MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016915	A	6	6	406081	406086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016915	T	7	7	406091	406097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016915	AAT	2	6	406112	406117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016915	ACA	2	6	406190	406195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_016915	ATG	2	6	406215	406220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016915	TTA	3	9	406498	406506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016915	TC	3	6	406544	406549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2509	NC_016915	TA	3	6	406625	406630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016915	GGC	2	6	406632	406637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_016915	TAA	2	6	406679	406684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_016915	ATATC	2	10	406699	406708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2513	NC_016915	AAT	2	6	406728	406733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_016915	TGT	2	6	407459	407464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_016915	GTT	2	6	407497	407502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016915	GTC	2	6	407515	407520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2518	NC_016915	CAC	2	6	407591	407596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_016915	GCT	2	6	407607	407612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2522	NC_016915	TA	3	6	410847	410852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016915	AAT	2	6	410867	410872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016915	TA	3	6	410924	410929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016915	ATA	2	6	410944	410949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_016915	AAACT	2	10	410967	410976	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2531	NC_016915	AGA	2	6	411115	411120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016915	TAT	2	6	411154	411159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_016915	CAA	2	6	411168	411173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2538	NC_016915	CAA	2	6	412605	412610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2541	NC_016915	TCT	2	6	412763	412768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_016915	GCA	2	6	412777	412782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_016915	TGTAA	2	10	412783	412792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_016915	TCA	2	6	413209	413214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2550	NC_016915	TTG	2	6	415272	415277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_016915	ATA	2	6	415312	415317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_016915	A	6	6	415371	415376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_016915	GCAA	2	8	417091	417098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2554	NC_016915	ATTTT	2	10	418226	418235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_016915	ATA	2	6	418238	418243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_016915	AAT	2	6	418257	418262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_016915	GGA	2	6	418316	418321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016915	GGA	2	6	418441	418446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016915	AATA	2	8	418535	418542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016915	A	6	6	420420	420425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016915	T	7	7	420441	420447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2563	NC_016915	T	6	6	420452	420457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016915	AAT	2	6	421842	421847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2567	NC_016915	TAA	2	6	421897	421902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_016915	ATT	2	6	422024	422029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_016915	TCT	2	6	422052	422057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2581	NC_016915	TCT	2	6	422314	422319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2589	NC_016915	ATTAT	2	10	426252	426261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_016915	A	6	6	426267	426272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_016915	TAG	2	6	426314	426319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_016915	CAA	2	6	426557	426562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_016915	T	6	6	426800	426805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_016915	CCCAT	2	10	427256	427265	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2602	NC_016915	GAT	2	6	427294	427299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2605	NC_016915	TTA	2	6	427411	427416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_016915	TAT	2	6	427481	427486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_016915	CTT	2	6	427523	427528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_016915	AGC	2	6	427557	427562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2611	NC_016915	ATTA	2	8	427940	427947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_016915	TTC	2	6	427948	427953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_016915	CTT	2	6	427978	427983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_016915	CTTT	2	8	428029	428036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_016915	T	6	6	428034	428039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_016915	TAAA	2	8	428053	428060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_016915	A	7	7	428066	428072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_016915	T	7	7	428109	428115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_016915	AAT	2	6	428116	428121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_016915	T	7	7	428128	428134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_016915	TAT	2	6	428160	428165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2624	NC_016915	ATA	2	6	428497	428502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_016915	T	7	7	428519	428525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_016915	ATT	2	6	428526	428531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2628	NC_016915	T	6	6	428688	428693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_016915	GAC	2	6	428702	428707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2631	NC_016915	AT	3	6	428735	428740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_016915	CTT	2	6	428749	428754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2634	NC_016915	ATTG	2	8	428794	428801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_016915	AT	3	6	428805	428810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_016915	TGA	2	6	428831	428836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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