MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016915	CTTA	2	8	262230	262237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_016915	TGC	2	6	262248	262253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016915	AT	3	6	262730	262735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016915	AAT	2	6	262782	262787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016915	AAG	2	6	262792	262797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016915	ATT	2	6	262886	262891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016915	TAG	2	6	262996	263001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016915	ATT	2	6	263005	263010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016915	AAT	2	6	263589	263594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016915	ATTAG	2	10	263624	263633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016915	AGA	2	6	263680	263685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016915	ATT	2	6	263711	263716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016915	ATT	2	6	263764	263769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016915	GAT	2	6	263785	263790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016915	TAA	2	6	263795	263800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016915	CTTTAA	2	12	263819	263830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1517	NC_016915	ATA	2	6	263831	263836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016915	CAA	2	6	263844	263849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016915	T	6	6	263854	263859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016915	GAA	3	9	263875	263883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016915	AAG	2	6	263954	263959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016915	AAATAA	2	12	263965	263976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016915	AAAATG	2	12	264031	264042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016915	AAT	2	6	264063	264068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016915	TAA	2	6	264110	264115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016915	ATA	2	6	264130	264135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016915	CAAA	2	8	264154	264161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_016915	AAAT	2	8	264172	264179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016915	TAA	2	6	264188	264193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016915	ATAG	2	8	264225	264232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016915	AGGAT	2	10	264594	264603	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016915	AG	3	6	264793	264798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016915	AAGGA	2	10	264815	264824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016915	AGA	2	6	264846	264851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016915	AAG	2	6	264926	264931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016915	TAG	2	6	265500	265505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016915	AAAT	2	8	265509	265516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016915	AAG	2	6	265574	265579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016915	AGG	2	6	265580	265585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016915	AGT	2	6	265590	265595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016915	AAGC	2	8	265619	265626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_016915	GCT	2	6	265651	265656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016915	ATTATA	2	12	266152	266163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016915	TTA	2	6	266175	266180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016915	ATC	2	6	266188	266193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016915	ATA	2	6	266433	266438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016915	A	6	6	266441	266446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016915	A	6	6	266670	266675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016915	A	6	6	266703	266708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016915	T	8	8	266724	266731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016915	T	6	6	266733	266738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016915	GCT	2	6	266761	266766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016915	ATA	2	6	266818	266823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016915	T	6	6	269301	269306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016915	TA	4	8	269686	269693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016915	TA	4	8	269700	269707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016915	T	6	6	272000	272005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016915	AT	3	6	272027	272032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016915	A	7	7	272041	272047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016915	ATC	2	6	272661	272666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_016915	AGC	2	6	272673	272678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016915	ATA	2	6	272705	272710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016915	ATGACG	2	12	272753	272764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_016915	ATA	2	6	274810	274815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016915	A	7	7	274830	274836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016915	TAAT	2	8	275152	275159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016915	AGG	2	6	275208	275213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016915	TCGC	2	8	275236	275243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_016915	ATG	2	6	275284	275289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016915	AAAAC	2	10	275320	275329	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_016915	ATTC	2	8	275338	275345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_016915	TC	3	6	275344	275349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_016915	CT	3	6	275405	275410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_016915	TAA	2	6	275435	275440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016915	AT	3	6	275466	275471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016915	TAAA	2	8	275483	275490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016915	ATT	2	6	275518	275523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016915	T	6	6	275576	275581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016915	AGT	2	6	275717	275722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016915	TAA	2	6	275827	275832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016915	AAT	2	6	275922	275927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016915	GAA	2	6	275979	275984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016915	CTA	2	6	276034	276039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016915	ACT	2	6	276042	276047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016915	A	6	6	276676	276681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016915	TTA	2	6	276699	276704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016915	GA	3	6	276740	276745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016915	ATTGCA	2	12	276779	276790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1589	NC_016915	A	6	6	276802	276807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016915	AT	3	6	276815	276820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016915	TGA	2	6	276826	276831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016915	CAA	2	6	276834	276839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_016915	TAC	2	6	276904	276909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016915	TAT	2	6	276937	276942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016915	TGC	2	6	277224	277229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_016915	A	7	7	277263	277269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016915	A	6	6	277312	277317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016915	TAT	2	6	277387	277392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016915	TAG	2	6	277436	277441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016915	TAT	2	6	277483	277488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016915	ACC	2	6	277521	277526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_016915	GGT	2	6	277543	277548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016915	AGC	2	6	277726	277731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016915	AAT	2	6	277756	277761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016915	AT	3	6	277766	277771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016915	GTC	2	6	277823	277828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016915	TTG	2	6	277849	277854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016915	A	6	6	277897	277902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016915	TA	3	6	277935	277940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016915	A	6	6	277949	277954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016915	CAA	2	6	277995	278000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016915	GAAA	2	8	278030	278037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016915	TAT	2	6	278040	278045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016915	TAT	2	6	278051	278056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016915	TCA	2	6	280894	280899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_016915	GAG	2	6	280904	280909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016915	TTG	2	6	280913	280918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016915	CAA	2	6	280991	280996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016915	AGC	2	6	281006	281011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_016915	ATA	2	6	281038	281043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016915	TTA	2	6	281097	281102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016915	C	7	7	281128	281134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1623	NC_016915	A	9	9	281135	281143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016915	TC	3	6	281177	281182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_016915	TAA	2	6	281185	281190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016915	T	7	7	281231	281237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016915	ACT	2	6	281238	281243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_016915	TCTT	2	8	281278	281285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_016915	ATT	2	6	281316	281321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016915	TAT	2	6	281365	281370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016915	TCTA	2	8	281437	281444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_016915	ATT	2	6	281458	281463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016915	ATT	2	6	281474	281479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016915	TGT	2	6	281500	281505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016915	T	6	6	281535	281540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_016915	TGTT	2	8	281568	281575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_016915	TTA	2	6	346029	346034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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