MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016915	AGC	2	6	178308	178313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016915	ATA	2	6	178341	178346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016915	A	6	6	178346	178351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016915	T	7	7	178368	178374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016915	TTGT	2	8	178380	178387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016915	ATG	2	6	178412	178417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016915	GTA	2	6	179667	179672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016915	TAA	3	9	179676	179684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016915	A	7	7	179683	179689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016915	AT	3	6	179722	179727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016915	TAT	2	6	179735	179740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016915	TAA	2	6	180328	180333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016915	T	6	6	180336	180341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016915	ATT	2	6	180349	180354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016915	A	6	6	180363	180368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016915	TTAA	2	8	180396	180403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016915	GTA	2	6	180420	180425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016915	TC	3	6	180427	180432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_016915	A	7	7	180438	180444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016915	A	6	6	180454	180459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016915	ATT	2	6	180881	180886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016915	TAA	2	6	180915	180920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016915	TTG	2	6	180926	180931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016915	GTT	3	9	180937	180945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016915	TCAA	2	8	180970	180977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_016915	AAC	2	6	180979	180984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016915	T	7	7	180999	181005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016915	CTT	2	6	181060	181065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016915	AAG	2	6	181122	181127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016915	T	7	7	181152	181158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016915	AAT	2	6	181201	181206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016915	ATT	2	6	181239	181244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016915	A	7	7	181328	181334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016915	TAT	2	6	181335	181340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016915	CAA	2	6	181350	181355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016915	AAATC	2	10	181367	181376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_016915	TTTAA	2	10	181435	181444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016915	TATTT	2	10	181473	181482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016915	ATAA	2	8	181550	181557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016915	TA	3	6	181567	181572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016915	ATT	2	6	181606	181611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016915	TAA	2	6	181639	181644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016915	GAGAG	2	10	181652	181661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016915	TTA	2	6	181663	181668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016915	A	7	7	181676	181682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016915	TGA	2	6	181685	181690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016915	ATT	2	6	181719	181724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016915	TCAG	2	8	181775	181782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_016915	A	6	6	185937	185942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016915	T	6	6	185947	185952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016915	GAG	2	6	186059	186064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016915	TA	3	6	186138	186143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016915	GTC	2	6	190322	190327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_016915	A	6	6	190432	190437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016915	ATA	2	6	190485	190490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016915	GGT	2	6	190547	190552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016915	CTAG	2	8	190573	190580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_016915	TAC	2	6	190603	190608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016915	ATT	2	6	190611	190616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016915	A	7	7	190620	190626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016915	A	6	6	190633	190638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016915	ATT	2	6	191877	191882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016915	A	6	6	191915	191920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016915	ATAA	2	8	191996	192003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016915	ATA	2	6	192022	192027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016915	GTC	2	6	193581	193586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016915	AGC	2	6	193593	193598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016915	TTAC	2	8	193648	193655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_016915	A	6	6	193677	193682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016915	AT	5	10	194590	194599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016915	AAGAG	2	10	194628	194637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016915	TA	3	6	195133	195138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016915	TAA	2	6	195153	195158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016915	TGT	2	6	196989	196994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016915	ATG	2	6	197000	197005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016915	A	7	7	197102	197108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016915	CAA	2	6	197248	197253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016915	GTT	2	6	199411	199416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016915	TCA	2	6	199433	199438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016915	T	7	7	199499	199505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016915	ATT	2	6	199506	199511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016915	T	6	6	199510	199515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016915	ATG	2	6	199548	199553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016915	A	6	6	199703	199708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016915	ATA	2	6	200492	200497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_016915	TAA	2	6	201276	201281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016915	AGTA	2	8	201288	201295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016915	TTA	2	6	201379	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016915	ACG	2	6	201386	201391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016915	ATTG	2	8	201432	201439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016915	T	6	6	201454	201459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016915	TAA	2	6	201469	201474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016915	A	6	6	201505	201510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016915	GCA	2	6	201522	201527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_016915	A	6	6	201527	201532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016915	AAT	2	6	202735	202740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016915	TTG	2	6	202787	202792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016915	GTA	2	6	202828	202833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016915	CAA	2	6	202917	202922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016915	GCT	2	6	202931	202936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_016915	TAT	2	6	206235	206240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016915	GTC	2	6	206302	206307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_016915	TTTAT	2	10	206382	206391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016915	A	6	6	206398	206403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016915	T	6	6	206416	206421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016915	TTA	2	6	206433	206438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016915	ACC	2	6	206444	206449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_016915	CTTT	2	8	206455	206462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_016915	T	7	7	206460	206466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016915	T	6	6	206468	206473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016915	AT	3	6	206482	206487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016915	TTG	2	6	206752	206757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016915	TTG	2	6	206808	206813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016915	CTG	2	6	206829	206834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016915	ATT	2	6	206875	206880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016915	T	6	6	206885	206890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016915	CAA	2	6	206953	206958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_016915	ATG	2	6	206971	206976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016915	CAA	2	6	206991	206996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_016915	TTTA	2	8	207585	207592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016915	AT	3	6	207596	207601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016915	A	6	6	207725	207730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016915	T	6	6	207746	207751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016915	ATT	2	6	207752	207757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016915	GCT	2	6	207784	207789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_016915	CAA	2	6	207814	207819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_016915	ACA	2	6	207849	207854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016915	TAAAT	2	10	210501	210510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016915	TAA	2	6	210516	210521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016915	AT	3	6	210527	210532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016915	TAAAA	2	10	210536	210545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016915	A	6	6	210542	210547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016915	TATT	2	8	210579	210586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016915	ATA	2	6	210607	210612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016915	TATTTA	2	12	210627	210638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016915	ATA	2	6	210643	210648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016915	TGAT	2	8	210655	210662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1144	NC_016915	TA	3	6	211012	211017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_016915	T	6	6	212313	212318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_016915	TCATTA	2	12	212340	212351	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1275	NC_016915	T	6	6	231320	231325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_016915	ATA	2	6	259916	259921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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