8	212238	212245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016915	TG	3	6	222127	222132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016915	TA	3	6	225446	225451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016915	TA	3	6	225491	225496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016915	TA	3	6	225679	225684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016915	TA	3	6	225782	225787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016915	AT	3	6	227174	227179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016915	TA	3	6	227296	227301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016915	GA	3	6	229693	229698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016915	CT	3	6	230133	230138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016915	TA	3	6	231105	231110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016915	AT	3	6	232715	232720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016915	AT	3	6	233667	233672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016915	TA	3	6	233878	233883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016915	CA	3	6	236651	236656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016915	AT	3	6	250187	250192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016915	AG	3	6	250686	250691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016915	AG	3	6	251245	251250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016915	TA	3	6	254274	254279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016915	TA	3	6	254363	254368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016915	AT	3	6	255426	255431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016915	TA	4	8	255445	255452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016915	AG	3	6	257916	257921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016915	AT	3	6	258421	258426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016915	TA	3	6	258932	258937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016915	AG	4	8	259108	259115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016915	TA	3	6	259529	259534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016915	AT	3	6	259602	259607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016915	AT	3	6	260842	260847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016915	GA	3	6	261682	261687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016915	AT	3	6	262730	262735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016915	AG	3	6	264793	264798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016915	TA	4	8	269686	269693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016915	TA	4	8	269700	269707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016915	AT	3	6	272027	272032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016915	TC	3	6	275344	275349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016915	CT	3	6	275405	275410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016915	AT	3	6	275466	275471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016915	GA	3	6	276740	276745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016915	AT	3	6	276815	276820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016915	AT	3	6	277766	277771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016915	TA	3	6	277935	277940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016915	TC	3	6	281177	281182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016915	TA	3	6	281601	281606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016915	AT	3	6	281608	281613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016915	TA	3	6	282763	282768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016915	TG	3	6	282801	282806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016915	AT	3	6	282814	282819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016915	CT	3	6	286213	286218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016915	GA	3	6	287340	287345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016915	GC	3	6	287946	287951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016915	TG	3	6	288512	288517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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